Protein–RNA interactions for Protein: Q80YG3

Klhdc1, Kelch domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc1Q80YG3 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,08■□□□□ 0,97
Klhdc1Q80YG3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21,08■□□□□ 0,97
Klhdc1Q80YG3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21,08■□□□□ 0,97
Klhdc1Q80YG3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21,08■□□□□ 0,97
Klhdc1Q80YG3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,08■□□□□ 0,97
Klhdc1Q80YG3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21,07■□□□□ 0,96
Klhdc1Q80YG3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,06■□□□□ 0,96
Klhdc1Q80YG3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,06■□□□□ 0,96
Klhdc1Q80YG3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21,06■□□□□ 0,96
Klhdc1Q80YG3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21,06■□□□□ 0,96
Klhdc1Q80YG3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,05■□□□□ 0,96
Klhdc1Q80YG3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,05■□□□□ 0,96
Klhdc1Q80YG3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,04■□□□□ 0,96
Klhdc1Q80YG3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21,04■□□□□ 0,96
Klhdc1Q80YG3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,04■□□□□ 0,96
Klhdc1Q80YG3 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC21,04■□□□□ 0,96
Klhdc1Q80YG3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,03■□□□□ 0,96
Klhdc1Q80YG3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21,03■□□□□ 0,96
Klhdc1Q80YG3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21,03■□□□□ 0,96
Klhdc1Q80YG3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,03■□□□□ 0,96
Klhdc1Q80YG3 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,03■□□□□ 0,96
Klhdc1Q80YG3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21,02■□□□□ 0,96
Klhdc1Q80YG3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21,02■□□□□ 0,96
Klhdc1Q80YG3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21,01■□□□□ 0,95
Klhdc1Q80YG3 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0,95
Klhdc1Q80YG3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0,95
Klhdc1Q80YG3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0,95
Klhdc1Q80YG3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0,95
Klhdc1Q80YG3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20,99■□□□□ 0,95
Klhdc1Q80YG3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20,99■□□□□ 0,95
Klhdc1Q80YG3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20,98■□□□□ 0,95
Klhdc1Q80YG3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20,97■□□□□ 0,95
Klhdc1Q80YG3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,97■□□□□ 0,95
Klhdc1Q80YG3 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20,96■□□□□ 0,95
Klhdc1Q80YG3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20,96■□□□□ 0,95
Klhdc1Q80YG3 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,95■□□□□ 0,94
Klhdc1Q80YG3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20,95■□□□□ 0,94
Klhdc1Q80YG3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,95■□□□□ 0,94
Klhdc1Q80YG3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,94■□□□□ 0,94
Klhdc1Q80YG3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20,94■□□□□ 0,94
Klhdc1Q80YG3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20,94■□□□□ 0,94
Klhdc1Q80YG3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC20,94■□□□□ 0,94
Klhdc1Q80YG3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,93■□□□□ 0,94
Klhdc1Q80YG3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,93■□□□□ 0,94
Klhdc1Q80YG3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20,92■□□□□ 0,94
Klhdc1Q80YG3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,92■□□□□ 0,94
Klhdc1Q80YG3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,9■□□□□ 0,94
Klhdc1Q80YG3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20,89■□□□□ 0,93
Klhdc1Q80YG3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,89■□□□□ 0,93
Klhdc1Q80YG3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,88■□□□□ 0,93
Klhdc1Q80YG3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20,88■□□□□ 0,93
Klhdc1Q80YG3 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20,88■□□□□ 0,93
Klhdc1Q80YG3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20,87■□□□□ 0,93
Klhdc1Q80YG3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20,87■□□□□ 0,93
Klhdc1Q80YG3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,87■□□□□ 0,93
Klhdc1Q80YG3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,86■□□□□ 0,93
Klhdc1Q80YG3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20,86■□□□□ 0,93
Klhdc1Q80YG3 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,85■□□□□ 0,93
Klhdc1Q80YG3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20,85■□□□□ 0,93
Klhdc1Q80YG3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20,83■□□□□ 0,93
Klhdc1Q80YG3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20,83■□□□□ 0,93
Klhdc1Q80YG3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20,82■□□□□ 0,92
Klhdc1Q80YG3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20,82■□□□□ 0,92
Klhdc1Q80YG3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,81■□□□□ 0,92
Klhdc1Q80YG3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20,81■□□□□ 0,92
Klhdc1Q80YG3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20,81■□□□□ 0,92
Klhdc1Q80YG3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,8■□□□□ 0,92
Klhdc1Q80YG3 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,8■□□□□ 0,92
Klhdc1Q80YG3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20,8■□□□□ 0,92
Klhdc1Q80YG3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20,8■□□□□ 0,92
Klhdc1Q80YG3 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,79■□□□□ 0,92
Klhdc1Q80YG3 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20,79■□□□□ 0,92
Klhdc1Q80YG3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20,79■□□□□ 0,92
Klhdc1Q80YG3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20,79■□□□□ 0,92
Klhdc1Q80YG3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,79■□□□□ 0,92
Klhdc1Q80YG3 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,78■□□□□ 0,92
Klhdc1Q80YG3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20,78■□□□□ 0,92
Klhdc1Q80YG3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,77■□□□□ 0,92
Klhdc1Q80YG3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20,77■□□□□ 0,92
Klhdc1Q80YG3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20,77■□□□□ 0,92
Klhdc1Q80YG3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20,77■□□□□ 0,92
Klhdc1Q80YG3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC20,77■□□□□ 0,91
Klhdc1Q80YG3 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,76■□□□□ 0,91
Klhdc1Q80YG3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20,75■□□□□ 0,91
Klhdc1Q80YG3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20,75■□□□□ 0,91
Klhdc1Q80YG3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,74■□□□□ 0,91
Klhdc1Q80YG3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,73■□□□□ 0,91
Klhdc1Q80YG3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20,72■□□□□ 0,91
Klhdc1Q80YG3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20,72■□□□□ 0,91
Klhdc1Q80YG3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20,72■□□□□ 0,91
Klhdc1Q80YG3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,72■□□□□ 0,91
Klhdc1Q80YG3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20,72■□□□□ 0,91
Klhdc1Q80YG3 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,72■□□□□ 0,91
Klhdc1Q80YG3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20,71■□□□□ 0,91
Klhdc1Q80YG3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,71■□□□□ 0,91
Klhdc1Q80YG3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20,7■□□□□ 0,91
Klhdc1Q80YG3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,7■□□□□ 0,9
Klhdc1Q80YG3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20,7■□□□□ 0,9
Klhdc1Q80YG3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,7■□□□□ 0,9
Klhdc1Q80YG3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,69■□□□□ 0,9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15,8 ms