Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNB8

Sbno2, Protein strawberry notch homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno2Q7TNB8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Sbno2Q7TNB8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Sbno2Q7TNB8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Sbno2Q7TNB8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Sbno2Q7TNB8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Sbno2Q7TNB8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Sbno2Q7TNB8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Sbno2Q7TNB8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Sbno2Q7TNB8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Sbno2Q7TNB8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Sbno2Q7TNB8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Sbno2Q7TNB8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Sbno2Q7TNB8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Sbno2Q7TNB8 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Sbno2Q7TNB8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Sbno2Q7TNB8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Sbno2Q7TNB8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Sbno2Q7TNB8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Sbno2Q7TNB8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Sbno2Q7TNB8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Sbno2Q7TNB8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Sbno2Q7TNB8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Sbno2Q7TNB8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Sbno2Q7TNB8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Sbno2Q7TNB8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Sbno2Q7TNB8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Sbno2Q7TNB8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Sbno2Q7TNB8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Sbno2Q7TNB8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Sbno2Q7TNB8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Sbno2Q7TNB8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Sbno2Q7TNB8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Sbno2Q7TNB8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Sbno2Q7TNB8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Sbno2Q7TNB8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Sbno2Q7TNB8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Sbno2Q7TNB8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Sbno2Q7TNB8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Sbno2Q7TNB8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Sbno2Q7TNB8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Sbno2Q7TNB8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Sbno2Q7TNB8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Sbno2Q7TNB8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Sbno2Q7TNB8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Sbno2Q7TNB8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Sbno2Q7TNB8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Sbno2Q7TNB8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Sbno2Q7TNB8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Sbno2Q7TNB8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Sbno2Q7TNB8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Sbno2Q7TNB8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Sbno2Q7TNB8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Sbno2Q7TNB8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Sbno2Q7TNB8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Sbno2Q7TNB8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Sbno2Q7TNB8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Sbno2Q7TNB8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Sbno2Q7TNB8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Sbno2Q7TNB8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Sbno2Q7TNB8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Sbno2Q7TNB8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Sbno2Q7TNB8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Sbno2Q7TNB8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Sbno2Q7TNB8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Sbno2Q7TNB8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Sbno2Q7TNB8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Sbno2Q7TNB8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Sbno2Q7TNB8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Sbno2Q7TNB8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Sbno2Q7TNB8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Sbno2Q7TNB8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Sbno2Q7TNB8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Sbno2Q7TNB8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Sbno2Q7TNB8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Sbno2Q7TNB8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Sbno2Q7TNB8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Sbno2Q7TNB8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Sbno2Q7TNB8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Sbno2Q7TNB8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Sbno2Q7TNB8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Sbno2Q7TNB8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Sbno2Q7TNB8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Sbno2Q7TNB8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Sbno2Q7TNB8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Sbno2Q7TNB8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Sbno2Q7TNB8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Sbno2Q7TNB8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
Sbno2Q7TNB8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Sbno2Q7TNB8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Sbno2Q7TNB8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Sbno2Q7TNB8 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Sbno2Q7TNB8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Sbno2Q7TNB8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Sbno2Q7TNB8 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Sbno2Q7TNB8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Sbno2Q7TNB8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Sbno2Q7TNB8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Sbno2Q7TNB8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Sbno2Q7TNB8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Sbno2Q7TNB8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms