Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z71

Tnn, Tenascin-N, mousemouse

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnnQ80Z71 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC42.58■■■■■ 4.41
TnnQ80Z71 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
TnnQ80Z71 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
TnnQ80Z71 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.54■■■■■ 4.4
TnnQ80Z71 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.54■■■■■ 4.4
TnnQ80Z71 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC42.54■■■■■ 4.4
TnnQ80Z71 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC42.53■■■■■ 4.4
TnnQ80Z71 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.52■■■■■ 4.4
TnnQ80Z71 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC42.52■■■■■ 4.4
TnnQ80Z71 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.52■■■■■ 4.4
TnnQ80Z71 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.51■■■■■ 4.4
TnnQ80Z71 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.5■■■■■ 4.39
TnnQ80Z71 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC42.5■■■■■ 4.39
TnnQ80Z71 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.5■■■■■ 4.39
TnnQ80Z71 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
TnnQ80Z71 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.47■■■■■ 4.39
TnnQ80Z71 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC42.47■■■■■ 4.39
TnnQ80Z71 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC42.47■■■■■ 4.39
TnnQ80Z71 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
TnnQ80Z71 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.44■■■■■ 4.38
TnnQ80Z71 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC42.44■■■■■ 4.38
TnnQ80Z71 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
TnnQ80Z71 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.41■■■■■ 4.38
TnnQ80Z71 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.41■■■■■ 4.38
TnnQ80Z71 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
TnnQ80Z71 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
TnnQ80Z71 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC42.39■■■■■ 4.38
TnnQ80Z71 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
TnnQ80Z71 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
TnnQ80Z71 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
TnnQ80Z71 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.36■■■■■ 4.37
TnnQ80Z71 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC42.35■■■■■ 4.37
TnnQ80Z71 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
TnnQ80Z71 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.32■■■■■ 4.36
TnnQ80Z71 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
TnnQ80Z71 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
TnnQ80Z71 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
TnnQ80Z71 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
TnnQ80Z71 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.26■■■■■ 4.35
TnnQ80Z71 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC42.24■■■■■ 4.35
TnnQ80Z71 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.23■■■■■ 4.35
TnnQ80Z71 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.22■■■■■ 4.35
TnnQ80Z71 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
TnnQ80Z71 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
TnnQ80Z71 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC42.16■■■■■ 4.34
TnnQ80Z71 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.34
TnnQ80Z71 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC42.13■■■■■ 4.33
TnnQ80Z71 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.33
TnnQ80Z71 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC42.11■■■■■ 4.33
TnnQ80Z71 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
TnnQ80Z71 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC42.08■■■■■ 4.33
TnnQ80Z71 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.33
TnnQ80Z71 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.32
TnnQ80Z71 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC42.05■■■■■ 4.32
TnnQ80Z71 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC42.05■■■■■ 4.32
TnnQ80Z71 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
TnnQ80Z71 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
TnnQ80Z71 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
TnnQ80Z71 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
TnnQ80Z71 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC42.01■■■■■ 4.32
TnnQ80Z71 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC42.01■■■■■ 4.32
TnnQ80Z71 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
TnnQ80Z71 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC41.99■■■■■ 4.31
TnnQ80Z71 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
TnnQ80Z71 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
TnnQ80Z71 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC41.94■■■■■ 4.3
TnnQ80Z71 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC41.94■■■■■ 4.3
TnnQ80Z71 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.94■■■■■ 4.3
TnnQ80Z71 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
TnnQ80Z71 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC41.93■■■■■ 4.3
TnnQ80Z71 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
TnnQ80Z71 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC41.9■■■■■ 4.3
TnnQ80Z71 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
TnnQ80Z71 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC41.89■■■■■ 4.3
TnnQ80Z71 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.3
TnnQ80Z71 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC41.88■■■■■ 4.29
TnnQ80Z71 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC41.87■■■■■ 4.29
TnnQ80Z71 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
TnnQ80Z71 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
TnnQ80Z71 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC41.84■■■■■ 4.29
TnnQ80Z71 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
TnnQ80Z71 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
TnnQ80Z71 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC41.84■■■■■ 4.29
TnnQ80Z71 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC41.84■■■■■ 4.29
TnnQ80Z71 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
TnnQ80Z71 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC41.81■■■■■ 4.28
TnnQ80Z71 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
TnnQ80Z71 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
TnnQ80Z71 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC41.77■■■■■ 4.28
TnnQ80Z71 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
TnnQ80Z71 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC41.76■■■■■ 4.28
TnnQ80Z71 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
TnnQ80Z71 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
TnnQ80Z71 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC41.76■■■■■ 4.27
TnnQ80Z71 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC41.74■■■■■ 4.27
TnnQ80Z71 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
TnnQ80Z71 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC41.71■■■■■ 4.27
TnnQ80Z71 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
TnnQ80Z71 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
TnnQ80Z71 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms