Protein–RNA interactions for Protein: Q6V4S5

Sdk2, Protein sidekick-2, mousemouse

Predictions only

Length 2,176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdk2Q6V4S5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sdk2Q6V4S5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sdk2Q6V4S5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sdk2Q6V4S5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Sdk2Q6V4S5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Sdk2Q6V4S5 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sdk2Q6V4S5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sdk2Q6V4S5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sdk2Q6V4S5 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sdk2Q6V4S5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sdk2Q6V4S5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sdk2Q6V4S5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sdk2Q6V4S5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sdk2Q6V4S5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sdk2Q6V4S5 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Sdk2Q6V4S5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sdk2Q6V4S5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sdk2Q6V4S5 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sdk2Q6V4S5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sdk2Q6V4S5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sdk2Q6V4S5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sdk2Q6V4S5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sdk2Q6V4S5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sdk2Q6V4S5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sdk2Q6V4S5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sdk2Q6V4S5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sdk2Q6V4S5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sdk2Q6V4S5 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sdk2Q6V4S5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sdk2Q6V4S5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sdk2Q6V4S5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sdk2Q6V4S5 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sdk2Q6V4S5 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sdk2Q6V4S5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sdk2Q6V4S5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sdk2Q6V4S5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sdk2Q6V4S5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Sdk2Q6V4S5 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sdk2Q6V4S5 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sdk2Q6V4S5 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sdk2Q6V4S5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sdk2Q6V4S5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sdk2Q6V4S5 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sdk2Q6V4S5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sdk2Q6V4S5 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sdk2Q6V4S5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sdk2Q6V4S5 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sdk2Q6V4S5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sdk2Q6V4S5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sdk2Q6V4S5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Sdk2Q6V4S5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sdk2Q6V4S5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sdk2Q6V4S5 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sdk2Q6V4S5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Sdk2Q6V4S5 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sdk2Q6V4S5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sdk2Q6V4S5 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sdk2Q6V4S5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sdk2Q6V4S5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sdk2Q6V4S5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sdk2Q6V4S5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sdk2Q6V4S5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sdk2Q6V4S5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sdk2Q6V4S5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sdk2Q6V4S5 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sdk2Q6V4S5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Sdk2Q6V4S5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sdk2Q6V4S5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sdk2Q6V4S5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sdk2Q6V4S5 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sdk2Q6V4S5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sdk2Q6V4S5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sdk2Q6V4S5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sdk2Q6V4S5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sdk2Q6V4S5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sdk2Q6V4S5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sdk2Q6V4S5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sdk2Q6V4S5 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sdk2Q6V4S5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sdk2Q6V4S5 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sdk2Q6V4S5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sdk2Q6V4S5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sdk2Q6V4S5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sdk2Q6V4S5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Sdk2Q6V4S5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sdk2Q6V4S5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sdk2Q6V4S5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sdk2Q6V4S5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sdk2Q6V4S5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sdk2Q6V4S5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sdk2Q6V4S5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sdk2Q6V4S5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sdk2Q6V4S5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sdk2Q6V4S5 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sdk2Q6V4S5 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sdk2Q6V4S5 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sdk2Q6V4S5 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sdk2Q6V4S5 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sdk2Q6V4S5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sdk2Q6V4S5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms