Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC54.52■■■■■ 6.32
NischQ80TM9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC54.51■■■■■ 6.32
NischQ80TM9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC54.5■■■■■ 6.31
NischQ80TM9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC54.49■■■■■ 6.31
NischQ80TM9 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.48■■■■■ 6.31
NischQ80TM9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.46■■■■■ 6.31
NischQ80TM9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC54.46■■■■■ 6.31
NischQ80TM9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC54.46■■■■■ 6.31
NischQ80TM9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC54.46■■■■■ 6.31
NischQ80TM9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC54.46■■■■■ 6.31
NischQ80TM9 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC54.46■■■■■ 6.31
NischQ80TM9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC54.45■■■■■ 6.31
NischQ80TM9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC54.43■■■■■ 6.3
NischQ80TM9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC54.4■■■■■ 6.3
NischQ80TM9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.4■■■■■ 6.3
NischQ80TM9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC54.4■■■■■ 6.3
NischQ80TM9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC54.39■■■■■ 6.3
NischQ80TM9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC54.39■■■■■ 6.3
NischQ80TM9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC54.38■■■■■ 6.3
NischQ80TM9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.34■■■■■ 6.29
NischQ80TM9 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.34■■■■■ 6.29
NischQ80TM9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC54.32■■■■■ 6.29
NischQ80TM9 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.29■■■■■ 6.28
NischQ80TM9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC54.29■■■■■ 6.28
NischQ80TM9 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC54.29■■■■■ 6.28
NischQ80TM9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.26■■■■■ 6.28
NischQ80TM9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.26■■■■■ 6.28
NischQ80TM9 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC54.25■■■■■ 6.28
NischQ80TM9 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC54.25■■■■■ 6.27
NischQ80TM9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.22■■■■■ 6.27
NischQ80TM9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC54.22■■■■■ 6.27
NischQ80TM9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.21■■■■■ 6.27
NischQ80TM9 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC54.21■■■■■ 6.27
NischQ80TM9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC54.18■■■■■ 6.26
NischQ80TM9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC54.17■■■■■ 6.26
NischQ80TM9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC54.17■■■■■ 6.26
NischQ80TM9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC54.16■■■■■ 6.26
NischQ80TM9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC54.16■■■■■ 6.26
NischQ80TM9 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.13■■■■■ 6.26
NischQ80TM9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC54.1■■■■■ 6.25
NischQ80TM9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC54.1■■■■■ 6.25
NischQ80TM9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC54.03■■■■■ 6.24
NischQ80TM9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC54■■■■■ 6.23
NischQ80TM9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.98■■■■■ 6.23
NischQ80TM9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC53.98■■■■■ 6.23
NischQ80TM9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC53.97■■■■■ 6.23
NischQ80TM9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC53.97■■■■■ 6.23
NischQ80TM9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC53.95■■■■■ 6.23
NischQ80TM9 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC53.93■■■■■ 6.22
NischQ80TM9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC53.93■■■■■ 6.22
NischQ80TM9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC53.92■■■■■ 6.22
NischQ80TM9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC53.91■■■■■ 6.22
NischQ80TM9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC53.91■■■■■ 6.22
NischQ80TM9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC53.89■■■■■ 6.22
NischQ80TM9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC53.88■■■■■ 6.22
NischQ80TM9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC53.85■■■■■ 6.21
NischQ80TM9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC53.84■■■■■ 6.21
NischQ80TM9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC53.84■■■■■ 6.21
NischQ80TM9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC53.82■■■■■ 6.21
NischQ80TM9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC53.81■■■■■ 6.2
NischQ80TM9 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC53.81■■■■■ 6.2
NischQ80TM9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC53.8■■■■■ 6.2
NischQ80TM9 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC53.8■■■■■ 6.2
NischQ80TM9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.79■■■■■ 6.2
NischQ80TM9 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC53.75■■■■■ 6.2
NischQ80TM9 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC53.75■■■■■ 6.2
NischQ80TM9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC53.73■■■■■ 6.19
NischQ80TM9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.71■■■■■ 6.19
NischQ80TM9 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC53.7■■■■■ 6.19
NischQ80TM9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC53.69■■■■■ 6.19
NischQ80TM9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC53.69■■■■■ 6.19
NischQ80TM9 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.69■■■■■ 6.19
NischQ80TM9 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.69■■■■■ 6.19
NischQ80TM9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC53.67■■■■■ 6.18
NischQ80TM9 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC53.67■■■■■ 6.18
NischQ80TM9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC53.67■■■■■ 6.18
NischQ80TM9 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.66■■■■■ 6.18
NischQ80TM9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC53.65■■■■■ 6.18
NischQ80TM9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC53.65■■■■■ 6.18
NischQ80TM9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC53.62■■■■■ 6.17
NischQ80TM9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC53.61■■■■■ 6.17
NischQ80TM9 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.61■■■■■ 6.17
NischQ80TM9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC53.59■■■■■ 6.17
NischQ80TM9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC53.58■■■■■ 6.17
NischQ80TM9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC53.58■■■■■ 6.17
NischQ80TM9 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.57■■■■■ 6.17
NischQ80TM9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.56■■■■■ 6.16
NischQ80TM9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC53.54■■■■■ 6.16
NischQ80TM9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC53.53■■■■■ 6.16
NischQ80TM9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC53.53■■■■■ 6.16
NischQ80TM9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.51■■■■■ 6.16
NischQ80TM9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC53.5■■■■■ 6.15
NischQ80TM9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.49■■■■■ 6.15
NischQ80TM9 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.48■■■■■ 6.15
NischQ80TM9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC53.44■■■■■ 6.15
NischQ80TM9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC53.43■■■■■ 6.14
NischQ80TM9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC53.42■■■■■ 6.14
NischQ80TM9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC53.4■■■■■ 6.14
NischQ80TM9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC53.4■■■■■ 6.14
NischQ80TM9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC53.39■■■■■ 6.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms