Protein–RNA interactions for Protein: P97793

Alk, ALK tyrosine kinase receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlkP97793 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
AlkP97793 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
AlkP97793 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
AlkP97793 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
AlkP97793 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
AlkP97793 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
AlkP97793 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC37.08■■■■□ 3.53
AlkP97793 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
AlkP97793 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
AlkP97793 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
AlkP97793 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
AlkP97793 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
AlkP97793 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
AlkP97793 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC37.04■■■■□ 3.52
AlkP97793 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
AlkP97793 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
AlkP97793 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
AlkP97793 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
AlkP97793 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
AlkP97793 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
AlkP97793 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
AlkP97793 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
AlkP97793 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
AlkP97793 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
AlkP97793 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
AlkP97793 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
AlkP97793 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
AlkP97793 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
AlkP97793 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
AlkP97793 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
AlkP97793 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC36.9■■■■□ 3.5
AlkP97793 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
AlkP97793 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
AlkP97793 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
AlkP97793 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
AlkP97793 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
AlkP97793 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC36.83■■■■□ 3.49
AlkP97793 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
AlkP97793 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
AlkP97793 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
AlkP97793 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
AlkP97793 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
AlkP97793 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
AlkP97793 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
AlkP97793 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
AlkP97793 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
AlkP97793 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
AlkP97793 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC36.7■■■■□ 3.47
AlkP97793 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
AlkP97793 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
AlkP97793 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.7■■■■□ 3.47
AlkP97793 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
AlkP97793 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
AlkP97793 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
AlkP97793 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
AlkP97793 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
AlkP97793 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
AlkP97793 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
AlkP97793 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
AlkP97793 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
AlkP97793 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
AlkP97793 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
AlkP97793 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
AlkP97793 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
AlkP97793 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
AlkP97793 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
AlkP97793 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC36.62■■■■□ 3.45
AlkP97793 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
AlkP97793 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
AlkP97793 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
AlkP97793 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
AlkP97793 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
AlkP97793 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
AlkP97793 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
AlkP97793 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
AlkP97793 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
AlkP97793 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
AlkP97793 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
AlkP97793 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
AlkP97793 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
AlkP97793 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
AlkP97793 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
AlkP97793 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
AlkP97793 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.42
AlkP97793 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
AlkP97793 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
AlkP97793 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
AlkP97793 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
AlkP97793 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
AlkP97793 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
AlkP97793 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
AlkP97793 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.41■■■■□ 3.42
AlkP97793 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
AlkP97793 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
AlkP97793 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC36.4■■■■□ 3.42
AlkP97793 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC36.4■■■■□ 3.42
AlkP97793 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
AlkP97793 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC36.38■■■■□ 3.41
AlkP97793 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
AlkP97793 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms