Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCX9

Trim37, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM37, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim37Q6PCX9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Trim37Q6PCX9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Trim37Q6PCX9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Trim37Q6PCX9 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Trim37Q6PCX9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Trim37Q6PCX9 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Trim37Q6PCX9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Trim37Q6PCX9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Trim37Q6PCX9 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Trim37Q6PCX9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Trim37Q6PCX9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Trim37Q6PCX9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Trim37Q6PCX9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Trim37Q6PCX9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Trim37Q6PCX9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Trim37Q6PCX9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Trim37Q6PCX9 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Trim37Q6PCX9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Trim37Q6PCX9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Trim37Q6PCX9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Trim37Q6PCX9 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Trim37Q6PCX9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Trim37Q6PCX9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Trim37Q6PCX9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Trim37Q6PCX9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Trim37Q6PCX9 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Trim37Q6PCX9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Trim37Q6PCX9 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Trim37Q6PCX9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Trim37Q6PCX9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Trim37Q6PCX9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Trim37Q6PCX9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Trim37Q6PCX9 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Trim37Q6PCX9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Trim37Q6PCX9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Trim37Q6PCX9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Trim37Q6PCX9 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Trim37Q6PCX9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Trim37Q6PCX9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Trim37Q6PCX9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Trim37Q6PCX9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Trim37Q6PCX9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Trim37Q6PCX9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Trim37Q6PCX9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Trim37Q6PCX9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Trim37Q6PCX9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Trim37Q6PCX9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Trim37Q6PCX9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Trim37Q6PCX9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Trim37Q6PCX9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Trim37Q6PCX9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Trim37Q6PCX9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Trim37Q6PCX9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Trim37Q6PCX9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Trim37Q6PCX9 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Trim37Q6PCX9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Trim37Q6PCX9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Trim37Q6PCX9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Trim37Q6PCX9 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Trim37Q6PCX9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Trim37Q6PCX9 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Trim37Q6PCX9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Trim37Q6PCX9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Trim37Q6PCX9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Trim37Q6PCX9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Trim37Q6PCX9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Trim37Q6PCX9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Trim37Q6PCX9 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Trim37Q6PCX9 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Trim37Q6PCX9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Trim37Q6PCX9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Trim37Q6PCX9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Trim37Q6PCX9 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Trim37Q6PCX9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Trim37Q6PCX9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Trim37Q6PCX9 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Trim37Q6PCX9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Trim37Q6PCX9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Trim37Q6PCX9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Trim37Q6PCX9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Trim37Q6PCX9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Trim37Q6PCX9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Trim37Q6PCX9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Trim37Q6PCX9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Trim37Q6PCX9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Trim37Q6PCX9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Trim37Q6PCX9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Trim37Q6PCX9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Trim37Q6PCX9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Trim37Q6PCX9 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Trim37Q6PCX9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Trim37Q6PCX9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Trim37Q6PCX9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Trim37Q6PCX9 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Trim37Q6PCX9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Trim37Q6PCX9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Trim37Q6PCX9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Trim37Q6PCX9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Trim37Q6PCX9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Trim37Q6PCX9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms