Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C1

Lmntd1, Lamin tail domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmntd1Q9D4C1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22,46■■□□□ 1,19
Lmntd1Q9D4C1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22,46■■□□□ 1,19
Lmntd1Q9D4C1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22,45■■□□□ 1,18
Lmntd1Q9D4C1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,44■■□□□ 1,18
Lmntd1Q9D4C1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,44■■□□□ 1,18
Lmntd1Q9D4C1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22,43■■□□□ 1,18
Lmntd1Q9D4C1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22,43■■□□□ 1,18
Lmntd1Q9D4C1 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,42■■□□□ 1,18
Lmntd1Q9D4C1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22,42■■□□□ 1,18
Lmntd1Q9D4C1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22,41■■□□□ 1,18
Lmntd1Q9D4C1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,4■■□□□ 1,18
Lmntd1Q9D4C1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22,4■■□□□ 1,18
Lmntd1Q9D4C1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22,4■■□□□ 1,18
Lmntd1Q9D4C1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22,4■■□□□ 1,18
Lmntd1Q9D4C1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22,4■■□□□ 1,18
Lmntd1Q9D4C1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,39■■□□□ 1,17
Lmntd1Q9D4C1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22,38■■□□□ 1,17
Lmntd1Q9D4C1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,38■■□□□ 1,17
Lmntd1Q9D4C1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22,38■■□□□ 1,17
Lmntd1Q9D4C1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,37■■□□□ 1,17
Lmntd1Q9D4C1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22,36■■□□□ 1,17
Lmntd1Q9D4C1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22,36■■□□□ 1,17
Lmntd1Q9D4C1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,35■■□□□ 1,17
Lmntd1Q9D4C1 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,34■■□□□ 1,17
Lmntd1Q9D4C1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22,33■■□□□ 1,17
Lmntd1Q9D4C1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,33■■□□□ 1,17
Lmntd1Q9D4C1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22,32■■□□□ 1,16
Lmntd1Q9D4C1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,31■■□□□ 1,16
Lmntd1Q9D4C1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,31■■□□□ 1,16
Lmntd1Q9D4C1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22,31■■□□□ 1,16
Lmntd1Q9D4C1 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22,3■■□□□ 1,16
Lmntd1Q9D4C1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22,3■■□□□ 1,16
Lmntd1Q9D4C1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22,3■■□□□ 1,16
Lmntd1Q9D4C1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,3■■□□□ 1,16
Lmntd1Q9D4C1 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22,3■■□□□ 1,16
Lmntd1Q9D4C1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22,29■■□□□ 1,16
Lmntd1Q9D4C1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,29■■□□□ 1,16
Lmntd1Q9D4C1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22,28■■□□□ 1,16
Lmntd1Q9D4C1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,28■■□□□ 1,16
Lmntd1Q9D4C1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,27■■□□□ 1,16
Lmntd1Q9D4C1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,27■■□□□ 1,16
Lmntd1Q9D4C1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22,26■■□□□ 1,15
Lmntd1Q9D4C1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,26■■□□□ 1,15
Lmntd1Q9D4C1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22,26■■□□□ 1,15
Lmntd1Q9D4C1 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22,25■■□□□ 1,15
Lmntd1Q9D4C1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,24■■□□□ 1,15
Lmntd1Q9D4C1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,24■■□□□ 1,15
Lmntd1Q9D4C1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22,24■■□□□ 1,15
Lmntd1Q9D4C1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22,24■■□□□ 1,15
Lmntd1Q9D4C1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,24■■□□□ 1,15
Lmntd1Q9D4C1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22,23■■□□□ 1,15
Lmntd1Q9D4C1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22,22■■□□□ 1,15
Lmntd1Q9D4C1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22,22■■□□□ 1,15
Lmntd1Q9D4C1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,22■■□□□ 1,15
Lmntd1Q9D4C1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,21■■□□□ 1,15
Lmntd1Q9D4C1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,2■■□□□ 1,15
Lmntd1Q9D4C1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,2■■□□□ 1,14
Lmntd1Q9D4C1 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22,2■■□□□ 1,14
Lmntd1Q9D4C1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22,19■■□□□ 1,14
Lmntd1Q9D4C1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,19■■□□□ 1,14
Lmntd1Q9D4C1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22,17■■□□□ 1,14
Lmntd1Q9D4C1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22,17■■□□□ 1,14
Lmntd1Q9D4C1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22,17■■□□□ 1,14
Lmntd1Q9D4C1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,17■■□□□ 1,14
Lmntd1Q9D4C1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,15■■□□□ 1,14
Lmntd1Q9D4C1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22,14■■□□□ 1,13
Lmntd1Q9D4C1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22,14■■□□□ 1,13
Lmntd1Q9D4C1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,14■■□□□ 1,13
Lmntd1Q9D4C1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,13■■□□□ 1,13
Lmntd1Q9D4C1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22,13■■□□□ 1,13
Lmntd1Q9D4C1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22,11■■□□□ 1,13
Lmntd1Q9D4C1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22,11■■□□□ 1,13
Lmntd1Q9D4C1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22,11■■□□□ 1,13
Lmntd1Q9D4C1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22,11■■□□□ 1,13
Lmntd1Q9D4C1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,1■■□□□ 1,13
Lmntd1Q9D4C1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22,1■■□□□ 1,13
Lmntd1Q9D4C1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,1■■□□□ 1,13
Lmntd1Q9D4C1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22,08■■□□□ 1,13
Lmntd1Q9D4C1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22,07■■□□□ 1,12
Lmntd1Q9D4C1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22,06■■□□□ 1,12
Lmntd1Q9D4C1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,06■■□□□ 1,12
Lmntd1Q9D4C1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22,06■■□□□ 1,12
Lmntd1Q9D4C1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22,05■■□□□ 1,12
Lmntd1Q9D4C1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,05■■□□□ 1,12
Lmntd1Q9D4C1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,05■■□□□ 1,12
Lmntd1Q9D4C1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22,05■■□□□ 1,12
Lmntd1Q9D4C1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22,04■■□□□ 1,12
Lmntd1Q9D4C1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22,04■■□□□ 1,12
Lmntd1Q9D4C1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,03■■□□□ 1,12
Lmntd1Q9D4C1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22,03■■□□□ 1,12
Lmntd1Q9D4C1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22,02■■□□□ 1,12
Lmntd1Q9D4C1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22,02■■□□□ 1,12
Lmntd1Q9D4C1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,02■■□□□ 1,12
Lmntd1Q9D4C1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1,11
Lmntd1Q9D4C1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1,11
Lmntd1Q9D4C1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,99■■□□□ 1,11
Lmntd1Q9D4C1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21,98■■□□□ 1,11
Lmntd1Q9D4C1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21,97■■□□□ 1,11
Lmntd1Q9D4C1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,97■■□□□ 1,11
Lmntd1Q9D4C1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,96■■□□□ 1,11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8,3 ms