Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW4

Med13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 2,171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med13Q5SWW4 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Med13Q5SWW4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Med13Q5SWW4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Med13Q5SWW4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Med13Q5SWW4 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Med13Q5SWW4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Med13Q5SWW4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Med13Q5SWW4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Med13Q5SWW4 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Med13Q5SWW4 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Med13Q5SWW4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Med13Q5SWW4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Med13Q5SWW4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Med13Q5SWW4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Med13Q5SWW4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Med13Q5SWW4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Med13Q5SWW4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Med13Q5SWW4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Med13Q5SWW4 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Med13Q5SWW4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Med13Q5SWW4 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Med13Q5SWW4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Med13Q5SWW4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Med13Q5SWW4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Med13Q5SWW4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Med13Q5SWW4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Med13Q5SWW4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Med13Q5SWW4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Med13Q5SWW4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Med13Q5SWW4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Med13Q5SWW4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Med13Q5SWW4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Med13Q5SWW4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Med13Q5SWW4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Med13Q5SWW4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Med13Q5SWW4 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Med13Q5SWW4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Med13Q5SWW4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Med13Q5SWW4 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Med13Q5SWW4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Med13Q5SWW4 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Med13Q5SWW4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Med13Q5SWW4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Med13Q5SWW4 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Med13Q5SWW4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Med13Q5SWW4 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Med13Q5SWW4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Med13Q5SWW4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Med13Q5SWW4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Med13Q5SWW4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Med13Q5SWW4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Med13Q5SWW4 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Med13Q5SWW4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Med13Q5SWW4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Med13Q5SWW4 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Med13Q5SWW4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Med13Q5SWW4 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Med13Q5SWW4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Med13Q5SWW4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Med13Q5SWW4 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Med13Q5SWW4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Med13Q5SWW4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Med13Q5SWW4 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Med13Q5SWW4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Med13Q5SWW4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Med13Q5SWW4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Med13Q5SWW4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Med13Q5SWW4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Med13Q5SWW4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Med13Q5SWW4 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Med13Q5SWW4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Med13Q5SWW4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Med13Q5SWW4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Med13Q5SWW4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Med13Q5SWW4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Med13Q5SWW4 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Med13Q5SWW4 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Med13Q5SWW4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Med13Q5SWW4 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Med13Q5SWW4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Med13Q5SWW4 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Med13Q5SWW4 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Med13Q5SWW4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Med13Q5SWW4 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Med13Q5SWW4 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Med13Q5SWW4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Med13Q5SWW4 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Med13Q5SWW4 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Med13Q5SWW4 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Med13Q5SWW4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Med13Q5SWW4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Med13Q5SWW4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Med13Q5SWW4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Med13Q5SWW4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Med13Q5SWW4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Med13Q5SWW4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Med13Q5SWW4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Med13Q5SWW4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Med13Q5SWW4 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Med13Q5SWW4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.7 ms