Protein–RNA interactions for Protein: Q80W37

Snupn, Snurportin-1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnupnQ80W37 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SnupnQ80W37 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SnupnQ80W37 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SnupnQ80W37 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SnupnQ80W37 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SnupnQ80W37 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SnupnQ80W37 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SnupnQ80W37 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SnupnQ80W37 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SnupnQ80W37 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SnupnQ80W37 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SnupnQ80W37 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SnupnQ80W37 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SnupnQ80W37 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SnupnQ80W37 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SnupnQ80W37 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SnupnQ80W37 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SnupnQ80W37 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SnupnQ80W37 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SnupnQ80W37 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SnupnQ80W37 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SnupnQ80W37 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SnupnQ80W37 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SnupnQ80W37 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SnupnQ80W37 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SnupnQ80W37 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SnupnQ80W37 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SnupnQ80W37 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SnupnQ80W37 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SnupnQ80W37 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SnupnQ80W37 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SnupnQ80W37 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SnupnQ80W37 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SnupnQ80W37 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SnupnQ80W37 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SnupnQ80W37 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SnupnQ80W37 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SnupnQ80W37 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SnupnQ80W37 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SnupnQ80W37 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SnupnQ80W37 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SnupnQ80W37 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SnupnQ80W37 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SnupnQ80W37 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SnupnQ80W37 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SnupnQ80W37 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SnupnQ80W37 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
SnupnQ80W37 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SnupnQ80W37 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SnupnQ80W37 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SnupnQ80W37 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SnupnQ80W37 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SnupnQ80W37 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SnupnQ80W37 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SnupnQ80W37 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SnupnQ80W37 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SnupnQ80W37 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SnupnQ80W37 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SnupnQ80W37 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SnupnQ80W37 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SnupnQ80W37 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SnupnQ80W37 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SnupnQ80W37 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SnupnQ80W37 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SnupnQ80W37 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SnupnQ80W37 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SnupnQ80W37 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SnupnQ80W37 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SnupnQ80W37 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SnupnQ80W37 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SnupnQ80W37 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SnupnQ80W37 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SnupnQ80W37 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SnupnQ80W37 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SnupnQ80W37 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SnupnQ80W37 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SnupnQ80W37 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SnupnQ80W37 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SnupnQ80W37 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SnupnQ80W37 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SnupnQ80W37 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SnupnQ80W37 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SnupnQ80W37 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SnupnQ80W37 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SnupnQ80W37 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SnupnQ80W37 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SnupnQ80W37 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SnupnQ80W37 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SnupnQ80W37 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SnupnQ80W37 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SnupnQ80W37 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SnupnQ80W37 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SnupnQ80W37 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SnupnQ80W37 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SnupnQ80W37 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SnupnQ80W37 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SnupnQ80W37 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SnupnQ80W37 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SnupnQ80W37 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SnupnQ80W37 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms