Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
SYNGAP1Q96PV0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
SYNGAP1Q96PV0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
SYNGAP1Q96PV0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC30.61■■■□□ 2.49
SYNGAP1Q96PV0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
SYNGAP1Q96PV0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
SYNGAP1Q96PV0 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
SYNGAP1Q96PV0 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
SYNGAP1Q96PV0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC30.59■■■□□ 2.49
SYNGAP1Q96PV0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
SYNGAP1Q96PV0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
SYNGAP1Q96PV0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
SYNGAP1Q96PV0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
SYNGAP1Q96PV0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
SYNGAP1Q96PV0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
SYNGAP1Q96PV0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
SYNGAP1Q96PV0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
SYNGAP1Q96PV0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
SYNGAP1Q96PV0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
SYNGAP1Q96PV0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SYNGAP1Q96PV0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SYNGAP1Q96PV0 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SYNGAP1Q96PV0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SYNGAP1Q96PV0 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SYNGAP1Q96PV0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SYNGAP1Q96PV0 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
SYNGAP1Q96PV0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SYNGAP1Q96PV0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SYNGAP1Q96PV0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
SYNGAP1Q96PV0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.48
SYNGAP1Q96PV0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SYNGAP1Q96PV0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SYNGAP1Q96PV0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SYNGAP1Q96PV0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SYNGAP1Q96PV0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SYNGAP1Q96PV0 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SYNGAP1Q96PV0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SYNGAP1Q96PV0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SYNGAP1Q96PV0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
SYNGAP1Q96PV0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
SYNGAP1Q96PV0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
SYNGAP1Q96PV0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
SYNGAP1Q96PV0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
SYNGAP1Q96PV0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
SYNGAP1Q96PV0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
SYNGAP1Q96PV0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
SYNGAP1Q96PV0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SYNGAP1Q96PV0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SYNGAP1Q96PV0 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SYNGAP1Q96PV0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
SYNGAP1Q96PV0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SYNGAP1Q96PV0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SYNGAP1Q96PV0 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
SYNGAP1Q96PV0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SYNGAP1Q96PV0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
SYNGAP1Q96PV0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
SYNGAP1Q96PV0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SYNGAP1Q96PV0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
SYNGAP1Q96PV0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
SYNGAP1Q96PV0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
SYNGAP1Q96PV0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.34■■■□□ 2.45
SYNGAP1Q96PV0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
SYNGAP1Q96PV0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
SYNGAP1Q96PV0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
SYNGAP1Q96PV0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
SYNGAP1Q96PV0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SYNGAP1Q96PV0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
SYNGAP1Q96PV0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC30.3■■■□□ 2.44
SYNGAP1Q96PV0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
SYNGAP1Q96PV0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
SYNGAP1Q96PV0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC30.28■■■□□ 2.44
SYNGAP1Q96PV0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
SYNGAP1Q96PV0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
SYNGAP1Q96PV0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
SYNGAP1Q96PV0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
SYNGAP1Q96PV0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SYNGAP1Q96PV0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
SYNGAP1Q96PV0 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SYNGAP1Q96PV0 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
SYNGAP1Q96PV0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.44
SYNGAP1Q96PV0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
SYNGAP1Q96PV0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
SYNGAP1Q96PV0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
SYNGAP1Q96PV0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SYNGAP1Q96PV0 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SYNGAP1Q96PV0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
SYNGAP1Q96PV0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
SYNGAP1Q96PV0 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC30.23■■■□□ 2.43
SYNGAP1Q96PV0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SYNGAP1Q96PV0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SYNGAP1Q96PV0 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SYNGAP1Q96PV0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SYNGAP1Q96PV0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SYNGAP1Q96PV0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SYNGAP1Q96PV0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
SYNGAP1Q96PV0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.42
SYNGAP1Q96PV0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SYNGAP1Q96PV0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SYNGAP1Q96PV0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SYNGAP1Q96PV0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms