Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NipblQ6KCD5 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NipblQ6KCD5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
NipblQ6KCD5 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NipblQ6KCD5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NipblQ6KCD5 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NipblQ6KCD5 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NipblQ6KCD5 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NipblQ6KCD5 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NipblQ6KCD5 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
NipblQ6KCD5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NipblQ6KCD5 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NipblQ6KCD5 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NipblQ6KCD5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NipblQ6KCD5 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NipblQ6KCD5 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NipblQ6KCD5 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.7
NipblQ6KCD5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NipblQ6KCD5 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NipblQ6KCD5 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NipblQ6KCD5 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NipblQ6KCD5 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NipblQ6KCD5 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NipblQ6KCD5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
NipblQ6KCD5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NipblQ6KCD5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NipblQ6KCD5 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NipblQ6KCD5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NipblQ6KCD5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NipblQ6KCD5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NipblQ6KCD5 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NipblQ6KCD5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NipblQ6KCD5 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NipblQ6KCD5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NipblQ6KCD5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NipblQ6KCD5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NipblQ6KCD5 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
NipblQ6KCD5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
NipblQ6KCD5 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NipblQ6KCD5 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NipblQ6KCD5 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NipblQ6KCD5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NipblQ6KCD5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NipblQ6KCD5 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NipblQ6KCD5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NipblQ6KCD5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NipblQ6KCD5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NipblQ6KCD5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NipblQ6KCD5 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NipblQ6KCD5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NipblQ6KCD5 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
NipblQ6KCD5 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NipblQ6KCD5 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NipblQ6KCD5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NipblQ6KCD5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NipblQ6KCD5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NipblQ6KCD5 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NipblQ6KCD5 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NipblQ6KCD5 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NipblQ6KCD5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
NipblQ6KCD5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NipblQ6KCD5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NipblQ6KCD5 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NipblQ6KCD5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NipblQ6KCD5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NipblQ6KCD5 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NipblQ6KCD5 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NipblQ6KCD5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NipblQ6KCD5 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NipblQ6KCD5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NipblQ6KCD5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NipblQ6KCD5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NipblQ6KCD5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NipblQ6KCD5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NipblQ6KCD5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NipblQ6KCD5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NipblQ6KCD5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NipblQ6KCD5 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
NipblQ6KCD5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NipblQ6KCD5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NipblQ6KCD5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NipblQ6KCD5 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NipblQ6KCD5 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NipblQ6KCD5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NipblQ6KCD5 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NipblQ6KCD5 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NipblQ6KCD5 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NipblQ6KCD5 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NipblQ6KCD5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NipblQ6KCD5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NipblQ6KCD5 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NipblQ6KCD5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NipblQ6KCD5 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NipblQ6KCD5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NipblQ6KCD5 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NipblQ6KCD5 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NipblQ6KCD5 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NipblQ6KCD5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
NipblQ6KCD5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NipblQ6KCD5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
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