Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCK3

Tubg2, Tubulin gamma-2 chain, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubg2Q8VCK3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tubg2Q8VCK3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tubg2Q8VCK3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tubg2Q8VCK3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tubg2Q8VCK3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tubg2Q8VCK3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tubg2Q8VCK3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tubg2Q8VCK3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tubg2Q8VCK3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tubg2Q8VCK3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tubg2Q8VCK3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tubg2Q8VCK3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tubg2Q8VCK3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tubg2Q8VCK3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tubg2Q8VCK3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tubg2Q8VCK3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tubg2Q8VCK3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tubg2Q8VCK3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Tubg2Q8VCK3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tubg2Q8VCK3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tubg2Q8VCK3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tubg2Q8VCK3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tubg2Q8VCK3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tubg2Q8VCK3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tubg2Q8VCK3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tubg2Q8VCK3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tubg2Q8VCK3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tubg2Q8VCK3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tubg2Q8VCK3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Tubg2Q8VCK3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tubg2Q8VCK3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tubg2Q8VCK3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tubg2Q8VCK3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tubg2Q8VCK3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tubg2Q8VCK3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tubg2Q8VCK3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tubg2Q8VCK3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tubg2Q8VCK3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tubg2Q8VCK3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tubg2Q8VCK3 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tubg2Q8VCK3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tubg2Q8VCK3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Tubg2Q8VCK3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tubg2Q8VCK3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Tubg2Q8VCK3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tubg2Q8VCK3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tubg2Q8VCK3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tubg2Q8VCK3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tubg2Q8VCK3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tubg2Q8VCK3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tubg2Q8VCK3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tubg2Q8VCK3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tubg2Q8VCK3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tubg2Q8VCK3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tubg2Q8VCK3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tubg2Q8VCK3 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tubg2Q8VCK3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Tubg2Q8VCK3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tubg2Q8VCK3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tubg2Q8VCK3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tubg2Q8VCK3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tubg2Q8VCK3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tubg2Q8VCK3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tubg2Q8VCK3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tubg2Q8VCK3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tubg2Q8VCK3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tubg2Q8VCK3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Tubg2Q8VCK3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tubg2Q8VCK3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tubg2Q8VCK3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Tubg2Q8VCK3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tubg2Q8VCK3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tubg2Q8VCK3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tubg2Q8VCK3 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tubg2Q8VCK3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tubg2Q8VCK3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tubg2Q8VCK3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tubg2Q8VCK3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tubg2Q8VCK3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tubg2Q8VCK3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Tubg2Q8VCK3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tubg2Q8VCK3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tubg2Q8VCK3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tubg2Q8VCK3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tubg2Q8VCK3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tubg2Q8VCK3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tubg2Q8VCK3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tubg2Q8VCK3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tubg2Q8VCK3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tubg2Q8VCK3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tubg2Q8VCK3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tubg2Q8VCK3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tubg2Q8VCK3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tubg2Q8VCK3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tubg2Q8VCK3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tubg2Q8VCK3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tubg2Q8VCK3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tubg2Q8VCK3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tubg2Q8VCK3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tubg2Q8VCK3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms