Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K8

Cpa4, Carboxypeptidase A4, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpa4Q6P8K8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cpa4Q6P8K8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cpa4Q6P8K8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cpa4Q6P8K8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cpa4Q6P8K8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cpa4Q6P8K8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cpa4Q6P8K8 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cpa4Q6P8K8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Cpa4Q6P8K8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cpa4Q6P8K8 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cpa4Q6P8K8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cpa4Q6P8K8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cpa4Q6P8K8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cpa4Q6P8K8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cpa4Q6P8K8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cpa4Q6P8K8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cpa4Q6P8K8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cpa4Q6P8K8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cpa4Q6P8K8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cpa4Q6P8K8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Cpa4Q6P8K8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cpa4Q6P8K8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cpa4Q6P8K8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cpa4Q6P8K8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cpa4Q6P8K8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cpa4Q6P8K8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cpa4Q6P8K8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cpa4Q6P8K8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cpa4Q6P8K8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cpa4Q6P8K8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cpa4Q6P8K8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cpa4Q6P8K8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Cpa4Q6P8K8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cpa4Q6P8K8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cpa4Q6P8K8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cpa4Q6P8K8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cpa4Q6P8K8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cpa4Q6P8K8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Cpa4Q6P8K8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Cpa4Q6P8K8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Cpa4Q6P8K8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cpa4Q6P8K8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cpa4Q6P8K8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cpa4Q6P8K8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cpa4Q6P8K8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cpa4Q6P8K8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cpa4Q6P8K8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cpa4Q6P8K8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cpa4Q6P8K8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cpa4Q6P8K8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cpa4Q6P8K8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cpa4Q6P8K8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cpa4Q6P8K8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cpa4Q6P8K8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cpa4Q6P8K8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cpa4Q6P8K8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cpa4Q6P8K8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cpa4Q6P8K8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cpa4Q6P8K8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cpa4Q6P8K8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cpa4Q6P8K8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Cpa4Q6P8K8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cpa4Q6P8K8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cpa4Q6P8K8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cpa4Q6P8K8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cpa4Q6P8K8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cpa4Q6P8K8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cpa4Q6P8K8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cpa4Q6P8K8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Cpa4Q6P8K8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cpa4Q6P8K8 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cpa4Q6P8K8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cpa4Q6P8K8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cpa4Q6P8K8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cpa4Q6P8K8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cpa4Q6P8K8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cpa4Q6P8K8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cpa4Q6P8K8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cpa4Q6P8K8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cpa4Q6P8K8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cpa4Q6P8K8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Cpa4Q6P8K8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cpa4Q6P8K8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cpa4Q6P8K8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cpa4Q6P8K8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cpa4Q6P8K8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cpa4Q6P8K8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Cpa4Q6P8K8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cpa4Q6P8K8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Cpa4Q6P8K8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cpa4Q6P8K8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cpa4Q6P8K8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cpa4Q6P8K8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Cpa4Q6P8K8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cpa4Q6P8K8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cpa4Q6P8K8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Cpa4Q6P8K8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cpa4Q6P8K8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cpa4Q6P8K8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cpa4Q6P8K8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.2 ms