Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE73

Cul7, Cullin-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul7Q8VE73 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC39,08■■■■□ 3,85
Cul7Q8VE73 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,07■■■■□ 3,84
Cul7Q8VE73 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC39,06■■■■□ 3,84
Cul7Q8VE73 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC39,06■■■■□ 3,84
Cul7Q8VE73 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,05■■■■□ 3,84
Cul7Q8VE73 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39,05■■■■□ 3,84
Cul7Q8VE73 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,03■■■■□ 3,84
Cul7Q8VE73 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC39,03■■■■□ 3,84
Cul7Q8VE73 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC39,02■■■■□ 3,84
Cul7Q8VE73 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3,83
Cul7Q8VE73 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,99■■■■□ 3,83
Cul7Q8VE73 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC38,97■■■■□ 3,83
Cul7Q8VE73 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC38,96■■■■□ 3,83
Cul7Q8VE73 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38,96■■■■□ 3,83
Cul7Q8VE73 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC38,95■■■■□ 3,83
Cul7Q8VE73 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,94■■■■□ 3,82
Cul7Q8VE73 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38,94■■■■□ 3,82
Cul7Q8VE73 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC38,94■■■■□ 3,82
Cul7Q8VE73 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC38,93■■■■□ 3,82
Cul7Q8VE73 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38,92■■■■□ 3,82
Cul7Q8VE73 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC38,92■■■■□ 3,82
Cul7Q8VE73 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC38,9■■■■□ 3,82
Cul7Q8VE73 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC38,89■■■■□ 3,82
Cul7Q8VE73 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC38,89■■■■□ 3,82
Cul7Q8VE73 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC38,88■■■■□ 3,81
Cul7Q8VE73 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,87■■■■□ 3,81
Cul7Q8VE73 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,87■■■■□ 3,81
Cul7Q8VE73 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,87■■■■□ 3,81
Cul7Q8VE73 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC38,87■■■■□ 3,81
Cul7Q8VE73 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,86■■■■□ 3,81
Cul7Q8VE73 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38,86■■■■□ 3,81
Cul7Q8VE73 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,85■■■■□ 3,81
Cul7Q8VE73 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,85■■■■□ 3,81
Cul7Q8VE73 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38,84■■■■□ 3,81
Cul7Q8VE73 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC38,84■■■■□ 3,81
Cul7Q8VE73 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38,84■■■■□ 3,81
Cul7Q8VE73 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC38,84■■■■□ 3,81
Cul7Q8VE73 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC38,84■■■■□ 3,81
Cul7Q8VE73 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,82■■■■□ 3,81
Cul7Q8VE73 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC38,82■■■■□ 3,8
Cul7Q8VE73 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC38,81■■■■□ 3,8
Cul7Q8VE73 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,8■■■■□ 3,8
Cul7Q8VE73 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,78■■■■□ 3,8
Cul7Q8VE73 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,78■■■■□ 3,8
Cul7Q8VE73 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC38,78■■■■□ 3,8
Cul7Q8VE73 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38,77■■■■□ 3,8
Cul7Q8VE73 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC38,77■■■■□ 3,8
Cul7Q8VE73 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,77■■■■□ 3,8
Cul7Q8VE73 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38,74■■■■□ 3,79
Cul7Q8VE73 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,74■■■■□ 3,79
Cul7Q8VE73 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,74■■■■□ 3,79
Cul7Q8VE73 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC38,73■■■■□ 3,79
Cul7Q8VE73 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC38,72■■■■□ 3,79
Cul7Q8VE73 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,72■■■■□ 3,79
Cul7Q8VE73 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38,69■■■■□ 3,78
Cul7Q8VE73 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC38,68■■■■□ 3,78
Cul7Q8VE73 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,66■■■■□ 3,78
Cul7Q8VE73 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC38,66■■■■□ 3,78
Cul7Q8VE73 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,64■■■■□ 3,78
Cul7Q8VE73 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC38,62■■■■□ 3,77
Cul7Q8VE73 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,59■■■■□ 3,77
Cul7Q8VE73 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,59■■■■□ 3,77
Cul7Q8VE73 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC38,58■■■■□ 3,77
Cul7Q8VE73 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,58■■■■□ 3,77
Cul7Q8VE73 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC38,58■■■■□ 3,77
Cul7Q8VE73 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC38,58■■■■□ 3,77
Cul7Q8VE73 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC38,58■■■■□ 3,77
Cul7Q8VE73 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC38,57■■■■□ 3,76
Cul7Q8VE73 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC38,56■■■■□ 3,76
Cul7Q8VE73 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC38,56■■■■□ 3,76
Cul7Q8VE73 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC38,56■■■■□ 3,76
Cul7Q8VE73 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC38,54■■■■□ 3,76
Cul7Q8VE73 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC38,53■■■■□ 3,76
Cul7Q8VE73 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC38,53■■■■□ 3,76
Cul7Q8VE73 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC38,53■■■■□ 3,76
Cul7Q8VE73 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38,52■■■■□ 3,76
Cul7Q8VE73 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC38,51■■■■□ 3,76
Cul7Q8VE73 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC38,5■■■■□ 3,75
Cul7Q8VE73 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38,49■■■■□ 3,75
Cul7Q8VE73 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC38,49■■■■□ 3,75
Cul7Q8VE73 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38,48■■■■□ 3,75
Cul7Q8VE73 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC38,48■■■■□ 3,75
Cul7Q8VE73 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,47■■■■□ 3,75
Cul7Q8VE73 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC38,46■■■■□ 3,75
Cul7Q8VE73 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,46■■■■□ 3,75
Cul7Q8VE73 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC38,45■■■■□ 3,75
Cul7Q8VE73 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC38,38■■■■□ 3,73
Cul7Q8VE73 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC38,38■■■■□ 3,73
Cul7Q8VE73 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC38,38■■■■□ 3,73
Cul7Q8VE73 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC38,37■■■■□ 3,73
Cul7Q8VE73 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38,37■■■■□ 3,73
Cul7Q8VE73 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,37■■■■□ 3,73
Cul7Q8VE73 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,36■■■■□ 3,73
Cul7Q8VE73 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC38,35■■■■□ 3,73
Cul7Q8VE73 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,35■■■■□ 3,73
Cul7Q8VE73 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC38,33■■■■□ 3,73
Cul7Q8VE73 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,31■■■■□ 3,72
Cul7Q8VE73 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC38,31■■■■□ 3,72
Cul7Q8VE73 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC38,3■■■■□ 3,72
Cul7Q8VE73 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC38,3■■■■□ 3,72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28,1 ms