Protein–RNA interactions for Protein: Q9D706

Rpap3, RNA polymerase II-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpap3Q9D706 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rpap3Q9D706 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rpap3Q9D706 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rpap3Q9D706 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rpap3Q9D706 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rpap3Q9D706 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rpap3Q9D706 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rpap3Q9D706 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rpap3Q9D706 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rpap3Q9D706 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rpap3Q9D706 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rpap3Q9D706 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rpap3Q9D706 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rpap3Q9D706 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rpap3Q9D706 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rpap3Q9D706 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rpap3Q9D706 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rpap3Q9D706 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rpap3Q9D706 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rpap3Q9D706 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rpap3Q9D706 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rpap3Q9D706 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rpap3Q9D706 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rpap3Q9D706 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rpap3Q9D706 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rpap3Q9D706 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rpap3Q9D706 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Rpap3Q9D706 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rpap3Q9D706 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rpap3Q9D706 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Rpap3Q9D706 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rpap3Q9D706 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rpap3Q9D706 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rpap3Q9D706 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rpap3Q9D706 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rpap3Q9D706 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Rpap3Q9D706 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rpap3Q9D706 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rpap3Q9D706 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Rpap3Q9D706 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rpap3Q9D706 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rpap3Q9D706 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rpap3Q9D706 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rpap3Q9D706 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rpap3Q9D706 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Rpap3Q9D706 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Rpap3Q9D706 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rpap3Q9D706 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rpap3Q9D706 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rpap3Q9D706 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rpap3Q9D706 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Rpap3Q9D706 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rpap3Q9D706 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Rpap3Q9D706 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rpap3Q9D706 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Rpap3Q9D706 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rpap3Q9D706 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rpap3Q9D706 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rpap3Q9D706 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rpap3Q9D706 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rpap3Q9D706 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rpap3Q9D706 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rpap3Q9D706 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Rpap3Q9D706 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rpap3Q9D706 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rpap3Q9D706 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rpap3Q9D706 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rpap3Q9D706 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rpap3Q9D706 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rpap3Q9D706 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rpap3Q9D706 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rpap3Q9D706 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rpap3Q9D706 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rpap3Q9D706 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rpap3Q9D706 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Rpap3Q9D706 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rpap3Q9D706 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rpap3Q9D706 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rpap3Q9D706 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rpap3Q9D706 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rpap3Q9D706 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Rpap3Q9D706 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rpap3Q9D706 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rpap3Q9D706 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rpap3Q9D706 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rpap3Q9D706 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rpap3Q9D706 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rpap3Q9D706 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rpap3Q9D706 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rpap3Q9D706 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rpap3Q9D706 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rpap3Q9D706 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rpap3Q9D706 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rpap3Q9D706 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rpap3Q9D706 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rpap3Q9D706 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rpap3Q9D706 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rpap3Q9D706 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rpap3Q9D706 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rpap3Q9D706 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms