Protein–RNA interactions for Protein: Q8BI72

Cdkn2aip, CDKN2A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2aipQ8BI72 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cdkn2aipQ8BI72 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cdkn2aipQ8BI72 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cdkn2aipQ8BI72 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cdkn2aipQ8BI72 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cdkn2aipQ8BI72 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Cdkn2aipQ8BI72 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cdkn2aipQ8BI72 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cdkn2aipQ8BI72 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cdkn2aipQ8BI72 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cdkn2aipQ8BI72 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cdkn2aipQ8BI72 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cdkn2aipQ8BI72 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cdkn2aipQ8BI72 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cdkn2aipQ8BI72 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cdkn2aipQ8BI72 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cdkn2aipQ8BI72 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cdkn2aipQ8BI72 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cdkn2aipQ8BI72 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cdkn2aipQ8BI72 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cdkn2aipQ8BI72 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cdkn2aipQ8BI72 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cdkn2aipQ8BI72 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cdkn2aipQ8BI72 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cdkn2aipQ8BI72 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cdkn2aipQ8BI72 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cdkn2aipQ8BI72 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Cdkn2aipQ8BI72 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cdkn2aipQ8BI72 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cdkn2aipQ8BI72 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cdkn2aipQ8BI72 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Cdkn2aipQ8BI72 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cdkn2aipQ8BI72 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cdkn2aipQ8BI72 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cdkn2aipQ8BI72 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cdkn2aipQ8BI72 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Cdkn2aipQ8BI72 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Cdkn2aipQ8BI72 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Cdkn2aipQ8BI72 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cdkn2aipQ8BI72 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cdkn2aipQ8BI72 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cdkn2aipQ8BI72 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cdkn2aipQ8BI72 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cdkn2aipQ8BI72 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cdkn2aipQ8BI72 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cdkn2aipQ8BI72 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cdkn2aipQ8BI72 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cdkn2aipQ8BI72 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cdkn2aipQ8BI72 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cdkn2aipQ8BI72 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Cdkn2aipQ8BI72 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Cdkn2aipQ8BI72 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cdkn2aipQ8BI72 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cdkn2aipQ8BI72 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cdkn2aipQ8BI72 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cdkn2aipQ8BI72 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cdkn2aipQ8BI72 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cdkn2aipQ8BI72 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cdkn2aipQ8BI72 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cdkn2aipQ8BI72 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cdkn2aipQ8BI72 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cdkn2aipQ8BI72 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cdkn2aipQ8BI72 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cdkn2aipQ8BI72 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cdkn2aipQ8BI72 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cdkn2aipQ8BI72 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cdkn2aipQ8BI72 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cdkn2aipQ8BI72 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cdkn2aipQ8BI72 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cdkn2aipQ8BI72 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Cdkn2aipQ8BI72 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cdkn2aipQ8BI72 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cdkn2aipQ8BI72 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cdkn2aipQ8BI72 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cdkn2aipQ8BI72 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cdkn2aipQ8BI72 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cdkn2aipQ8BI72 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cdkn2aipQ8BI72 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cdkn2aipQ8BI72 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cdkn2aipQ8BI72 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cdkn2aipQ8BI72 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cdkn2aipQ8BI72 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cdkn2aipQ8BI72 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cdkn2aipQ8BI72 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cdkn2aipQ8BI72 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cdkn2aipQ8BI72 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cdkn2aipQ8BI72 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cdkn2aipQ8BI72 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cdkn2aipQ8BI72 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cdkn2aipQ8BI72 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cdkn2aipQ8BI72 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cdkn2aipQ8BI72 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cdkn2aipQ8BI72 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cdkn2aipQ8BI72 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Cdkn2aipQ8BI72 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Cdkn2aipQ8BI72 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Cdkn2aipQ8BI72 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cdkn2aipQ8BI72 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Cdkn2aipQ8BI72 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cdkn2aipQ8BI72 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms