Protein–RNA interactions for Protein: P56716

Rp1, Oxygen-regulated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,095 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rp1P56716 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rp1P56716 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rp1P56716 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rp1P56716 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rp1P56716 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rp1P56716 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rp1P56716 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rp1P56716 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rp1P56716 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rp1P56716 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rp1P56716 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rp1P56716 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rp1P56716 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rp1P56716 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rp1P56716 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rp1P56716 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Rp1P56716 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rp1P56716 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rp1P56716 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rp1P56716 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rp1P56716 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rp1P56716 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rp1P56716 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Rp1P56716 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rp1P56716 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rp1P56716 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rp1P56716 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rp1P56716 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rp1P56716 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rp1P56716 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rp1P56716 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rp1P56716 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rp1P56716 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rp1P56716 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rp1P56716 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rp1P56716 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rp1P56716 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rp1P56716 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rp1P56716 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rp1P56716 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rp1P56716 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rp1P56716 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rp1P56716 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rp1P56716 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rp1P56716 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rp1P56716 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rp1P56716 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rp1P56716 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rp1P56716 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rp1P56716 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rp1P56716 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rp1P56716 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rp1P56716 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rp1P56716 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rp1P56716 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rp1P56716 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rp1P56716 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rp1P56716 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rp1P56716 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rp1P56716 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Rp1P56716 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rp1P56716 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rp1P56716 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rp1P56716 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rp1P56716 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rp1P56716 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Rp1P56716 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rp1P56716 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Rp1P56716 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rp1P56716 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rp1P56716 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rp1P56716 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rp1P56716 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rp1P56716 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Rp1P56716 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Rp1P56716 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Rp1P56716 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rp1P56716 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rp1P56716 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rp1P56716 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rp1P56716 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Rp1P56716 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rp1P56716 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rp1P56716 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rp1P56716 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rp1P56716 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rp1P56716 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rp1P56716 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rp1P56716 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rp1P56716 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rp1P56716 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rp1P56716 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rp1P56716 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rp1P56716 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rp1P56716 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rp1P56716 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rp1P56716 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rp1P56716 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rp1P56716 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rp1P56716 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms