Protein–RNA interactions for Protein: Q61043

Nin, Ninein, mousemouse

Predictions only

Length 2,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NinQ61043 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,16■■■□□ 2,42
NinQ61043 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC30,15■■■□□ 2,42
NinQ61043 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC30,15■■■□□ 2,42
NinQ61043 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,14■■■□□ 2,42
NinQ61043 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,14■■■□□ 2,42
NinQ61043 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,14■■■□□ 2,41
NinQ61043 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,13■■■□□ 2,41
NinQ61043 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,13■■■□□ 2,41
NinQ61043 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC30,12■■■□□ 2,41
NinQ61043 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC30,12■■■□□ 2,41
NinQ61043 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC30,11■■■□□ 2,41
NinQ61043 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC30,08■■■□□ 2,41
NinQ61043 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,07■■■□□ 2,4
NinQ61043 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC30,06■■■□□ 2,4
NinQ61043 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC30,06■■■□□ 2,4
NinQ61043 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC30,05■■■□□ 2,4
NinQ61043 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,05■■■□□ 2,4
NinQ61043 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC30,05■■■□□ 2,4
NinQ61043 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,04■■■□□ 2,4
NinQ61043 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC30,04■■■□□ 2,4
NinQ61043 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC30,03■■■□□ 2,4
NinQ61043 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC30,02■■■□□ 2,4
NinQ61043 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC30,02■■■□□ 2,4
NinQ61043 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC30,01■■■□□ 2,4
NinQ61043 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2,39
NinQ61043 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2,39
NinQ61043 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2,39
NinQ61043 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC29,99■■■□□ 2,39
NinQ61043 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29,99■■■□□ 2,39
NinQ61043 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC29,98■■■□□ 2,39
NinQ61043 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC29,97■■■□□ 2,39
NinQ61043 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29,97■■■□□ 2,39
NinQ61043 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,97■■■□□ 2,39
NinQ61043 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC29,96■■■□□ 2,39
NinQ61043 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,96■■■□□ 2,39
NinQ61043 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,95■■■□□ 2,39
NinQ61043 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,94■■■□□ 2,38
NinQ61043 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,94■■■□□ 2,38
NinQ61043 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29,93■■■□□ 2,38
NinQ61043 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC29,92■■■□□ 2,38
NinQ61043 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,92■■■□□ 2,38
NinQ61043 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,89■■■□□ 2,38
NinQ61043 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,88■■■□□ 2,37
NinQ61043 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,88■■■□□ 2,37
NinQ61043 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC29,87■■■□□ 2,37
NinQ61043 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,87■■■□□ 2,37
NinQ61043 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC29,86■■■□□ 2,37
NinQ61043 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,86■■■□□ 2,37
NinQ61043 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC29,86■■■□□ 2,37
NinQ61043 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,85■■■□□ 2,37
NinQ61043 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC29,85■■■□□ 2,37
NinQ61043 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC29,85■■■□□ 2,37
NinQ61043 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC29,85■■■□□ 2,37
NinQ61043 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC29,84■■■□□ 2,37
NinQ61043 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC29,84■■■□□ 2,37
NinQ61043 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29,82■■■□□ 2,36
NinQ61043 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC29,81■■■□□ 2,36
NinQ61043 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC29,81■■■□□ 2,36
NinQ61043 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC29,81■■■□□ 2,36
NinQ61043 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC29,8■■■□□ 2,36
NinQ61043 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC29,79■■■□□ 2,36
NinQ61043 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29,79■■■□□ 2,36
NinQ61043 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,79■■■□□ 2,36
NinQ61043 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC29,78■■■□□ 2,36
NinQ61043 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC29,78■■■□□ 2,36
NinQ61043 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,77■■■□□ 2,36
NinQ61043 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29,77■■■□□ 2,36
NinQ61043 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,76■■■□□ 2,36
NinQ61043 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC29,76■■■□□ 2,36
NinQ61043 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC29,75■■■□□ 2,35
NinQ61043 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,75■■■□□ 2,35
NinQ61043 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,74■■■□□ 2,35
NinQ61043 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,73■■■□□ 2,35
NinQ61043 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,73■■■□□ 2,35
NinQ61043 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,7■■■□□ 2,35
NinQ61043 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,67■■■□□ 2,34
NinQ61043 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC29,67■■■□□ 2,34
NinQ61043 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,67■■■□□ 2,34
NinQ61043 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC29,66■■■□□ 2,34
NinQ61043 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,66■■■□□ 2,34
NinQ61043 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,65■■■□□ 2,34
NinQ61043 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC29,64■■■□□ 2,34
NinQ61043 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,63■■■□□ 2,33
NinQ61043 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC29,63■■■□□ 2,33
NinQ61043 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC29,62■■■□□ 2,33
NinQ61043 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC29,62■■■□□ 2,33
NinQ61043 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,62■■■□□ 2,33
NinQ61043 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29,61■■■□□ 2,33
NinQ61043 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29,61■■■□□ 2,33
NinQ61043 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC29,6■■■□□ 2,33
NinQ61043 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC29,6■■■□□ 2,33
NinQ61043 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,59■■■□□ 2,33
NinQ61043 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC29,59■■■□□ 2,33
NinQ61043 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,57■■■□□ 2,32
NinQ61043 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,57■■■□□ 2,32
NinQ61043 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC29,57■■■□□ 2,32
NinQ61043 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC29,54■■■□□ 2,32
NinQ61043 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,53■■■□□ 2,32
NinQ61043 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,53■■■□□ 2,32
NinQ61043 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,52■■■□□ 2,32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,9 ms