Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZJ8

Cracr2b, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cracr2bQ80ZJ8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cracr2bQ80ZJ8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cracr2bQ80ZJ8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Cracr2bQ80ZJ8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cracr2bQ80ZJ8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cracr2bQ80ZJ8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cracr2bQ80ZJ8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cracr2bQ80ZJ8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cracr2bQ80ZJ8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cracr2bQ80ZJ8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cracr2bQ80ZJ8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cracr2bQ80ZJ8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Cracr2bQ80ZJ8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Cracr2bQ80ZJ8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cracr2bQ80ZJ8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cracr2bQ80ZJ8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cracr2bQ80ZJ8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cracr2bQ80ZJ8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cracr2bQ80ZJ8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cracr2bQ80ZJ8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cracr2bQ80ZJ8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cracr2bQ80ZJ8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cracr2bQ80ZJ8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cracr2bQ80ZJ8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cracr2bQ80ZJ8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cracr2bQ80ZJ8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cracr2bQ80ZJ8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cracr2bQ80ZJ8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cracr2bQ80ZJ8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cracr2bQ80ZJ8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cracr2bQ80ZJ8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cracr2bQ80ZJ8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Cracr2bQ80ZJ8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cracr2bQ80ZJ8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cracr2bQ80ZJ8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cracr2bQ80ZJ8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cracr2bQ80ZJ8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cracr2bQ80ZJ8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cracr2bQ80ZJ8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cracr2bQ80ZJ8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cracr2bQ80ZJ8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cracr2bQ80ZJ8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cracr2bQ80ZJ8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cracr2bQ80ZJ8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cracr2bQ80ZJ8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cracr2bQ80ZJ8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cracr2bQ80ZJ8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cracr2bQ80ZJ8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cracr2bQ80ZJ8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cracr2bQ80ZJ8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Cracr2bQ80ZJ8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cracr2bQ80ZJ8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Cracr2bQ80ZJ8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cracr2bQ80ZJ8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cracr2bQ80ZJ8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Cracr2bQ80ZJ8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cracr2bQ80ZJ8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cracr2bQ80ZJ8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cracr2bQ80ZJ8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Cracr2bQ80ZJ8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Cracr2bQ80ZJ8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Cracr2bQ80ZJ8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cracr2bQ80ZJ8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cracr2bQ80ZJ8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Cracr2bQ80ZJ8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cracr2bQ80ZJ8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Cracr2bQ80ZJ8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cracr2bQ80ZJ8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cracr2bQ80ZJ8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cracr2bQ80ZJ8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cracr2bQ80ZJ8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cracr2bQ80ZJ8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cracr2bQ80ZJ8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cracr2bQ80ZJ8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cracr2bQ80ZJ8 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cracr2bQ80ZJ8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cracr2bQ80ZJ8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cracr2bQ80ZJ8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cracr2bQ80ZJ8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cracr2bQ80ZJ8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cracr2bQ80ZJ8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cracr2bQ80ZJ8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cracr2bQ80ZJ8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Cracr2bQ80ZJ8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cracr2bQ80ZJ8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cracr2bQ80ZJ8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cracr2bQ80ZJ8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cracr2bQ80ZJ8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cracr2bQ80ZJ8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cracr2bQ80ZJ8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cracr2bQ80ZJ8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cracr2bQ80ZJ8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Cracr2bQ80ZJ8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cracr2bQ80ZJ8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Cracr2bQ80ZJ8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cracr2bQ80ZJ8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cracr2bQ80ZJ8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cracr2bQ80ZJ8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cracr2bQ80ZJ8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cracr2bQ80ZJ8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms