Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXD9

Lrrc17, Leucine-rich repeat-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc17Q9CXD9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,8■■□□□ 1,72
Lrrc17Q9CXD9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25,8■■□□□ 1,72
Lrrc17Q9CXD9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,79■■□□□ 1,72
Lrrc17Q9CXD9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25,79■■□□□ 1,72
Lrrc17Q9CXD9 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,78■■□□□ 1,72
Lrrc17Q9CXD9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25,78■■□□□ 1,72
Lrrc17Q9CXD9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,78■■□□□ 1,72
Lrrc17Q9CXD9 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,77■■□□□ 1,72
Lrrc17Q9CXD9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,76■■□□□ 1,71
Lrrc17Q9CXD9 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25,76■■□□□ 1,71
Lrrc17Q9CXD9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25,76■■□□□ 1,71
Lrrc17Q9CXD9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,75■■□□□ 1,71
Lrrc17Q9CXD9 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,75■■□□□ 1,71
Lrrc17Q9CXD9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,74■■□□□ 1,71
Lrrc17Q9CXD9 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,74■■□□□ 1,71
Lrrc17Q9CXD9 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25,73■■□□□ 1,71
Lrrc17Q9CXD9 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25,72■■□□□ 1,71
Lrrc17Q9CXD9 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,72■■□□□ 1,71
Lrrc17Q9CXD9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,71■■□□□ 1,71
Lrrc17Q9CXD9 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25,7■■□□□ 1,71
Lrrc17Q9CXD9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25,7■■□□□ 1,7
Lrrc17Q9CXD9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25,68■■□□□ 1,7
Lrrc17Q9CXD9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25,67■■□□□ 1,7
Lrrc17Q9CXD9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25,66■■□□□ 1,7
Lrrc17Q9CXD9 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25,65■■□□□ 1,7
Lrrc17Q9CXD9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25,64■■□□□ 1,7
Lrrc17Q9CXD9 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,64■■□□□ 1,69
Lrrc17Q9CXD9 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
Lrrc17Q9CXD9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
Lrrc17Q9CXD9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,61■■□□□ 1,69
Lrrc17Q9CXD9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
Lrrc17Q9CXD9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,6■■□□□ 1,69
Lrrc17Q9CXD9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
Lrrc17Q9CXD9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
Lrrc17Q9CXD9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
Lrrc17Q9CXD9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,58■■□□□ 1,69
Lrrc17Q9CXD9 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25,57■■□□□ 1,68
Lrrc17Q9CXD9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25,57■■□□□ 1,68
Lrrc17Q9CXD9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25,55■■□□□ 1,68
Lrrc17Q9CXD9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,55■■□□□ 1,68
Lrrc17Q9CXD9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,55■■□□□ 1,68
Lrrc17Q9CXD9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,54■■□□□ 1,68
Lrrc17Q9CXD9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,54■■□□□ 1,68
Lrrc17Q9CXD9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,54■■□□□ 1,68
Lrrc17Q9CXD9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,54■■□□□ 1,68
Lrrc17Q9CXD9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Lrrc17Q9CXD9 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25,53■■□□□ 1,68
Lrrc17Q9CXD9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Lrrc17Q9CXD9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
Lrrc17Q9CXD9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25,51■■□□□ 1,67
Lrrc17Q9CXD9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
Lrrc17Q9CXD9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
Lrrc17Q9CXD9 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,5■■□□□ 1,67
Lrrc17Q9CXD9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25,5■■□□□ 1,67
Lrrc17Q9CXD9 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25,49■■□□□ 1,67
Lrrc17Q9CXD9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,49■■□□□ 1,67
Lrrc17Q9CXD9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25,48■■□□□ 1,67
Lrrc17Q9CXD9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25,47■■□□□ 1,67
Lrrc17Q9CXD9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Lrrc17Q9CXD9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25,45■■□□□ 1,66
Lrrc17Q9CXD9 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
Lrrc17Q9CXD9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
Lrrc17Q9CXD9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
Lrrc17Q9CXD9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
Lrrc17Q9CXD9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25,43■■□□□ 1,66
Lrrc17Q9CXD9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
Lrrc17Q9CXD9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Lrrc17Q9CXD9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Lrrc17Q9CXD9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Lrrc17Q9CXD9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Lrrc17Q9CXD9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25,39■■□□□ 1,66
Lrrc17Q9CXD9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,66
Lrrc17Q9CXD9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25,39■■□□□ 1,66
Lrrc17Q9CXD9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,66
Lrrc17Q9CXD9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,65
Lrrc17Q9CXD9 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25,38■■□□□ 1,65
Lrrc17Q9CXD9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
Lrrc17Q9CXD9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,37■■□□□ 1,65
Lrrc17Q9CXD9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,36■■□□□ 1,65
Lrrc17Q9CXD9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
Lrrc17Q9CXD9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25,35■■□□□ 1,65
Lrrc17Q9CXD9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25,35■■□□□ 1,65
Lrrc17Q9CXD9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
Lrrc17Q9CXD9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
Lrrc17Q9CXD9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
Lrrc17Q9CXD9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,65
Lrrc17Q9CXD9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,32■■□□□ 1,64
Lrrc17Q9CXD9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
Lrrc17Q9CXD9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
Lrrc17Q9CXD9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
Lrrc17Q9CXD9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,3■■□□□ 1,64
Lrrc17Q9CXD9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
Lrrc17Q9CXD9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25,29■■□□□ 1,64
Lrrc17Q9CXD9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25,28■■□□□ 1,64
Lrrc17Q9CXD9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
Lrrc17Q9CXD9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25,26■■□□□ 1,63
Lrrc17Q9CXD9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
Lrrc17Q9CXD9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
Lrrc17Q9CXD9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,24■■□□□ 1,63
Lrrc17Q9CXD9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25,24■■□□□ 1,63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27,1 ms