Protein–RNA interactions for Protein: Q78JE5

Fbxo22, F-box only protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo22Q78JE5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Fbxo22Q78JE5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Fbxo22Q78JE5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Fbxo22Q78JE5 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Fbxo22Q78JE5 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Fbxo22Q78JE5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Fbxo22Q78JE5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Fbxo22Q78JE5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Fbxo22Q78JE5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Fbxo22Q78JE5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Fbxo22Q78JE5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Fbxo22Q78JE5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Fbxo22Q78JE5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fbxo22Q78JE5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fbxo22Q78JE5 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fbxo22Q78JE5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fbxo22Q78JE5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fbxo22Q78JE5 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Fbxo22Q78JE5 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Fbxo22Q78JE5 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Fbxo22Q78JE5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Fbxo22Q78JE5 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Fbxo22Q78JE5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Fbxo22Q78JE5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Fbxo22Q78JE5 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Fbxo22Q78JE5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Fbxo22Q78JE5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fbxo22Q78JE5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fbxo22Q78JE5 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fbxo22Q78JE5 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Fbxo22Q78JE5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Fbxo22Q78JE5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fbxo22Q78JE5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fbxo22Q78JE5 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fbxo22Q78JE5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fbxo22Q78JE5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fbxo22Q78JE5 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Fbxo22Q78JE5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fbxo22Q78JE5 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fbxo22Q78JE5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fbxo22Q78JE5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fbxo22Q78JE5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fbxo22Q78JE5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fbxo22Q78JE5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fbxo22Q78JE5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Fbxo22Q78JE5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fbxo22Q78JE5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fbxo22Q78JE5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fbxo22Q78JE5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fbxo22Q78JE5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fbxo22Q78JE5 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fbxo22Q78JE5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fbxo22Q78JE5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fbxo22Q78JE5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fbxo22Q78JE5 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fbxo22Q78JE5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fbxo22Q78JE5 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fbxo22Q78JE5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Fbxo22Q78JE5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fbxo22Q78JE5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fbxo22Q78JE5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fbxo22Q78JE5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fbxo22Q78JE5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fbxo22Q78JE5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fbxo22Q78JE5 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fbxo22Q78JE5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Fbxo22Q78JE5 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fbxo22Q78JE5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fbxo22Q78JE5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fbxo22Q78JE5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fbxo22Q78JE5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fbxo22Q78JE5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fbxo22Q78JE5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fbxo22Q78JE5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fbxo22Q78JE5 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fbxo22Q78JE5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fbxo22Q78JE5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fbxo22Q78JE5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Fbxo22Q78JE5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fbxo22Q78JE5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fbxo22Q78JE5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fbxo22Q78JE5 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fbxo22Q78JE5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fbxo22Q78JE5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fbxo22Q78JE5 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fbxo22Q78JE5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fbxo22Q78JE5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fbxo22Q78JE5 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fbxo22Q78JE5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fbxo22Q78JE5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fbxo22Q78JE5 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fbxo22Q78JE5 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fbxo22Q78JE5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Fbxo22Q78JE5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fbxo22Q78JE5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fbxo22Q78JE5 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fbxo22Q78JE5 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fbxo22Q78JE5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fbxo22Q78JE5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fbxo22Q78JE5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms