Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z37

Samd9l, Sterile alpha motif domain-containing protein 9-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd9lQ69Z37 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
Samd9lQ69Z37 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.33■■■■■ 4.21
Samd9lQ69Z37 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC41.31■■■■■ 4.2
Samd9lQ69Z37 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
Samd9lQ69Z37 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.29■■■■■ 4.2
Samd9lQ69Z37 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
Samd9lQ69Z37 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC41.29■■■■■ 4.2
Samd9lQ69Z37 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.26■■■■■ 4.2
Samd9lQ69Z37 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.19
Samd9lQ69Z37 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
Samd9lQ69Z37 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC41.23■■■■■ 4.19
Samd9lQ69Z37 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
Samd9lQ69Z37 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
Samd9lQ69Z37 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC41.2■■■■■ 4.19
Samd9lQ69Z37 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
Samd9lQ69Z37 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
Samd9lQ69Z37 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC41.17■■■■■ 4.18
Samd9lQ69Z37 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
Samd9lQ69Z37 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
Samd9lQ69Z37 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
Samd9lQ69Z37 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
Samd9lQ69Z37 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC41.15■■■■■ 4.18
Samd9lQ69Z37 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
Samd9lQ69Z37 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
Samd9lQ69Z37 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
Samd9lQ69Z37 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
Samd9lQ69Z37 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
Samd9lQ69Z37 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC41.1■■■■■ 4.17
Samd9lQ69Z37 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC41.1■■■■■ 4.17
Samd9lQ69Z37 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
Samd9lQ69Z37 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
Samd9lQ69Z37 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
Samd9lQ69Z37 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
Samd9lQ69Z37 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC41.08■■■■■ 4.17
Samd9lQ69Z37 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
Samd9lQ69Z37 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC41.05■■■■■ 4.16
Samd9lQ69Z37 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
Samd9lQ69Z37 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC41.03■■■■■ 4.16
Samd9lQ69Z37 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
Samd9lQ69Z37 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
Samd9lQ69Z37 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
Samd9lQ69Z37 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
Samd9lQ69Z37 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC41■■■■■ 4.15
Samd9lQ69Z37 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC41■■■■■ 4.15
Samd9lQ69Z37 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
Samd9lQ69Z37 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
Samd9lQ69Z37 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
Samd9lQ69Z37 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
Samd9lQ69Z37 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
Samd9lQ69Z37 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC40.94■■■■■ 4.14
Samd9lQ69Z37 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
Samd9lQ69Z37 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
Samd9lQ69Z37 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC40.91■■■■■ 4.14
Samd9lQ69Z37 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
Samd9lQ69Z37 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
Samd9lQ69Z37 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC40.85■■■■■ 4.13
Samd9lQ69Z37 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
Samd9lQ69Z37 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
Samd9lQ69Z37 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC40.83■■■■■ 4.13
Samd9lQ69Z37 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.13
Samd9lQ69Z37 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
Samd9lQ69Z37 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC40.81■■■■■ 4.12
Samd9lQ69Z37 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
Samd9lQ69Z37 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
Samd9lQ69Z37 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
Samd9lQ69Z37 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
Samd9lQ69Z37 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
Samd9lQ69Z37 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
Samd9lQ69Z37 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
Samd9lQ69Z37 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC40.76■■■■■ 4.12
Samd9lQ69Z37 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
Samd9lQ69Z37 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
Samd9lQ69Z37 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC40.74■■■■■ 4.11
Samd9lQ69Z37 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
Samd9lQ69Z37 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
Samd9lQ69Z37 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
Samd9lQ69Z37 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
Samd9lQ69Z37 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC40.68■■■■■ 4.1
Samd9lQ69Z37 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.68■■■■■ 4.1
Samd9lQ69Z37 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
Samd9lQ69Z37 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
Samd9lQ69Z37 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.66■■■■■ 4.1
Samd9lQ69Z37 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
Samd9lQ69Z37 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC40.63■■■■■ 4.09
Samd9lQ69Z37 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC40.63■■■■■ 4.09
Samd9lQ69Z37 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
Samd9lQ69Z37 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC40.61■■■■■ 4.09
Samd9lQ69Z37 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.6■■■■■ 4.09
Samd9lQ69Z37 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC40.6■■■■■ 4.09
Samd9lQ69Z37 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC40.59■■■■■ 4.09
Samd9lQ69Z37 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC40.57■■■■■ 4.09
Samd9lQ69Z37 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC40.57■■■■■ 4.08
Samd9lQ69Z37 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
Samd9lQ69Z37 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC40.54■■■■■ 4.08
Samd9lQ69Z37 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
Samd9lQ69Z37 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
Samd9lQ69Z37 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
Samd9lQ69Z37 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC40.5■■■■■ 4.07
Samd9lQ69Z37 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC40.49■■■■■ 4.07
Samd9lQ69Z37 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms