Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFA7

Klf17, Krueppel-like factor 17, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf17Q8CFA7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Klf17Q8CFA7 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Klf17Q8CFA7 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Klf17Q8CFA7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Klf17Q8CFA7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Klf17Q8CFA7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Klf17Q8CFA7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Klf17Q8CFA7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Klf17Q8CFA7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Klf17Q8CFA7 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Klf17Q8CFA7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Klf17Q8CFA7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Klf17Q8CFA7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Klf17Q8CFA7 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Klf17Q8CFA7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Klf17Q8CFA7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Klf17Q8CFA7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Klf17Q8CFA7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Klf17Q8CFA7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Klf17Q8CFA7 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Klf17Q8CFA7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Klf17Q8CFA7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Klf17Q8CFA7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Klf17Q8CFA7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Klf17Q8CFA7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Klf17Q8CFA7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Klf17Q8CFA7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Klf17Q8CFA7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Klf17Q8CFA7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Klf17Q8CFA7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Klf17Q8CFA7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Klf17Q8CFA7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Klf17Q8CFA7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Klf17Q8CFA7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Klf17Q8CFA7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Klf17Q8CFA7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Klf17Q8CFA7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Klf17Q8CFA7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Klf17Q8CFA7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Klf17Q8CFA7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Klf17Q8CFA7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Klf17Q8CFA7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Klf17Q8CFA7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Klf17Q8CFA7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Klf17Q8CFA7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Klf17Q8CFA7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Klf17Q8CFA7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Klf17Q8CFA7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Klf17Q8CFA7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Klf17Q8CFA7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Klf17Q8CFA7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Klf17Q8CFA7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Klf17Q8CFA7 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klf17Q8CFA7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klf17Q8CFA7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Klf17Q8CFA7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klf17Q8CFA7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Klf17Q8CFA7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Klf17Q8CFA7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Klf17Q8CFA7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Klf17Q8CFA7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Klf17Q8CFA7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Klf17Q8CFA7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Klf17Q8CFA7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Klf17Q8CFA7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Klf17Q8CFA7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Klf17Q8CFA7 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Klf17Q8CFA7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Klf17Q8CFA7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Klf17Q8CFA7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Klf17Q8CFA7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Klf17Q8CFA7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Klf17Q8CFA7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Klf17Q8CFA7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Klf17Q8CFA7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klf17Q8CFA7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Klf17Q8CFA7 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Klf17Q8CFA7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Klf17Q8CFA7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Klf17Q8CFA7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Klf17Q8CFA7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Klf17Q8CFA7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Klf17Q8CFA7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Klf17Q8CFA7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Klf17Q8CFA7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Klf17Q8CFA7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Klf17Q8CFA7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Klf17Q8CFA7 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Klf17Q8CFA7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Klf17Q8CFA7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Klf17Q8CFA7 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Klf17Q8CFA7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Klf17Q8CFA7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Klf17Q8CFA7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Klf17Q8CFA7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Klf17Q8CFA7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Klf17Q8CFA7 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Klf17Q8CFA7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Klf17Q8CFA7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Klf17Q8CFA7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.1 ms