Protein–RNA interactions for Protein: Q91VU0

Fam3c, Protein FAM3C, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam3cQ91VU0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Fam3cQ91VU0 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Fam3cQ91VU0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Fam3cQ91VU0 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fam3cQ91VU0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fam3cQ91VU0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fam3cQ91VU0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fam3cQ91VU0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fam3cQ91VU0 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Fam3cQ91VU0 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Fam3cQ91VU0 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Fam3cQ91VU0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Fam3cQ91VU0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Fam3cQ91VU0 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Fam3cQ91VU0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Fam3cQ91VU0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fam3cQ91VU0 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fam3cQ91VU0 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fam3cQ91VU0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Fam3cQ91VU0 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Fam3cQ91VU0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Fam3cQ91VU0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Fam3cQ91VU0 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Fam3cQ91VU0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Fam3cQ91VU0 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Fam3cQ91VU0 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Fam3cQ91VU0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Fam3cQ91VU0 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Fam3cQ91VU0 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Fam3cQ91VU0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Fam3cQ91VU0 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Fam3cQ91VU0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Fam3cQ91VU0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Fam3cQ91VU0 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Fam3cQ91VU0 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Fam3cQ91VU0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Fam3cQ91VU0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Fam3cQ91VU0 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Fam3cQ91VU0 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Fam3cQ91VU0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Fam3cQ91VU0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Fam3cQ91VU0 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Fam3cQ91VU0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Fam3cQ91VU0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Fam3cQ91VU0 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fam3cQ91VU0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fam3cQ91VU0 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fam3cQ91VU0 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fam3cQ91VU0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fam3cQ91VU0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fam3cQ91VU0 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Fam3cQ91VU0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fam3cQ91VU0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Fam3cQ91VU0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Fam3cQ91VU0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Fam3cQ91VU0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Fam3cQ91VU0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Fam3cQ91VU0 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fam3cQ91VU0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fam3cQ91VU0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fam3cQ91VU0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fam3cQ91VU0 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fam3cQ91VU0 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fam3cQ91VU0 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fam3cQ91VU0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Fam3cQ91VU0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Fam3cQ91VU0 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Fam3cQ91VU0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Fam3cQ91VU0 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fam3cQ91VU0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fam3cQ91VU0 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fam3cQ91VU0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fam3cQ91VU0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fam3cQ91VU0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fam3cQ91VU0 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fam3cQ91VU0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fam3cQ91VU0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fam3cQ91VU0 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fam3cQ91VU0 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fam3cQ91VU0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fam3cQ91VU0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Fam3cQ91VU0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Fam3cQ91VU0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Fam3cQ91VU0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Fam3cQ91VU0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Fam3cQ91VU0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Fam3cQ91VU0 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Fam3cQ91VU0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Fam3cQ91VU0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Fam3cQ91VU0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Fam3cQ91VU0 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Fam3cQ91VU0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Fam3cQ91VU0 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Fam3cQ91VU0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Fam3cQ91VU0 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Fam3cQ91VU0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Fam3cQ91VU0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fam3cQ91VU0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fam3cQ91VU0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fam3cQ91VU0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms