Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z71

Tnn, Tenascin-N, mousemouse

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnnQ80Z71 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC42,58■■■■■ 4,41
TnnQ80Z71 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,56■■■■■ 4,4
TnnQ80Z71 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC42,56■■■■■ 4,4
TnnQ80Z71 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42,54■■■■■ 4,4
TnnQ80Z71 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,54■■■■■ 4,4
TnnQ80Z71 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC42,54■■■■■ 4,4
TnnQ80Z71 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC42,53■■■■■ 4,4
TnnQ80Z71 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,52■■■■■ 4,4
TnnQ80Z71 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC42,52■■■■■ 4,4
TnnQ80Z71 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42,52■■■■■ 4,4
TnnQ80Z71 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,51■■■■■ 4,4
TnnQ80Z71 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42,5■■■■■ 4,39
TnnQ80Z71 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC42,5■■■■■ 4,39
TnnQ80Z71 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42,5■■■■■ 4,39
TnnQ80Z71 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC42,49■■■■■ 4,39
TnnQ80Z71 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,47■■■■■ 4,39
TnnQ80Z71 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC42,47■■■■■ 4,39
TnnQ80Z71 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC42,47■■■■■ 4,39
TnnQ80Z71 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC42,46■■■■■ 4,39
TnnQ80Z71 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,44■■■■■ 4,38
TnnQ80Z71 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC42,44■■■■■ 4,38
TnnQ80Z71 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,43■■■■■ 4,38
TnnQ80Z71 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,41■■■■■ 4,38
TnnQ80Z71 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,41■■■■■ 4,38
TnnQ80Z71 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC42,39■■■■■ 4,38
TnnQ80Z71 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42,39■■■■■ 4,38
TnnQ80Z71 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC42,39■■■■■ 4,38
TnnQ80Z71 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42,39■■■■■ 4,38
TnnQ80Z71 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,37■■■■■ 4,37
TnnQ80Z71 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42,36■■■■■ 4,37
TnnQ80Z71 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42,36■■■■■ 4,37
TnnQ80Z71 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC42,35■■■■■ 4,37
TnnQ80Z71 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42,34■■■■■ 4,37
TnnQ80Z71 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,32■■■■■ 4,36
TnnQ80Z71 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC42,31■■■■■ 4,36
TnnQ80Z71 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC42,31■■■■■ 4,36
TnnQ80Z71 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC42,29■■■■■ 4,36
TnnQ80Z71 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC42,27■■■■■ 4,36
TnnQ80Z71 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,26■■■■■ 4,35
TnnQ80Z71 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC42,24■■■■■ 4,35
TnnQ80Z71 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42,23■■■■■ 4,35
TnnQ80Z71 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42,22■■■■■ 4,35
TnnQ80Z71 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC42,2■■■■■ 4,35
TnnQ80Z71 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC42,16■■■■■ 4,34
TnnQ80Z71 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC42,16■■■■■ 4,34
TnnQ80Z71 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC42,13■■■■■ 4,34
TnnQ80Z71 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC42,13■■■■■ 4,33
TnnQ80Z71 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC42,13■■■■■ 4,33
TnnQ80Z71 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC42,11■■■■■ 4,33
TnnQ80Z71 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,11■■■■■ 4,33
TnnQ80Z71 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC42,08■■■■■ 4,33
TnnQ80Z71 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42,07■■■■■ 4,33
TnnQ80Z71 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC42,07■■■■■ 4,32
TnnQ80Z71 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC42,05■■■■■ 4,32
TnnQ80Z71 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC42,05■■■■■ 4,32
TnnQ80Z71 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC42,03■■■■■ 4,32
TnnQ80Z71 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42,03■■■■■ 4,32
TnnQ80Z71 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42,03■■■■■ 4,32
TnnQ80Z71 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,01■■■■■ 4,32
TnnQ80Z71 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC42,01■■■■■ 4,32
TnnQ80Z71 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC42,01■■■■■ 4,32
TnnQ80Z71 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4,31
TnnQ80Z71 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC41,99■■■■■ 4,31
TnnQ80Z71 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41,97■■■■■ 4,31
TnnQ80Z71 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,96■■■■■ 4,31
TnnQ80Z71 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC41,94■■■■■ 4,3
TnnQ80Z71 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC41,94■■■■■ 4,3
TnnQ80Z71 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,94■■■■■ 4,3
TnnQ80Z71 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC41,93■■■■■ 4,3
TnnQ80Z71 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC41,93■■■■■ 4,3
TnnQ80Z71 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC41,92■■■■■ 4,3
TnnQ80Z71 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC41,9■■■■■ 4,3
TnnQ80Z71 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC41,89■■■■■ 4,3
TnnQ80Z71 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC41,89■■■■■ 4,3
TnnQ80Z71 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC41,88■■■■■ 4,3
TnnQ80Z71 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC41,88■■■■■ 4,29
TnnQ80Z71 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC41,87■■■■■ 4,29
TnnQ80Z71 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,86■■■■■ 4,29
TnnQ80Z71 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,85■■■■■ 4,29
TnnQ80Z71 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC41,84■■■■■ 4,29
TnnQ80Z71 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41,84■■■■■ 4,29
TnnQ80Z71 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,84■■■■■ 4,29
TnnQ80Z71 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC41,84■■■■■ 4,29
TnnQ80Z71 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC41,84■■■■■ 4,29
TnnQ80Z71 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,81■■■■■ 4,28
TnnQ80Z71 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC41,81■■■■■ 4,28
TnnQ80Z71 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC41,79■■■■■ 4,28
TnnQ80Z71 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC41,78■■■■■ 4,28
TnnQ80Z71 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC41,77■■■■■ 4,28
TnnQ80Z71 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,76■■■■■ 4,28
TnnQ80Z71 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC41,76■■■■■ 4,28
TnnQ80Z71 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,76■■■■■ 4,28
TnnQ80Z71 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,76■■■■■ 4,28
TnnQ80Z71 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC41,76■■■■■ 4,27
TnnQ80Z71 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC41,74■■■■■ 4,27
TnnQ80Z71 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC41,73■■■■■ 4,27
TnnQ80Z71 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC41,71■■■■■ 4,27
TnnQ80Z71 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC41,7■■■■■ 4,27
TnnQ80Z71 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC41,7■■■■■ 4,27
TnnQ80Z71 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC41,68■■■■■ 4,26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms