Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC41

1810065E05Rik, RIKEN cDNA 1810065E05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1810065E05RikQ5NC41 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
1810065E05RikQ5NC41 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
1810065E05RikQ5NC41 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.64
1810065E05RikQ5NC41 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
1810065E05RikQ5NC41 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
1810065E05RikQ5NC41 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.5■■■□□ 2.63
1810065E05RikQ5NC41 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
1810065E05RikQ5NC41 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
1810065E05RikQ5NC41 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
1810065E05RikQ5NC41 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
1810065E05RikQ5NC41 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
1810065E05RikQ5NC41 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
1810065E05RikQ5NC41 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
1810065E05RikQ5NC41 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
1810065E05RikQ5NC41 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
1810065E05RikQ5NC41 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
1810065E05RikQ5NC41 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
1810065E05RikQ5NC41 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
1810065E05RikQ5NC41 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
1810065E05RikQ5NC41 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
1810065E05RikQ5NC41 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC31.42■■■□□ 2.62
1810065E05RikQ5NC41 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
1810065E05RikQ5NC41 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
1810065E05RikQ5NC41 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
1810065E05RikQ5NC41 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
1810065E05RikQ5NC41 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
1810065E05RikQ5NC41 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
1810065E05RikQ5NC41 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
1810065E05RikQ5NC41 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
1810065E05RikQ5NC41 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
1810065E05RikQ5NC41 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
1810065E05RikQ5NC41 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
1810065E05RikQ5NC41 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
1810065E05RikQ5NC41 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
1810065E05RikQ5NC41 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
1810065E05RikQ5NC41 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
1810065E05RikQ5NC41 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC31.29■■■□□ 2.6
1810065E05RikQ5NC41 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
1810065E05RikQ5NC41 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
1810065E05RikQ5NC41 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
1810065E05RikQ5NC41 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
1810065E05RikQ5NC41 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
1810065E05RikQ5NC41 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
1810065E05RikQ5NC41 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
1810065E05RikQ5NC41 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
1810065E05RikQ5NC41 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
1810065E05RikQ5NC41 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
1810065E05RikQ5NC41 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
1810065E05RikQ5NC41 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
1810065E05RikQ5NC41 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
1810065E05RikQ5NC41 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
1810065E05RikQ5NC41 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
1810065E05RikQ5NC41 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
1810065E05RikQ5NC41 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
1810065E05RikQ5NC41 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
1810065E05RikQ5NC41 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
1810065E05RikQ5NC41 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
1810065E05RikQ5NC41 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
1810065E05RikQ5NC41 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
1810065E05RikQ5NC41 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
1810065E05RikQ5NC41 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
1810065E05RikQ5NC41 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
1810065E05RikQ5NC41 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
1810065E05RikQ5NC41 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
1810065E05RikQ5NC41 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
1810065E05RikQ5NC41 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
1810065E05RikQ5NC41 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
1810065E05RikQ5NC41 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
1810065E05RikQ5NC41 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
1810065E05RikQ5NC41 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
1810065E05RikQ5NC41 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
1810065E05RikQ5NC41 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
1810065E05RikQ5NC41 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
1810065E05RikQ5NC41 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
1810065E05RikQ5NC41 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC31.02■■■□□ 2.56
1810065E05RikQ5NC41 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
1810065E05RikQ5NC41 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
1810065E05RikQ5NC41 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.01■■■□□ 2.55
1810065E05RikQ5NC41 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
1810065E05RikQ5NC41 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
1810065E05RikQ5NC41 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
1810065E05RikQ5NC41 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
1810065E05RikQ5NC41 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
1810065E05RikQ5NC41 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
1810065E05RikQ5NC41 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
1810065E05RikQ5NC41 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC30.99■■■□□ 2.55
1810065E05RikQ5NC41 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
1810065E05RikQ5NC41 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC30.98■■■□□ 2.55
1810065E05RikQ5NC41 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
1810065E05RikQ5NC41 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
1810065E05RikQ5NC41 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
1810065E05RikQ5NC41 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
1810065E05RikQ5NC41 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
1810065E05RikQ5NC41 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
1810065E05RikQ5NC41 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
1810065E05RikQ5NC41 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
1810065E05RikQ5NC41 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
1810065E05RikQ5NC41 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
1810065E05RikQ5NC41 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
1810065E05RikQ5NC41 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms