Protein–RNA interactions for Protein: Q99P88

Nup155, Nuclear pore complex protein Nup155, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup155Q99P88 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Nup155Q99P88 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Nup155Q99P88 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC36.79■■■■□ 3.48
Nup155Q99P88 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
Nup155Q99P88 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Nup155Q99P88 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Nup155Q99P88 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Nup155Q99P88 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Nup155Q99P88 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
Nup155Q99P88 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC36.78■■■■□ 3.48
Nup155Q99P88 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Nup155Q99P88 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Nup155Q99P88 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Nup155Q99P88 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC36.75■■■■□ 3.47
Nup155Q99P88 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Nup155Q99P88 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Nup155Q99P88 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC36.74■■■■□ 3.47
Nup155Q99P88 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
Nup155Q99P88 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
Nup155Q99P88 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
Nup155Q99P88 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
Nup155Q99P88 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Nup155Q99P88 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Nup155Q99P88 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
Nup155Q99P88 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC36.67■■■■□ 3.46
Nup155Q99P88 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Nup155Q99P88 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Nup155Q99P88 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
Nup155Q99P88 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Nup155Q99P88 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Nup155Q99P88 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
Nup155Q99P88 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Nup155Q99P88 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Nup155Q99P88 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Nup155Q99P88 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Nup155Q99P88 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
Nup155Q99P88 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
Nup155Q99P88 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Nup155Q99P88 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Nup155Q99P88 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Nup155Q99P88 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
Nup155Q99P88 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
Nup155Q99P88 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Nup155Q99P88 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Nup155Q99P88 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Nup155Q99P88 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Nup155Q99P88 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Nup155Q99P88 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC36.45■■■■□ 3.43
Nup155Q99P88 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Nup155Q99P88 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Nup155Q99P88 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Nup155Q99P88 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC36.43■■■■□ 3.42
Nup155Q99P88 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
Nup155Q99P88 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
Nup155Q99P88 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Nup155Q99P88 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Nup155Q99P88 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Nup155Q99P88 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Nup155Q99P88 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Nup155Q99P88 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
Nup155Q99P88 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Nup155Q99P88 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Nup155Q99P88 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
Nup155Q99P88 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
Nup155Q99P88 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Nup155Q99P88 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Nup155Q99P88 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.35■■■■□ 3.41
Nup155Q99P88 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
Nup155Q99P88 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
Nup155Q99P88 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
Nup155Q99P88 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Nup155Q99P88 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Nup155Q99P88 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
Nup155Q99P88 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Nup155Q99P88 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
Nup155Q99P88 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Nup155Q99P88 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
Nup155Q99P88 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Nup155Q99P88 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Nup155Q99P88 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Nup155Q99P88 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Nup155Q99P88 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
Nup155Q99P88 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Nup155Q99P88 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Nup155Q99P88 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
Nup155Q99P88 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Nup155Q99P88 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Nup155Q99P88 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
Nup155Q99P88 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Nup155Q99P88 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Nup155Q99P88 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Nup155Q99P88 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
Nup155Q99P88 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Nup155Q99P88 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC36.08■■■■□ 3.37
Nup155Q99P88 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Nup155Q99P88 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Nup155Q99P88 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Nup155Q99P88 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
Nup155Q99P88 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Nup155Q99P88 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms