Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Pagr1aQ99L02 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Pagr1aQ99L02 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Pagr1aQ99L02 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Pagr1aQ99L02 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Pagr1aQ99L02 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Pagr1aQ99L02 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Pagr1aQ99L02 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Pagr1aQ99L02 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Pagr1aQ99L02 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Pagr1aQ99L02 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Pagr1aQ99L02 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Pagr1aQ99L02 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Pagr1aQ99L02 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Pagr1aQ99L02 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Pagr1aQ99L02 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Pagr1aQ99L02 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Pagr1aQ99L02 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Pagr1aQ99L02 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Pagr1aQ99L02 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Pagr1aQ99L02 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Pagr1aQ99L02 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Pagr1aQ99L02 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Pagr1aQ99L02 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Pagr1aQ99L02 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Pagr1aQ99L02 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Pagr1aQ99L02 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Pagr1aQ99L02 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Pagr1aQ99L02 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Pagr1aQ99L02 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Pagr1aQ99L02 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Pagr1aQ99L02 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Pagr1aQ99L02 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Pagr1aQ99L02 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Pagr1aQ99L02 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Pagr1aQ99L02 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Pagr1aQ99L02 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Pagr1aQ99L02 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Pagr1aQ99L02 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Pagr1aQ99L02 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Pagr1aQ99L02 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Pagr1aQ99L02 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Pagr1aQ99L02 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Pagr1aQ99L02 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Pagr1aQ99L02 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Pagr1aQ99L02 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Pagr1aQ99L02 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Pagr1aQ99L02 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Pagr1aQ99L02 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Pagr1aQ99L02 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Pagr1aQ99L02 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Pagr1aQ99L02 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Pagr1aQ99L02 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Pagr1aQ99L02 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Pagr1aQ99L02 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Pagr1aQ99L02 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Pagr1aQ99L02 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Pagr1aQ99L02 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Pagr1aQ99L02 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Pagr1aQ99L02 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Pagr1aQ99L02 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Pagr1aQ99L02 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Pagr1aQ99L02 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Pagr1aQ99L02 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Pagr1aQ99L02 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Pagr1aQ99L02 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Pagr1aQ99L02 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Pagr1aQ99L02 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Pagr1aQ99L02 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Pagr1aQ99L02 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Pagr1aQ99L02 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Pagr1aQ99L02 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Pagr1aQ99L02 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Pagr1aQ99L02 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Pagr1aQ99L02 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Pagr1aQ99L02 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Pagr1aQ99L02 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Pagr1aQ99L02 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Pagr1aQ99L02 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Pagr1aQ99L02 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Pagr1aQ99L02 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Pagr1aQ99L02 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Pagr1aQ99L02 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Pagr1aQ99L02 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Pagr1aQ99L02 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Pagr1aQ99L02 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Pagr1aQ99L02 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Pagr1aQ99L02 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Pagr1aQ99L02 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Pagr1aQ99L02 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Pagr1aQ99L02 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Pagr1aQ99L02 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Pagr1aQ99L02 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Pagr1aQ99L02 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Pagr1aQ99L02 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Pagr1aQ99L02 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Pagr1aQ99L02 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Pagr1aQ99L02 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Pagr1aQ99L02 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Pagr1aQ99L02 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms