Protein–RNA interactions for Protein: Q5SP85

Ccdc85a, Coiled-coil domain-containing protein 85A, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85aQ5SP85 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ccdc85aQ5SP85 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccdc85aQ5SP85 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccdc85aQ5SP85 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ccdc85aQ5SP85 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ccdc85aQ5SP85 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ccdc85aQ5SP85 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ccdc85aQ5SP85 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ccdc85aQ5SP85 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ccdc85aQ5SP85 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc85aQ5SP85 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc85aQ5SP85 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ccdc85aQ5SP85 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ccdc85aQ5SP85 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ccdc85aQ5SP85 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ccdc85aQ5SP85 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ccdc85aQ5SP85 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ccdc85aQ5SP85 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ccdc85aQ5SP85 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ccdc85aQ5SP85 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ccdc85aQ5SP85 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ccdc85aQ5SP85 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccdc85aQ5SP85 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccdc85aQ5SP85 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccdc85aQ5SP85 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccdc85aQ5SP85 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ccdc85aQ5SP85 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ccdc85aQ5SP85 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ccdc85aQ5SP85 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ccdc85aQ5SP85 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccdc85aQ5SP85 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccdc85aQ5SP85 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccdc85aQ5SP85 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccdc85aQ5SP85 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ccdc85aQ5SP85 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ccdc85aQ5SP85 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ccdc85aQ5SP85 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ccdc85aQ5SP85 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ccdc85aQ5SP85 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ccdc85aQ5SP85 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Ccdc85aQ5SP85 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ccdc85aQ5SP85 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc85aQ5SP85 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc85aQ5SP85 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccdc85aQ5SP85 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccdc85aQ5SP85 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc85aQ5SP85 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc85aQ5SP85 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccdc85aQ5SP85 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccdc85aQ5SP85 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc85aQ5SP85 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc85aQ5SP85 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ccdc85aQ5SP85 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccdc85aQ5SP85 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccdc85aQ5SP85 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccdc85aQ5SP85 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccdc85aQ5SP85 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ccdc85aQ5SP85 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ccdc85aQ5SP85 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccdc85aQ5SP85 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc85aQ5SP85 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc85aQ5SP85 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc85aQ5SP85 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc85aQ5SP85 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccdc85aQ5SP85 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ccdc85aQ5SP85 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ccdc85aQ5SP85 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccdc85aQ5SP85 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccdc85aQ5SP85 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc85aQ5SP85 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc85aQ5SP85 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc85aQ5SP85 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc85aQ5SP85 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc85aQ5SP85 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccdc85aQ5SP85 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccdc85aQ5SP85 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccdc85aQ5SP85 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccdc85aQ5SP85 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccdc85aQ5SP85 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Ccdc85aQ5SP85 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccdc85aQ5SP85 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccdc85aQ5SP85 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccdc85aQ5SP85 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc85aQ5SP85 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc85aQ5SP85 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc85aQ5SP85 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccdc85aQ5SP85 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccdc85aQ5SP85 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc85aQ5SP85 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccdc85aQ5SP85 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccdc85aQ5SP85 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccdc85aQ5SP85 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc85aQ5SP85 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc85aQ5SP85 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc85aQ5SP85 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ccdc85aQ5SP85 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ccdc85aQ5SP85 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc85aQ5SP85 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc85aQ5SP85 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc85aQ5SP85 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms