Protein–RNA interactions for Protein: Q61290

Cacna1e, Voltage-dependent R-type calcium channel subunit alpha-1E, mousemouse

Predictions only

Length 2,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1eQ61290 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cacna1eQ61290 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cacna1eQ61290 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cacna1eQ61290 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cacna1eQ61290 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cacna1eQ61290 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Cacna1eQ61290 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cacna1eQ61290 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cacna1eQ61290 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cacna1eQ61290 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cacna1eQ61290 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cacna1eQ61290 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cacna1eQ61290 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cacna1eQ61290 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cacna1eQ61290 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cacna1eQ61290 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cacna1eQ61290 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cacna1eQ61290 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cacna1eQ61290 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cacna1eQ61290 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cacna1eQ61290 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cacna1eQ61290 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cacna1eQ61290 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cacna1eQ61290 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cacna1eQ61290 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cacna1eQ61290 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cacna1eQ61290 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cacna1eQ61290 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Cacna1eQ61290 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cacna1eQ61290 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cacna1eQ61290 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cacna1eQ61290 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Cacna1eQ61290 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cacna1eQ61290 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cacna1eQ61290 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cacna1eQ61290 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cacna1eQ61290 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cacna1eQ61290 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cacna1eQ61290 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cacna1eQ61290 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cacna1eQ61290 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cacna1eQ61290 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Cacna1eQ61290 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Cacna1eQ61290 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cacna1eQ61290 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cacna1eQ61290 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cacna1eQ61290 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cacna1eQ61290 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cacna1eQ61290 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cacna1eQ61290 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cacna1eQ61290 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cacna1eQ61290 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cacna1eQ61290 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cacna1eQ61290 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Cacna1eQ61290 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cacna1eQ61290 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cacna1eQ61290 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cacna1eQ61290 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Cacna1eQ61290 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cacna1eQ61290 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cacna1eQ61290 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cacna1eQ61290 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cacna1eQ61290 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cacna1eQ61290 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cacna1eQ61290 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cacna1eQ61290 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cacna1eQ61290 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cacna1eQ61290 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cacna1eQ61290 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cacna1eQ61290 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cacna1eQ61290 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cacna1eQ61290 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Cacna1eQ61290 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cacna1eQ61290 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cacna1eQ61290 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cacna1eQ61290 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Cacna1eQ61290 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cacna1eQ61290 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cacna1eQ61290 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cacna1eQ61290 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cacna1eQ61290 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cacna1eQ61290 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cacna1eQ61290 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cacna1eQ61290 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cacna1eQ61290 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cacna1eQ61290 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cacna1eQ61290 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Cacna1eQ61290 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cacna1eQ61290 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cacna1eQ61290 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cacna1eQ61290 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cacna1eQ61290 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cacna1eQ61290 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cacna1eQ61290 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cacna1eQ61290 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cacna1eQ61290 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Cacna1eQ61290 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Cacna1eQ61290 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cacna1eQ61290 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cacna1eQ61290 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.8 ms