Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3F9

Tut1, Speckle targeted PIP5K1A-regulated poly(A) polymerase, mousemouse

Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tut1Q8R3F9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC29,44■■■□□ 2,3
Tut1Q8R3F9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC29,44■■■□□ 2,3
Tut1Q8R3F9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,42■■■□□ 2,3
Tut1Q8R3F9 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC29,42■■■□□ 2,3
Tut1Q8R3F9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC29,41■■■□□ 2,3
Tut1Q8R3F9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,4■■■□□ 2,3
Tut1Q8R3F9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC29,4■■■□□ 2,3
Tut1Q8R3F9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,39■■■□□ 2,3
Tut1Q8R3F9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,39■■■□□ 2,3
Tut1Q8R3F9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC29,38■■■□□ 2,29
Tut1Q8R3F9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC29,38■■■□□ 2,29
Tut1Q8R3F9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC29,37■■■□□ 2,29
Tut1Q8R3F9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29,37■■■□□ 2,29
Tut1Q8R3F9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,36■■■□□ 2,29
Tut1Q8R3F9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,36■■■□□ 2,29
Tut1Q8R3F9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,36■■■□□ 2,29
Tut1Q8R3F9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC29,34■■■□□ 2,29
Tut1Q8R3F9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC29,32■■■□□ 2,28
Tut1Q8R3F9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,29■■■□□ 2,28
Tut1Q8R3F9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC29,29■■■□□ 2,28
Tut1Q8R3F9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,28■■■□□ 2,28
Tut1Q8R3F9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC29,28■■■□□ 2,28
Tut1Q8R3F9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC29,27■■■□□ 2,28
Tut1Q8R3F9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,26■■■□□ 2,27
Tut1Q8R3F9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC29,26■■■□□ 2,27
Tut1Q8R3F9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,24■■■□□ 2,27
Tut1Q8R3F9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,22■■■□□ 2,27
Tut1Q8R3F9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC29,22■■■□□ 2,27
Tut1Q8R3F9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29,22■■■□□ 2,27
Tut1Q8R3F9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,22■■■□□ 2,27
Tut1Q8R3F9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC29,22■■■□□ 2,27
Tut1Q8R3F9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC29,21■■■□□ 2,27
Tut1Q8R3F9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC29,21■■■□□ 2,27
Tut1Q8R3F9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,21■■■□□ 2,27
Tut1Q8R3F9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,2■■■□□ 2,26
Tut1Q8R3F9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,19■■■□□ 2,26
Tut1Q8R3F9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,19■■■□□ 2,26
Tut1Q8R3F9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC29,18■■■□□ 2,26
Tut1Q8R3F9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC29,18■■■□□ 2,26
Tut1Q8R3F9 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC29,17■■■□□ 2,26
Tut1Q8R3F9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,17■■■□□ 2,26
Tut1Q8R3F9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29,17■■■□□ 2,26
Tut1Q8R3F9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC29,17■■■□□ 2,26
Tut1Q8R3F9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,17■■■□□ 2,26
Tut1Q8R3F9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,17■■■□□ 2,26
Tut1Q8R3F9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,16■■■□□ 2,26
Tut1Q8R3F9 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29,16■■■□□ 2,26
Tut1Q8R3F9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,13■■■□□ 2,25
Tut1Q8R3F9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
Tut1Q8R3F9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC29,1■■■□□ 2,25
Tut1Q8R3F9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC29,09■■■□□ 2,25
Tut1Q8R3F9 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC29,09■■■□□ 2,25
Tut1Q8R3F9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,09■■■□□ 2,25
Tut1Q8R3F9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC29,08■■■□□ 2,25
Tut1Q8R3F9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,06■■■□□ 2,24
Tut1Q8R3F9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29,06■■■□□ 2,24
Tut1Q8R3F9 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29,05■■■□□ 2,24
Tut1Q8R3F9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,04■■■□□ 2,24
Tut1Q8R3F9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29,04■■■□□ 2,24
Tut1Q8R3F9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,03■■■□□ 2,24
Tut1Q8R3F9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2,23
Tut1Q8R3F9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29■■■□□ 2,23
Tut1Q8R3F9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2,23
Tut1Q8R3F9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2,23
Tut1Q8R3F9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC28,98■■■□□ 2,23
Tut1Q8R3F9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC28,97■■■□□ 2,23
Tut1Q8R3F9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC28,97■■■□□ 2,23
Tut1Q8R3F9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC28,94■■■□□ 2,22
Tut1Q8R3F9 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
Tut1Q8R3F9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28,94■■■□□ 2,22
Tut1Q8R3F9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28,93■■■□□ 2,22
Tut1Q8R3F9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,92■■■□□ 2,22
Tut1Q8R3F9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,92■■■□□ 2,22
Tut1Q8R3F9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,92■■■□□ 2,22
Tut1Q8R3F9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,91■■■□□ 2,22
Tut1Q8R3F9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,91■■■□□ 2,22
Tut1Q8R3F9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28,9■■■□□ 2,22
Tut1Q8R3F9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,89■■■□□ 2,22
Tut1Q8R3F9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,89■■■□□ 2,22
Tut1Q8R3F9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,87■■■□□ 2,21
Tut1Q8R3F9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,86■■■□□ 2,21
Tut1Q8R3F9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28,86■■■□□ 2,21
Tut1Q8R3F9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC28,85■■■□□ 2,21
Tut1Q8R3F9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28,85■■■□□ 2,21
Tut1Q8R3F9 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC28,85■■■□□ 2,21
Tut1Q8R3F9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC28,85■■■□□ 2,21
Tut1Q8R3F9 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28,84■■■□□ 2,21
Tut1Q8R3F9 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC28,83■■■□□ 2,21
Tut1Q8R3F9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28,83■■■□□ 2,21
Tut1Q8R3F9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28,82■■■□□ 2,2
Tut1Q8R3F9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC28,82■■■□□ 2,2
Tut1Q8R3F9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC28,79■■■□□ 2,2
Tut1Q8R3F9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,79■■■□□ 2,2
Tut1Q8R3F9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC28,78■■■□□ 2,2
Tut1Q8R3F9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC28,78■■■□□ 2,2
Tut1Q8R3F9 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28,77■■■□□ 2,2
Tut1Q8R3F9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28,77■■■□□ 2,2
Tut1Q8R3F9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28,76■■■□□ 2,2
Tut1Q8R3F9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC28,76■■■□□ 2,19
Tut1Q8R3F9 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,76■■■□□ 2,19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,5 ms