Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5U8

Ccdc148, Coiled-coil domain-containing protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc148Q6P5U8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ccdc148Q6P5U8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ccdc148Q6P5U8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ccdc148Q6P5U8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ccdc148Q6P5U8 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ccdc148Q6P5U8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ccdc148Q6P5U8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Ccdc148Q6P5U8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ccdc148Q6P5U8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Ccdc148Q6P5U8 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ccdc148Q6P5U8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ccdc148Q6P5U8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ccdc148Q6P5U8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ccdc148Q6P5U8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ccdc148Q6P5U8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ccdc148Q6P5U8 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ccdc148Q6P5U8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ccdc148Q6P5U8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Ccdc148Q6P5U8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ccdc148Q6P5U8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ccdc148Q6P5U8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ccdc148Q6P5U8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ccdc148Q6P5U8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ccdc148Q6P5U8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ccdc148Q6P5U8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ccdc148Q6P5U8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ccdc148Q6P5U8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ccdc148Q6P5U8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ccdc148Q6P5U8 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ccdc148Q6P5U8 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ccdc148Q6P5U8 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ccdc148Q6P5U8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Ccdc148Q6P5U8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ccdc148Q6P5U8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ccdc148Q6P5U8 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ccdc148Q6P5U8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Ccdc148Q6P5U8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ccdc148Q6P5U8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ccdc148Q6P5U8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ccdc148Q6P5U8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ccdc148Q6P5U8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ccdc148Q6P5U8 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ccdc148Q6P5U8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ccdc148Q6P5U8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ccdc148Q6P5U8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ccdc148Q6P5U8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ccdc148Q6P5U8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ccdc148Q6P5U8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ccdc148Q6P5U8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ccdc148Q6P5U8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ccdc148Q6P5U8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ccdc148Q6P5U8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ccdc148Q6P5U8 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ccdc148Q6P5U8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ccdc148Q6P5U8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ccdc148Q6P5U8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ccdc148Q6P5U8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ccdc148Q6P5U8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ccdc148Q6P5U8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ccdc148Q6P5U8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ccdc148Q6P5U8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ccdc148Q6P5U8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ccdc148Q6P5U8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ccdc148Q6P5U8 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ccdc148Q6P5U8 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Ccdc148Q6P5U8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ccdc148Q6P5U8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Ccdc148Q6P5U8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ccdc148Q6P5U8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ccdc148Q6P5U8 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ccdc148Q6P5U8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ccdc148Q6P5U8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ccdc148Q6P5U8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ccdc148Q6P5U8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ccdc148Q6P5U8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ccdc148Q6P5U8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ccdc148Q6P5U8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ccdc148Q6P5U8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ccdc148Q6P5U8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Ccdc148Q6P5U8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ccdc148Q6P5U8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ccdc148Q6P5U8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ccdc148Q6P5U8 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ccdc148Q6P5U8 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ccdc148Q6P5U8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ccdc148Q6P5U8 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ccdc148Q6P5U8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Ccdc148Q6P5U8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ccdc148Q6P5U8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ccdc148Q6P5U8 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ccdc148Q6P5U8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ccdc148Q6P5U8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ccdc148Q6P5U8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ccdc148Q6P5U8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ccdc148Q6P5U8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ccdc148Q6P5U8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ccdc148Q6P5U8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ccdc148Q6P5U8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ccdc148Q6P5U8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ccdc148Q6P5U8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms