Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCN5

Cth, Cystathionine gamma-lyase, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CthQ8VCN5 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CthQ8VCN5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CthQ8VCN5 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CthQ8VCN5 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CthQ8VCN5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CthQ8VCN5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CthQ8VCN5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CthQ8VCN5 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CthQ8VCN5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CthQ8VCN5 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CthQ8VCN5 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CthQ8VCN5 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CthQ8VCN5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CthQ8VCN5 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CthQ8VCN5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CthQ8VCN5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CthQ8VCN5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CthQ8VCN5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CthQ8VCN5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CthQ8VCN5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CthQ8VCN5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CthQ8VCN5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CthQ8VCN5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CthQ8VCN5 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CthQ8VCN5 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CthQ8VCN5 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CthQ8VCN5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CthQ8VCN5 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CthQ8VCN5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CthQ8VCN5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CthQ8VCN5 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CthQ8VCN5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CthQ8VCN5 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CthQ8VCN5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CthQ8VCN5 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CthQ8VCN5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CthQ8VCN5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CthQ8VCN5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CthQ8VCN5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CthQ8VCN5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CthQ8VCN5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CthQ8VCN5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CthQ8VCN5 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CthQ8VCN5 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CthQ8VCN5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CthQ8VCN5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CthQ8VCN5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CthQ8VCN5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CthQ8VCN5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CthQ8VCN5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CthQ8VCN5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CthQ8VCN5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CthQ8VCN5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CthQ8VCN5 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CthQ8VCN5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CthQ8VCN5 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CthQ8VCN5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CthQ8VCN5 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CthQ8VCN5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CthQ8VCN5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CthQ8VCN5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CthQ8VCN5 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CthQ8VCN5 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CthQ8VCN5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CthQ8VCN5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CthQ8VCN5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CthQ8VCN5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CthQ8VCN5 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CthQ8VCN5 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CthQ8VCN5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CthQ8VCN5 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CthQ8VCN5 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CthQ8VCN5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CthQ8VCN5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CthQ8VCN5 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CthQ8VCN5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CthQ8VCN5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CthQ8VCN5 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CthQ8VCN5 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CthQ8VCN5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CthQ8VCN5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CthQ8VCN5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CthQ8VCN5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CthQ8VCN5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CthQ8VCN5 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CthQ8VCN5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CthQ8VCN5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CthQ8VCN5 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CthQ8VCN5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CthQ8VCN5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CthQ8VCN5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CthQ8VCN5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CthQ8VCN5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CthQ8VCN5 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CthQ8VCN5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CthQ8VCN5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CthQ8VCN5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CthQ8VCN5 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CthQ8VCN5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CthQ8VCN5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms