Protein–RNA interactions for Protein: Q61345

Foxd1, Forkhead box protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd1Q61345 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Foxd1Q61345 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Foxd1Q61345 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Foxd1Q61345 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Foxd1Q61345 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Foxd1Q61345 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Foxd1Q61345 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Foxd1Q61345 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Foxd1Q61345 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Foxd1Q61345 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Foxd1Q61345 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Foxd1Q61345 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Foxd1Q61345 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Foxd1Q61345 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Foxd1Q61345 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Foxd1Q61345 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Foxd1Q61345 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Foxd1Q61345 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Foxd1Q61345 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Foxd1Q61345 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Foxd1Q61345 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Foxd1Q61345 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Foxd1Q61345 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Foxd1Q61345 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Foxd1Q61345 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Foxd1Q61345 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Foxd1Q61345 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Foxd1Q61345 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Foxd1Q61345 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Foxd1Q61345 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Foxd1Q61345 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Foxd1Q61345 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Foxd1Q61345 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Foxd1Q61345 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Foxd1Q61345 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Foxd1Q61345 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Foxd1Q61345 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Foxd1Q61345 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Foxd1Q61345 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Foxd1Q61345 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Foxd1Q61345 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Foxd1Q61345 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Foxd1Q61345 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Foxd1Q61345 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Foxd1Q61345 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Foxd1Q61345 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Foxd1Q61345 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Foxd1Q61345 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Foxd1Q61345 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Foxd1Q61345 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Foxd1Q61345 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Foxd1Q61345 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Foxd1Q61345 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Foxd1Q61345 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Foxd1Q61345 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Foxd1Q61345 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Foxd1Q61345 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Foxd1Q61345 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Foxd1Q61345 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Foxd1Q61345 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Foxd1Q61345 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Foxd1Q61345 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Foxd1Q61345 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Foxd1Q61345 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Foxd1Q61345 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Foxd1Q61345 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Foxd1Q61345 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Foxd1Q61345 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Foxd1Q61345 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Foxd1Q61345 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Foxd1Q61345 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Foxd1Q61345 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Foxd1Q61345 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Foxd1Q61345 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Foxd1Q61345 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Foxd1Q61345 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Foxd1Q61345 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Foxd1Q61345 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Foxd1Q61345 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Foxd1Q61345 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Foxd1Q61345 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Foxd1Q61345 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Foxd1Q61345 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Foxd1Q61345 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Foxd1Q61345 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Foxd1Q61345 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Foxd1Q61345 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Foxd1Q61345 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Foxd1Q61345 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Foxd1Q61345 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Foxd1Q61345 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Foxd1Q61345 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Foxd1Q61345 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Foxd1Q61345 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Foxd1Q61345 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Foxd1Q61345 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Foxd1Q61345 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Foxd1Q61345 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Foxd1Q61345 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Foxd1Q61345 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.5 ms