Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
Top2aQ01320 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.26
Top2aQ01320 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC41.68■■■■■ 4.26
Top2aQ01320 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
Top2aQ01320 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC41.67■■■■■ 4.26
Top2aQ01320 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.65■■■■■ 4.26
Top2aQ01320 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
Top2aQ01320 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC41.64■■■■■ 4.26
Top2aQ01320 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
Top2aQ01320 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
Top2aQ01320 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
Top2aQ01320 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
Top2aQ01320 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
Top2aQ01320 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
Top2aQ01320 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
Top2aQ01320 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.56■■■■■ 4.24
Top2aQ01320 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC41.56■■■■■ 4.24
Top2aQ01320 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
Top2aQ01320 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
Top2aQ01320 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
Top2aQ01320 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
Top2aQ01320 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
Top2aQ01320 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
Top2aQ01320 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
Top2aQ01320 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
Top2aQ01320 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.46■■■■■ 4.23
Top2aQ01320 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
Top2aQ01320 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC41.46■■■■■ 4.23
Top2aQ01320 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
Top2aQ01320 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC41.42■■■■■ 4.22
Top2aQ01320 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
Top2aQ01320 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
Top2aQ01320 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
Top2aQ01320 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
Top2aQ01320 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.22
Top2aQ01320 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.21
Top2aQ01320 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
Top2aQ01320 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
Top2aQ01320 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
Top2aQ01320 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
Top2aQ01320 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.31■■■■■ 4.2
Top2aQ01320 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
Top2aQ01320 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC41.29■■■■■ 4.2
Top2aQ01320 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC41.28■■■■■ 4.2
Top2aQ01320 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
Top2aQ01320 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
Top2aQ01320 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.24■■■■■ 4.19
Top2aQ01320 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
Top2aQ01320 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC41.23■■■■■ 4.19
Top2aQ01320 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
Top2aQ01320 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
Top2aQ01320 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
Top2aQ01320 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
Top2aQ01320 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC41.21■■■■■ 4.19
Top2aQ01320 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC41.21■■■■■ 4.19
Top2aQ01320 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC41.18■■■■■ 4.18
Top2aQ01320 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
Top2aQ01320 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
Top2aQ01320 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
Top2aQ01320 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
Top2aQ01320 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
Top2aQ01320 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC41.14■■■■■ 4.18
Top2aQ01320 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC41.13■■■■■ 4.18
Top2aQ01320 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.17
Top2aQ01320 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
Top2aQ01320 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC41.1■■■■■ 4.17
Top2aQ01320 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
Top2aQ01320 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.08■■■■■ 4.17
Top2aQ01320 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC41.08■■■■■ 4.17
Top2aQ01320 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC41.07■■■■■ 4.17
Top2aQ01320 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
Top2aQ01320 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
Top2aQ01320 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
Top2aQ01320 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
Top2aQ01320 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
Top2aQ01320 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
Top2aQ01320 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
Top2aQ01320 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
Top2aQ01320 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
Top2aQ01320 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.93■■■■■ 4.14
Top2aQ01320 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
Top2aQ01320 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC40.93■■■■■ 4.14
Top2aQ01320 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
Top2aQ01320 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC40.92■■■■■ 4.14
Top2aQ01320 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
Top2aQ01320 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC40.88■■■■■ 4.14
Top2aQ01320 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.88■■■■■ 4.14
Top2aQ01320 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
Top2aQ01320 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
Top2aQ01320 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC40.83■■■■■ 4.13
Top2aQ01320 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.82■■■■■ 4.12
Top2aQ01320 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
Top2aQ01320 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.8■■■■■ 4.12
Top2aQ01320 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
Top2aQ01320 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
Top2aQ01320 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC40.78■■■■■ 4.12
Top2aQ01320 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC40.78■■■■■ 4.12
Top2aQ01320 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC40.77■■■■■ 4.12
Top2aQ01320 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC40.76■■■■■ 4.12
Top2aQ01320 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms