Protein–RNA interactions for Protein: P70365

Ncoa1, Nuclear receptor coactivator 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncoa1P70365 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Ncoa1P70365 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Ncoa1P70365 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
Ncoa1P70365 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
Ncoa1P70365 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Ncoa1P70365 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
Ncoa1P70365 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Ncoa1P70365 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC36.54■■■■□ 3.44
Ncoa1P70365 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
Ncoa1P70365 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
Ncoa1P70365 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Ncoa1P70365 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
Ncoa1P70365 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Ncoa1P70365 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
Ncoa1P70365 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Ncoa1P70365 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Ncoa1P70365 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Ncoa1P70365 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
Ncoa1P70365 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Ncoa1P70365 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Ncoa1P70365 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Ncoa1P70365 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Ncoa1P70365 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Ncoa1P70365 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Ncoa1P70365 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC36.45■■■■□ 3.43
Ncoa1P70365 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC36.45■■■■□ 3.43
Ncoa1P70365 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Ncoa1P70365 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Ncoa1P70365 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Ncoa1P70365 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Ncoa1P70365 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC36.4■■■■□ 3.42
Ncoa1P70365 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.39■■■■□ 3.42
Ncoa1P70365 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Ncoa1P70365 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Ncoa1P70365 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
Ncoa1P70365 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Ncoa1P70365 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Ncoa1P70365 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Ncoa1P70365 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Ncoa1P70365 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Ncoa1P70365 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
Ncoa1P70365 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC36.27■■■■□ 3.4
Ncoa1P70365 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Ncoa1P70365 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC36.26■■■■□ 3.4
Ncoa1P70365 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
Ncoa1P70365 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Ncoa1P70365 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC36.25■■■■□ 3.39
Ncoa1P70365 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
Ncoa1P70365 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC36.22■■■■□ 3.39
Ncoa1P70365 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Ncoa1P70365 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Ncoa1P70365 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Ncoa1P70365 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Ncoa1P70365 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Ncoa1P70365 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
Ncoa1P70365 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
Ncoa1P70365 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Ncoa1P70365 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Ncoa1P70365 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Ncoa1P70365 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
Ncoa1P70365 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Ncoa1P70365 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
Ncoa1P70365 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
Ncoa1P70365 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Ncoa1P70365 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Ncoa1P70365 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC36.09■■■■□ 3.37
Ncoa1P70365 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Ncoa1P70365 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Ncoa1P70365 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Ncoa1P70365 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
Ncoa1P70365 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Ncoa1P70365 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Ncoa1P70365 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Ncoa1P70365 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC36.02■■■■□ 3.36
Ncoa1P70365 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC36.02■■■■□ 3.36
Ncoa1P70365 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC36■■■■□ 3.35
Ncoa1P70365 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Ncoa1P70365 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC35.97■■■■□ 3.35
Ncoa1P70365 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Ncoa1P70365 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Ncoa1P70365 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
Ncoa1P70365 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Ncoa1P70365 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Ncoa1P70365 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Ncoa1P70365 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
Ncoa1P70365 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Ncoa1P70365 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Ncoa1P70365 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
Ncoa1P70365 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Ncoa1P70365 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Ncoa1P70365 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Ncoa1P70365 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.86■■■■□ 3.33
Ncoa1P70365 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Ncoa1P70365 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Ncoa1P70365 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
Ncoa1P70365 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
Ncoa1P70365 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Ncoa1P70365 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
Ncoa1P70365 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Ncoa1P70365 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms