Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFV6

Fndc3c1, Fibronectin type III domain containing protein 3C1, mousemouse

Predictions only

Length 1,356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc3c1Q6DFV6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
Fndc3c1Q6DFV6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Fndc3c1Q6DFV6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Fndc3c1Q6DFV6 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Fndc3c1Q6DFV6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Fndc3c1Q6DFV6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Fndc3c1Q6DFV6 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Fndc3c1Q6DFV6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Fndc3c1Q6DFV6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Fndc3c1Q6DFV6 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Fndc3c1Q6DFV6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Fndc3c1Q6DFV6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Fndc3c1Q6DFV6 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Fndc3c1Q6DFV6 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Fndc3c1Q6DFV6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Fndc3c1Q6DFV6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Fndc3c1Q6DFV6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Fndc3c1Q6DFV6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Fndc3c1Q6DFV6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Fndc3c1Q6DFV6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Fndc3c1Q6DFV6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Fndc3c1Q6DFV6 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Fndc3c1Q6DFV6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Fndc3c1Q6DFV6 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Fndc3c1Q6DFV6 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Fndc3c1Q6DFV6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Fndc3c1Q6DFV6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Fndc3c1Q6DFV6 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Fndc3c1Q6DFV6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Fndc3c1Q6DFV6 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Fndc3c1Q6DFV6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Fndc3c1Q6DFV6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Fndc3c1Q6DFV6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Fndc3c1Q6DFV6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Fndc3c1Q6DFV6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Fndc3c1Q6DFV6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Fndc3c1Q6DFV6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Fndc3c1Q6DFV6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Fndc3c1Q6DFV6 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Fndc3c1Q6DFV6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Fndc3c1Q6DFV6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Fndc3c1Q6DFV6 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Fndc3c1Q6DFV6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Fndc3c1Q6DFV6 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Fndc3c1Q6DFV6 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Fndc3c1Q6DFV6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Fndc3c1Q6DFV6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Fndc3c1Q6DFV6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Fndc3c1Q6DFV6 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Fndc3c1Q6DFV6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Fndc3c1Q6DFV6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Fndc3c1Q6DFV6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Fndc3c1Q6DFV6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Fndc3c1Q6DFV6 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Fndc3c1Q6DFV6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Fndc3c1Q6DFV6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Fndc3c1Q6DFV6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Fndc3c1Q6DFV6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Fndc3c1Q6DFV6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Fndc3c1Q6DFV6 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Fndc3c1Q6DFV6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Fndc3c1Q6DFV6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Fndc3c1Q6DFV6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Fndc3c1Q6DFV6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Fndc3c1Q6DFV6 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Fndc3c1Q6DFV6 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Fndc3c1Q6DFV6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Fndc3c1Q6DFV6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Fndc3c1Q6DFV6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Fndc3c1Q6DFV6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Fndc3c1Q6DFV6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Fndc3c1Q6DFV6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Fndc3c1Q6DFV6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Fndc3c1Q6DFV6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Fndc3c1Q6DFV6 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Fndc3c1Q6DFV6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Fndc3c1Q6DFV6 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
Fndc3c1Q6DFV6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
Fndc3c1Q6DFV6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Fndc3c1Q6DFV6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Fndc3c1Q6DFV6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Fndc3c1Q6DFV6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Fndc3c1Q6DFV6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Fndc3c1Q6DFV6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Fndc3c1Q6DFV6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Fndc3c1Q6DFV6 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Fndc3c1Q6DFV6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Fndc3c1Q6DFV6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Fndc3c1Q6DFV6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Fndc3c1Q6DFV6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Fndc3c1Q6DFV6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Fndc3c1Q6DFV6 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Fndc3c1Q6DFV6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Fndc3c1Q6DFV6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Fndc3c1Q6DFV6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Fndc3c1Q6DFV6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Fndc3c1Q6DFV6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Fndc3c1Q6DFV6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Fndc3c1Q6DFV6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Fndc3c1Q6DFV6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms