Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR26

Vta1, Vacuolar protein sorting-associated protein VTA1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vta1Q9CR26 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Vta1Q9CR26 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Vta1Q9CR26 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Vta1Q9CR26 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Vta1Q9CR26 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Vta1Q9CR26 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Vta1Q9CR26 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Vta1Q9CR26 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Vta1Q9CR26 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Vta1Q9CR26 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Vta1Q9CR26 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Vta1Q9CR26 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Vta1Q9CR26 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Vta1Q9CR26 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Vta1Q9CR26 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Vta1Q9CR26 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Vta1Q9CR26 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Vta1Q9CR26 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Vta1Q9CR26 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Vta1Q9CR26 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Vta1Q9CR26 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Vta1Q9CR26 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Vta1Q9CR26 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Vta1Q9CR26 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Vta1Q9CR26 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Vta1Q9CR26 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Vta1Q9CR26 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Vta1Q9CR26 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Vta1Q9CR26 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Vta1Q9CR26 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Vta1Q9CR26 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Vta1Q9CR26 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Vta1Q9CR26 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Vta1Q9CR26 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Vta1Q9CR26 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Vta1Q9CR26 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Vta1Q9CR26 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Vta1Q9CR26 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Vta1Q9CR26 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Vta1Q9CR26 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Vta1Q9CR26 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Vta1Q9CR26 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Vta1Q9CR26 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Vta1Q9CR26 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Vta1Q9CR26 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Vta1Q9CR26 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Vta1Q9CR26 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Vta1Q9CR26 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Vta1Q9CR26 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Vta1Q9CR26 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Vta1Q9CR26 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Vta1Q9CR26 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Vta1Q9CR26 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Vta1Q9CR26 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Vta1Q9CR26 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Vta1Q9CR26 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Vta1Q9CR26 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Vta1Q9CR26 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Vta1Q9CR26 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Vta1Q9CR26 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Vta1Q9CR26 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Vta1Q9CR26 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Vta1Q9CR26 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Vta1Q9CR26 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Vta1Q9CR26 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Vta1Q9CR26 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Vta1Q9CR26 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Vta1Q9CR26 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Vta1Q9CR26 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Vta1Q9CR26 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Vta1Q9CR26 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Vta1Q9CR26 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Vta1Q9CR26 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Vta1Q9CR26 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Vta1Q9CR26 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Vta1Q9CR26 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Vta1Q9CR26 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Vta1Q9CR26 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Vta1Q9CR26 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Vta1Q9CR26 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Vta1Q9CR26 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Vta1Q9CR26 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Vta1Q9CR26 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Vta1Q9CR26 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Vta1Q9CR26 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Vta1Q9CR26 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Vta1Q9CR26 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Vta1Q9CR26 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Vta1Q9CR26 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Vta1Q9CR26 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Vta1Q9CR26 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Vta1Q9CR26 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Vta1Q9CR26 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Vta1Q9CR26 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Vta1Q9CR26 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Vta1Q9CR26 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Vta1Q9CR26 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Vta1Q9CR26 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Vta1Q9CR26 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Vta1Q9CR26 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms