Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,04■■■■□ 3,52
Topbp1Q6ZQF0 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC37,03■■■■□ 3,52
Topbp1Q6ZQF0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC37,03■■■■□ 3,52
Topbp1Q6ZQF0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC37,02■■■■□ 3,52
Topbp1Q6ZQF0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC37,01■■■■□ 3,52
Topbp1Q6ZQF0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37■■■■□ 3,51
Topbp1Q6ZQF0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3,51
Topbp1Q6ZQF0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3,51
Topbp1Q6ZQF0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36,99■■■■□ 3,51
Topbp1Q6ZQF0 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,99■■■■□ 3,51
Topbp1Q6ZQF0 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC36,98■■■■□ 3,51
Topbp1Q6ZQF0 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC36,97■■■■□ 3,51
Topbp1Q6ZQF0 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC36,96■■■■□ 3,51
Topbp1Q6ZQF0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,95■■■■□ 3,51
Topbp1Q6ZQF0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36,95■■■■□ 3,51
Topbp1Q6ZQF0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,93■■■■□ 3,5
Topbp1Q6ZQF0 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,93■■■■□ 3,5
Topbp1Q6ZQF0 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC36,92■■■■□ 3,5
Topbp1Q6ZQF0 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,92■■■■□ 3,5
Topbp1Q6ZQF0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,91■■■■□ 3,5
Topbp1Q6ZQF0 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36,9■■■■□ 3,5
Topbp1Q6ZQF0 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC36,9■■■■□ 3,5
Topbp1Q6ZQF0 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC36,9■■■■□ 3,5
Topbp1Q6ZQF0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36,89■■■■□ 3,5
Topbp1Q6ZQF0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36,89■■■■□ 3,5
Topbp1Q6ZQF0 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC36,88■■■■□ 3,49
Topbp1Q6ZQF0 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,87■■■■□ 3,49
Topbp1Q6ZQF0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,87■■■■□ 3,49
Topbp1Q6ZQF0 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC36,85■■■■□ 3,49
Topbp1Q6ZQF0 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC36,85■■■■□ 3,49
Topbp1Q6ZQF0 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC36,85■■■■□ 3,49
Topbp1Q6ZQF0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,84■■■■□ 3,49
Topbp1Q6ZQF0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36,84■■■■□ 3,49
Topbp1Q6ZQF0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,84■■■■□ 3,49
Topbp1Q6ZQF0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,79■■■■□ 3,48
Topbp1Q6ZQF0 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,79■■■■□ 3,48
Topbp1Q6ZQF0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC36,79■■■■□ 3,48
Topbp1Q6ZQF0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC36,78■■■■□ 3,48
Topbp1Q6ZQF0 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36,75■■■■□ 3,47
Topbp1Q6ZQF0 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC36,75■■■■□ 3,47
Topbp1Q6ZQF0 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,73■■■■□ 3,47
Topbp1Q6ZQF0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC36,7■■■■□ 3,47
Topbp1Q6ZQF0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC36,68■■■■□ 3,46
Topbp1Q6ZQF0 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36,68■■■■□ 3,46
Topbp1Q6ZQF0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC36,67■■■■□ 3,46
Topbp1Q6ZQF0 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC36,66■■■■□ 3,46
Topbp1Q6ZQF0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC36,66■■■■□ 3,46
Topbp1Q6ZQF0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC36,63■■■■□ 3,45
Topbp1Q6ZQF0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC36,62■■■■□ 3,45
Topbp1Q6ZQF0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC36,62■■■■□ 3,45
Topbp1Q6ZQF0 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,61■■■■□ 3,45
Topbp1Q6ZQF0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC36,6■■■■□ 3,45
Topbp1Q6ZQF0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,6■■■■□ 3,45
Topbp1Q6ZQF0 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36,59■■■■□ 3,45
Topbp1Q6ZQF0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC36,58■■■■□ 3,45
Topbp1Q6ZQF0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36,56■■■■□ 3,44
Topbp1Q6ZQF0 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,55■■■■□ 3,44
Topbp1Q6ZQF0 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC36,55■■■■□ 3,44
Topbp1Q6ZQF0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC36,55■■■■□ 3,44
Topbp1Q6ZQF0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC36,54■■■■□ 3,44
Topbp1Q6ZQF0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC36,53■■■■□ 3,44
Topbp1Q6ZQF0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,51■■■■□ 3,44
Topbp1Q6ZQF0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC36,5■■■■□ 3,43
Topbp1Q6ZQF0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC36,5■■■■□ 3,43
Topbp1Q6ZQF0 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,5■■■■□ 3,43
Topbp1Q6ZQF0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36,5■■■■□ 3,43
Topbp1Q6ZQF0 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,49■■■■□ 3,43
Topbp1Q6ZQF0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC36,47■■■■□ 3,43
Topbp1Q6ZQF0 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC36,47■■■■□ 3,43
Topbp1Q6ZQF0 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC36,45■■■■□ 3,43
Topbp1Q6ZQF0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36,45■■■■□ 3,43
Topbp1Q6ZQF0 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,45■■■■□ 3,43
Topbp1Q6ZQF0 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC36,45■■■■□ 3,42
Topbp1Q6ZQF0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC36,45■■■■□ 3,42
Topbp1Q6ZQF0 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC36,44■■■■□ 3,42
Topbp1Q6ZQF0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC36,43■■■■□ 3,42
Topbp1Q6ZQF0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC36,43■■■■□ 3,42
Topbp1Q6ZQF0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,42■■■■□ 3,42
Topbp1Q6ZQF0 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC36,42■■■■□ 3,42
Topbp1Q6ZQF0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,41■■■■□ 3,42
Topbp1Q6ZQF0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC36,4■■■■□ 3,42
Topbp1Q6ZQF0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,4■■■■□ 3,42
Topbp1Q6ZQF0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC36,39■■■■□ 3,42
Topbp1Q6ZQF0 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC36,38■■■■□ 3,41
Topbp1Q6ZQF0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC36,38■■■■□ 3,41
Topbp1Q6ZQF0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC36,37■■■■□ 3,41
Topbp1Q6ZQF0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,36■■■■□ 3,41
Topbp1Q6ZQF0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC36,36■■■■□ 3,41
Topbp1Q6ZQF0 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,35■■■■□ 3,41
Topbp1Q6ZQF0 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC36,34■■■■□ 3,41
Topbp1Q6ZQF0 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC36,34■■■■□ 3,41
Topbp1Q6ZQF0 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC36,31■■■■□ 3,4
Topbp1Q6ZQF0 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC36,3■■■■□ 3,4
Topbp1Q6ZQF0 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,3■■■■□ 3,4
Topbp1Q6ZQF0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC36,3■■■■□ 3,4
Topbp1Q6ZQF0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC36,29■■■■□ 3,4
Topbp1Q6ZQF0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC36,29■■■■□ 3,4
Topbp1Q6ZQF0 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,28■■■■□ 3,4
Topbp1Q6ZQF0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC36,28■■■■□ 3,4
Topbp1Q6ZQF0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36,27■■■■□ 3,4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,4 ms