Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTY8

Scfd2, Sec1 family domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scfd2Q8BTY8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Scfd2Q8BTY8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Scfd2Q8BTY8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Scfd2Q8BTY8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Scfd2Q8BTY8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Scfd2Q8BTY8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Scfd2Q8BTY8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Scfd2Q8BTY8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Scfd2Q8BTY8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Scfd2Q8BTY8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Scfd2Q8BTY8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Scfd2Q8BTY8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Scfd2Q8BTY8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Scfd2Q8BTY8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Scfd2Q8BTY8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Scfd2Q8BTY8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Scfd2Q8BTY8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Scfd2Q8BTY8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Scfd2Q8BTY8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Scfd2Q8BTY8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Scfd2Q8BTY8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Scfd2Q8BTY8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Scfd2Q8BTY8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Scfd2Q8BTY8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Scfd2Q8BTY8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
Scfd2Q8BTY8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Scfd2Q8BTY8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Scfd2Q8BTY8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Scfd2Q8BTY8 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Scfd2Q8BTY8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Scfd2Q8BTY8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
Scfd2Q8BTY8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Scfd2Q8BTY8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Scfd2Q8BTY8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Scfd2Q8BTY8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Scfd2Q8BTY8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Scfd2Q8BTY8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Scfd2Q8BTY8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Scfd2Q8BTY8 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Scfd2Q8BTY8 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Scfd2Q8BTY8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Scfd2Q8BTY8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Scfd2Q8BTY8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Scfd2Q8BTY8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Scfd2Q8BTY8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Scfd2Q8BTY8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Scfd2Q8BTY8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Scfd2Q8BTY8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Scfd2Q8BTY8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Scfd2Q8BTY8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Scfd2Q8BTY8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Scfd2Q8BTY8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Scfd2Q8BTY8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Scfd2Q8BTY8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Scfd2Q8BTY8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Scfd2Q8BTY8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Scfd2Q8BTY8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Scfd2Q8BTY8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Scfd2Q8BTY8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Scfd2Q8BTY8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Scfd2Q8BTY8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Scfd2Q8BTY8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Scfd2Q8BTY8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Scfd2Q8BTY8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Scfd2Q8BTY8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Scfd2Q8BTY8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Scfd2Q8BTY8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Scfd2Q8BTY8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Scfd2Q8BTY8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Scfd2Q8BTY8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Scfd2Q8BTY8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Scfd2Q8BTY8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Scfd2Q8BTY8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Scfd2Q8BTY8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Scfd2Q8BTY8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Scfd2Q8BTY8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Scfd2Q8BTY8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Scfd2Q8BTY8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Scfd2Q8BTY8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Scfd2Q8BTY8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Scfd2Q8BTY8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Scfd2Q8BTY8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Scfd2Q8BTY8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Scfd2Q8BTY8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Scfd2Q8BTY8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Scfd2Q8BTY8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Scfd2Q8BTY8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Scfd2Q8BTY8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Scfd2Q8BTY8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Scfd2Q8BTY8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Scfd2Q8BTY8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Scfd2Q8BTY8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Scfd2Q8BTY8 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Scfd2Q8BTY8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Scfd2Q8BTY8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Scfd2Q8BTY8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Scfd2Q8BTY8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Scfd2Q8BTY8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Scfd2Q8BTY8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Scfd2Q8BTY8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms