Protein–RNA interactions for Protein: Q08351

Mpl, Thrombopoietin receptor, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MplQ08351 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MplQ08351 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MplQ08351 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MplQ08351 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MplQ08351 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MplQ08351 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MplQ08351 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MplQ08351 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MplQ08351 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MplQ08351 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MplQ08351 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MplQ08351 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MplQ08351 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MplQ08351 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MplQ08351 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MplQ08351 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MplQ08351 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MplQ08351 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MplQ08351 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MplQ08351 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MplQ08351 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MplQ08351 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MplQ08351 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
MplQ08351 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MplQ08351 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MplQ08351 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MplQ08351 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MplQ08351 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MplQ08351 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MplQ08351 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MplQ08351 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MplQ08351 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MplQ08351 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MplQ08351 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MplQ08351 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MplQ08351 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MplQ08351 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MplQ08351 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MplQ08351 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MplQ08351 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MplQ08351 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MplQ08351 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MplQ08351 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MplQ08351 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MplQ08351 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MplQ08351 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MplQ08351 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
MplQ08351 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MplQ08351 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MplQ08351 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MplQ08351 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MplQ08351 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MplQ08351 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MplQ08351 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MplQ08351 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MplQ08351 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MplQ08351 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MplQ08351 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MplQ08351 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MplQ08351 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MplQ08351 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MplQ08351 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MplQ08351 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
MplQ08351 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MplQ08351 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MplQ08351 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MplQ08351 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MplQ08351 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MplQ08351 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MplQ08351 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MplQ08351 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MplQ08351 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MplQ08351 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MplQ08351 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MplQ08351 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MplQ08351 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MplQ08351 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MplQ08351 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MplQ08351 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MplQ08351 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MplQ08351 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MplQ08351 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
MplQ08351 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MplQ08351 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MplQ08351 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MplQ08351 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MplQ08351 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MplQ08351 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MplQ08351 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
MplQ08351 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MplQ08351 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MplQ08351 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MplQ08351 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MplQ08351 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MplQ08351 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MplQ08351 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MplQ08351 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MplQ08351 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MplQ08351 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MplQ08351 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms