Protein–RNA interactions for Protein: Q3LAC4

Prex2, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate-dependent Rac exchanger 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,598 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prex2Q3LAC4 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
Prex2Q3LAC4 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC38.72■■■■□ 3.79
Prex2Q3LAC4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
Prex2Q3LAC4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
Prex2Q3LAC4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC38.7■■■■□ 3.79
Prex2Q3LAC4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.69■■■■□ 3.78
Prex2Q3LAC4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
Prex2Q3LAC4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC38.67■■■■□ 3.78
Prex2Q3LAC4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.66■■■■□ 3.78
Prex2Q3LAC4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.66■■■■□ 3.78
Prex2Q3LAC4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
Prex2Q3LAC4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC38.66■■■■□ 3.78
Prex2Q3LAC4 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
Prex2Q3LAC4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
Prex2Q3LAC4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC38.65■■■■□ 3.78
Prex2Q3LAC4 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
Prex2Q3LAC4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
Prex2Q3LAC4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
Prex2Q3LAC4 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
Prex2Q3LAC4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.6■■■■□ 3.77
Prex2Q3LAC4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
Prex2Q3LAC4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
Prex2Q3LAC4 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
Prex2Q3LAC4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
Prex2Q3LAC4 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.56■■■■□ 3.76
Prex2Q3LAC4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
Prex2Q3LAC4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
Prex2Q3LAC4 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
Prex2Q3LAC4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
Prex2Q3LAC4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
Prex2Q3LAC4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
Prex2Q3LAC4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
Prex2Q3LAC4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC38.5■■■■□ 3.75
Prex2Q3LAC4 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
Prex2Q3LAC4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
Prex2Q3LAC4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
Prex2Q3LAC4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.45■■■■□ 3.75
Prex2Q3LAC4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
Prex2Q3LAC4 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
Prex2Q3LAC4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
Prex2Q3LAC4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
Prex2Q3LAC4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC38.37■■■■□ 3.73
Prex2Q3LAC4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.34■■■■□ 3.73
Prex2Q3LAC4 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
Prex2Q3LAC4 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
Prex2Q3LAC4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC38.31■■■■□ 3.72
Prex2Q3LAC4 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
Prex2Q3LAC4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
Prex2Q3LAC4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC38.29■■■■□ 3.72
Prex2Q3LAC4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
Prex2Q3LAC4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
Prex2Q3LAC4 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
Prex2Q3LAC4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
Prex2Q3LAC4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
Prex2Q3LAC4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.24■■■■□ 3.71
Prex2Q3LAC4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC38.24■■■■□ 3.71
Prex2Q3LAC4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
Prex2Q3LAC4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC38.22■■■■□ 3.71
Prex2Q3LAC4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
Prex2Q3LAC4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
Prex2Q3LAC4 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC38.21■■■■□ 3.71
Prex2Q3LAC4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
Prex2Q3LAC4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
Prex2Q3LAC4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC38.18■■■■□ 3.7
Prex2Q3LAC4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC38.18■■■■□ 3.7
Prex2Q3LAC4 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC38.17■■■■□ 3.7
Prex2Q3LAC4 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
Prex2Q3LAC4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
Prex2Q3LAC4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC38.15■■■■□ 3.7
Prex2Q3LAC4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.7
Prex2Q3LAC4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC38.13■■■■□ 3.69
Prex2Q3LAC4 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
Prex2Q3LAC4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
Prex2Q3LAC4 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC38.1■■■■□ 3.69
Prex2Q3LAC4 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC38.1■■■■□ 3.69
Prex2Q3LAC4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
Prex2Q3LAC4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
Prex2Q3LAC4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
Prex2Q3LAC4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
Prex2Q3LAC4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
Prex2Q3LAC4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
Prex2Q3LAC4 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC38.06■■■■□ 3.68
Prex2Q3LAC4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
Prex2Q3LAC4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC38.04■■■■□ 3.68
Prex2Q3LAC4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
Prex2Q3LAC4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC38.02■■■■□ 3.68
Prex2Q3LAC4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
Prex2Q3LAC4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
Prex2Q3LAC4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC37.99■■■■□ 3.67
Prex2Q3LAC4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC37.99■■■■□ 3.67
Prex2Q3LAC4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
Prex2Q3LAC4 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC37.97■■■■□ 3.67
Prex2Q3LAC4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC37.97■■■■□ 3.67
Prex2Q3LAC4 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC37.97■■■■□ 3.67
Prex2Q3LAC4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
Prex2Q3LAC4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC37.9■■■■□ 3.66
Prex2Q3LAC4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC37.89■■■■□ 3.66
Prex2Q3LAC4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
Prex2Q3LAC4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
Prex2Q3LAC4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC37.86■■■■□ 3.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms