Protein–RNA interactions for Protein: Q8C4A5

Asxl3, Putative Polycomb group protein ASXL3, mousemouse

Predictions only

Length 2,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asxl3Q8C4A5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Asxl3Q8C4A5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Asxl3Q8C4A5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Asxl3Q8C4A5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Asxl3Q8C4A5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Asxl3Q8C4A5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Asxl3Q8C4A5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Asxl3Q8C4A5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Asxl3Q8C4A5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Asxl3Q8C4A5 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Asxl3Q8C4A5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Asxl3Q8C4A5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Asxl3Q8C4A5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Asxl3Q8C4A5 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Asxl3Q8C4A5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Asxl3Q8C4A5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Asxl3Q8C4A5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Asxl3Q8C4A5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Asxl3Q8C4A5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Asxl3Q8C4A5 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Asxl3Q8C4A5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Asxl3Q8C4A5 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Asxl3Q8C4A5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Asxl3Q8C4A5 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Asxl3Q8C4A5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Asxl3Q8C4A5 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Asxl3Q8C4A5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Asxl3Q8C4A5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Asxl3Q8C4A5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Asxl3Q8C4A5 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Asxl3Q8C4A5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Asxl3Q8C4A5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Asxl3Q8C4A5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Asxl3Q8C4A5 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Asxl3Q8C4A5 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Asxl3Q8C4A5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Asxl3Q8C4A5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Asxl3Q8C4A5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Asxl3Q8C4A5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Asxl3Q8C4A5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Asxl3Q8C4A5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Asxl3Q8C4A5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Asxl3Q8C4A5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Asxl3Q8C4A5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Asxl3Q8C4A5 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Asxl3Q8C4A5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Asxl3Q8C4A5 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Asxl3Q8C4A5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Asxl3Q8C4A5 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Asxl3Q8C4A5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Asxl3Q8C4A5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Asxl3Q8C4A5 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Asxl3Q8C4A5 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Asxl3Q8C4A5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Asxl3Q8C4A5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Asxl3Q8C4A5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Asxl3Q8C4A5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Asxl3Q8C4A5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Asxl3Q8C4A5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Asxl3Q8C4A5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Asxl3Q8C4A5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Asxl3Q8C4A5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Asxl3Q8C4A5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Asxl3Q8C4A5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Asxl3Q8C4A5 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Asxl3Q8C4A5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Asxl3Q8C4A5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Asxl3Q8C4A5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Asxl3Q8C4A5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Asxl3Q8C4A5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Asxl3Q8C4A5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Asxl3Q8C4A5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Asxl3Q8C4A5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Asxl3Q8C4A5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Asxl3Q8C4A5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Asxl3Q8C4A5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Asxl3Q8C4A5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Asxl3Q8C4A5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Asxl3Q8C4A5 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Asxl3Q8C4A5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Asxl3Q8C4A5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Asxl3Q8C4A5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Asxl3Q8C4A5 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Asxl3Q8C4A5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Asxl3Q8C4A5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Asxl3Q8C4A5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Asxl3Q8C4A5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Asxl3Q8C4A5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Asxl3Q8C4A5 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Asxl3Q8C4A5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Asxl3Q8C4A5 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Asxl3Q8C4A5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Asxl3Q8C4A5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Asxl3Q8C4A5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Asxl3Q8C4A5 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Asxl3Q8C4A5 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Asxl3Q8C4A5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Asxl3Q8C4A5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Asxl3Q8C4A5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Asxl3Q8C4A5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms