Protein–RNA interactions for Protein: Q920R0

Als2, Alsin, mousemouse

Predictions only

Length 1,651 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Als2Q920R0 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC34,65■■■■□ 3,14
Als2Q920R0 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,65■■■■□ 3,14
Als2Q920R0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC34,64■■■■□ 3,14
Als2Q920R0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC34,63■■■■□ 3,13
Als2Q920R0 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC34,62■■■■□ 3,13
Als2Q920R0 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,61■■■■□ 3,13
Als2Q920R0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,61■■■■□ 3,13
Als2Q920R0 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC34,6■■■■□ 3,13
Als2Q920R0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34,6■■■■□ 3,13
Als2Q920R0 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,6■■■■□ 3,13
Als2Q920R0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34,6■■■■□ 3,13
Als2Q920R0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC34,59■■■■□ 3,13
Als2Q920R0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,59■■■■□ 3,13
Als2Q920R0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34,58■■■■□ 3,13
Als2Q920R0 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,58■■■■□ 3,13
Als2Q920R0 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,58■■■■□ 3,13
Als2Q920R0 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC34,57■■■■□ 3,12
Als2Q920R0 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC34,56■■■■□ 3,12
Als2Q920R0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,56■■■■□ 3,12
Als2Q920R0 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC34,55■■■■□ 3,12
Als2Q920R0 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC34,53■■■■□ 3,12
Als2Q920R0 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,51■■■■□ 3,12
Als2Q920R0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,51■■■■□ 3,11
Als2Q920R0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,5■■■■□ 3,11
Als2Q920R0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34,48■■■■□ 3,11
Als2Q920R0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,48■■■■□ 3,11
Als2Q920R0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,48■■■■□ 3,11
Als2Q920R0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,48■■■■□ 3,11
Als2Q920R0 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC34,47■■■■□ 3,11
Als2Q920R0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,47■■■■□ 3,11
Als2Q920R0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34,46■■■■□ 3,11
Als2Q920R0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC34,45■■■■□ 3,11
Als2Q920R0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC34,45■■■■□ 3,11
Als2Q920R0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,44■■■■□ 3,1
Als2Q920R0 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC34,44■■■■□ 3,1
Als2Q920R0 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,43■■■■□ 3,1
Als2Q920R0 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC34,42■■■■□ 3,1
Als2Q920R0 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC34,42■■■■□ 3,1
Als2Q920R0 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,42■■■■□ 3,1
Als2Q920R0 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34,39■■■■□ 3,1
Als2Q920R0 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC34,37■■■■□ 3,09
Als2Q920R0 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34,36■■■■□ 3,09
Als2Q920R0 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC34,35■■■■□ 3,09
Als2Q920R0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC34,31■■■■□ 3,08
Als2Q920R0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC34,3■■■■□ 3,08
Als2Q920R0 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC34,29■■■■□ 3,08
Als2Q920R0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC34,29■■■■□ 3,08
Als2Q920R0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC34,28■■■■□ 3,08
Als2Q920R0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,27■■■■□ 3,08
Als2Q920R0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC34,25■■■■□ 3,07
Als2Q920R0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC34,25■■■■□ 3,07
Als2Q920R0 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,25■■■■□ 3,07
Als2Q920R0 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,24■■■■□ 3,07
Als2Q920R0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34,23■■■■□ 3,07
Als2Q920R0 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,23■■■■□ 3,07
Als2Q920R0 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,22■■■■□ 3,07
Als2Q920R0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC34,22■■■■□ 3,07
Als2Q920R0 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34,21■■■■□ 3,07
Als2Q920R0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC34,19■■■■□ 3,06
Als2Q920R0 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,19■■■■□ 3,06
Als2Q920R0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC34,19■■■■□ 3,06
Als2Q920R0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34,18■■■■□ 3,06
Als2Q920R0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC34,18■■■■□ 3,06
Als2Q920R0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC34,18■■■■□ 3,06
Als2Q920R0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC34,15■■■■□ 3,06
Als2Q920R0 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC34,13■■■■□ 3,05
Als2Q920R0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,13■■■■□ 3,05
Als2Q920R0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC34,12■■■■□ 3,05
Als2Q920R0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC34,1■■■■□ 3,05
Als2Q920R0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC34,09■■■■□ 3,05
Als2Q920R0 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC34,09■■■■□ 3,05
Als2Q920R0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC34,08■■■■□ 3,05
Als2Q920R0 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC34,08■■■■□ 3,05
Als2Q920R0 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,07■■■■□ 3,05
Als2Q920R0 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC34,07■■■■□ 3,04
Als2Q920R0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,07■■■■□ 3,04
Als2Q920R0 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC34,06■■■■□ 3,04
Als2Q920R0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC34,06■■■■□ 3,04
Als2Q920R0 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC34,06■■■■□ 3,04
Als2Q920R0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC34,05■■■■□ 3,04
Als2Q920R0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,05■■■■□ 3,04
Als2Q920R0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34,05■■■■□ 3,04
Als2Q920R0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC34,04■■■■□ 3,04
Als2Q920R0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC34,04■■■■□ 3,04
Als2Q920R0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,03■■■■□ 3,04
Als2Q920R0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC34,03■■■■□ 3,04
Als2Q920R0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,02■■■■□ 3,04
Als2Q920R0 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC34■■■■□ 3,03
Als2Q920R0 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC33,99■■■■□ 3,03
Als2Q920R0 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,99■■■■□ 3,03
Als2Q920R0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC33,97■■■■□ 3,03
Als2Q920R0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC33,96■■■■□ 3,03
Als2Q920R0 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,96■■■■□ 3,03
Als2Q920R0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC33,95■■■■□ 3,03
Als2Q920R0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC33,95■■■■□ 3,03
Als2Q920R0 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC33,95■■■■□ 3,03
Als2Q920R0 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC33,95■■■■□ 3,02
Als2Q920R0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC33,94■■■■□ 3,02
Als2Q920R0 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC33,93■■■■□ 3,02
Als2Q920R0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC33,93■■■■□ 3,02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19,8 ms