Protein–RNA interactions for Protein: Q5SX40

Myh1, Myosin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myh1Q5SX40 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
Myh1Q5SX40 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Myh1Q5SX40 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
Myh1Q5SX40 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Myh1Q5SX40 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Myh1Q5SX40 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Myh1Q5SX40 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
Myh1Q5SX40 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
Myh1Q5SX40 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Myh1Q5SX40 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Myh1Q5SX40 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Myh1Q5SX40 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Myh1Q5SX40 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Myh1Q5SX40 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Myh1Q5SX40 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Myh1Q5SX40 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Myh1Q5SX40 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Myh1Q5SX40 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Myh1Q5SX40 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Myh1Q5SX40 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Myh1Q5SX40 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Myh1Q5SX40 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Myh1Q5SX40 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Myh1Q5SX40 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Myh1Q5SX40 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
Myh1Q5SX40 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Myh1Q5SX40 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
Myh1Q5SX40 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Myh1Q5SX40 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Myh1Q5SX40 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Myh1Q5SX40 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Myh1Q5SX40 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Myh1Q5SX40 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Myh1Q5SX40 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Myh1Q5SX40 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
Myh1Q5SX40 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Myh1Q5SX40 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Myh1Q5SX40 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
Myh1Q5SX40 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Myh1Q5SX40 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Myh1Q5SX40 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Myh1Q5SX40 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Myh1Q5SX40 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Myh1Q5SX40 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Myh1Q5SX40 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Myh1Q5SX40 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Myh1Q5SX40 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Myh1Q5SX40 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Myh1Q5SX40 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Myh1Q5SX40 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Myh1Q5SX40 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Myh1Q5SX40 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Myh1Q5SX40 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Myh1Q5SX40 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Myh1Q5SX40 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Myh1Q5SX40 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Myh1Q5SX40 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
Myh1Q5SX40 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Myh1Q5SX40 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Myh1Q5SX40 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Myh1Q5SX40 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Myh1Q5SX40 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Myh1Q5SX40 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Myh1Q5SX40 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Myh1Q5SX40 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Myh1Q5SX40 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Myh1Q5SX40 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Myh1Q5SX40 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Myh1Q5SX40 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Myh1Q5SX40 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
Myh1Q5SX40 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Myh1Q5SX40 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Myh1Q5SX40 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Myh1Q5SX40 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Myh1Q5SX40 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Myh1Q5SX40 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
Myh1Q5SX40 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Myh1Q5SX40 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Myh1Q5SX40 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Myh1Q5SX40 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Myh1Q5SX40 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Myh1Q5SX40 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Myh1Q5SX40 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Myh1Q5SX40 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Myh1Q5SX40 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Myh1Q5SX40 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Myh1Q5SX40 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Myh1Q5SX40 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Myh1Q5SX40 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Myh1Q5SX40 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Myh1Q5SX40 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Myh1Q5SX40 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Myh1Q5SX40 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Myh1Q5SX40 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Myh1Q5SX40 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
Myh1Q5SX40 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
Myh1Q5SX40 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Myh1Q5SX40 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Myh1Q5SX40 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Myh1Q5SX40 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms