Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Gbp1Q01514 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Gbp1Q01514 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Gbp1Q01514 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Gbp1Q01514 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Gbp1Q01514 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Gbp1Q01514 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Gbp1Q01514 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Gbp1Q01514 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Gbp1Q01514 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Gbp1Q01514 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Gbp1Q01514 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Gbp1Q01514 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Gbp1Q01514 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Gbp1Q01514 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Gbp1Q01514 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Gbp1Q01514 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Gbp1Q01514 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Gbp1Q01514 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Gbp1Q01514 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Gbp1Q01514 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Gbp1Q01514 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Gbp1Q01514 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Gbp1Q01514 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Gbp1Q01514 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Gbp1Q01514 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Gbp1Q01514 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Gbp1Q01514 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Gbp1Q01514 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Gbp1Q01514 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Gbp1Q01514 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Gbp1Q01514 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Gbp1Q01514 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Gbp1Q01514 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Gbp1Q01514 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Gbp1Q01514 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Gbp1Q01514 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Gbp1Q01514 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Gbp1Q01514 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Gbp1Q01514 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Gbp1Q01514 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Gbp1Q01514 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Gbp1Q01514 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Gbp1Q01514 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Gbp1Q01514 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Gbp1Q01514 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Gbp1Q01514 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Gbp1Q01514 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Gbp1Q01514 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Gbp1Q01514 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Gbp1Q01514 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Gbp1Q01514 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Gbp1Q01514 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Gbp1Q01514 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Gbp1Q01514 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Gbp1Q01514 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Gbp1Q01514 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gbp1Q01514 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Gbp1Q01514 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Gbp1Q01514 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Gbp1Q01514 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Gbp1Q01514 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gbp1Q01514 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gbp1Q01514 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gbp1Q01514 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Gbp1Q01514 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Gbp1Q01514 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Gbp1Q01514 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Gbp1Q01514 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Gbp1Q01514 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Gbp1Q01514 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Gbp1Q01514 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gbp1Q01514 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Gbp1Q01514 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Gbp1Q01514 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Gbp1Q01514 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Gbp1Q01514 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Gbp1Q01514 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Gbp1Q01514 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Gbp1Q01514 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Gbp1Q01514 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Gbp1Q01514 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Gbp1Q01514 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Gbp1Q01514 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Gbp1Q01514 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Gbp1Q01514 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Gbp1Q01514 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Gbp1Q01514 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Gbp1Q01514 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Gbp1Q01514 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gbp1Q01514 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gbp1Q01514 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gbp1Q01514 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gbp1Q01514 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gbp1Q01514 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gbp1Q01514 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Gbp1Q01514 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gbp1Q01514 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gbp1Q01514 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gbp1Q01514 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms