Protein–RNA interactions for Protein: P53999

SUB1, Activated RNA polymerase II transcriptional coactivator p15, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 127 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUB1P53999 STRAP-206ENST00000541731 1698 ntTSL 27.86□□□□□ -1.154e-7■■■■■ 84.4
SUB1P53999 STRAP-205ENST00000539887 676 ntTSL 22.13□□□□□ -2.074e-7■■■■■ 84.4
SUB1P53999 DYNC1H1-201ENST00000360184 14333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.861e-6■■■■■ 84
SUB1P53999 NUP37-209ENST00000552283 2372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.322e-13■■■■■ 83.9
SUB1P53999 NUP37-203ENST00000546385 577 ntTSL 25.28□□□□□ -1.562e-13■■■■■ 83.9
SUB1P53999 NUP37-201ENST00000251074 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.742e-13■■■■■ 83.9
SUB1P53999 NUP37-204ENST00000547269 798 ntTSL 23.37□□□□□ -1.872e-13■■■■■ 83.9
SUB1P53999 FMO5-205ENST00000527849 2410 ntTSL 513.84□□□□□ -0.192e-10■■■■■ 83.9
SUB1P53999 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.312e-10■■■■■ 83.9
SUB1P53999 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.522e-10■■■■■ 83.9
SUB1P53999 FMO5-202ENST00000369272 2168 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.342e-10■■■■■ 83.9
SUB1P53999 FMO5-203ENST00000441068 1696 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.422e-10■■■■■ 83.9
SUB1P53999 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.646e-11■■■■■ 83.5
SUB1P53999 CDC45-201ENST00000263201 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.716e-11■■■■■ 83.5
SUB1P53999 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.786e-11■■■■■ 83.5
SUB1P53999 CDC45-212ENST00000493724 469 ntTSL 29.87□□□□□ -0.836e-11■■■■■ 83.5
SUB1P53999 CDC45-203ENST00000407835 2090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.976e-11■■■■■ 83.5
SUB1P53999 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.591e-8■■■■■ 83.2
SUB1P53999 YWHAQ-202ENST00000381844 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.661e-8■■■■■ 83.2
SUB1P53999 DDB1-224ENST00000545894 2282 ntTSL 29.23□□□□□ -0.932e-13■■■■■ 82.8
SUB1P53999 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.22e-16■■■■■ 82.8
SUB1P53999 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.012e-16■■■■■ 82.8
SUB1P53999 ILKAP-204ENST00000463129 1861 ntTSL 214.59□□□□□ -0.072e-16■■■■■ 82.8
SUB1P53999 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.182e-16■■■■■ 82.8
SUB1P53999 ILKAP-202ENST00000450411 1024 ntTSL 212.68□□□□□ -0.382e-16■■■■■ 82.8
SUB1P53999 ILKAP-205ENST00000465131 750 ntTSL 210.87□□□□□ -0.672e-16■■■■■ 82.8
SUB1P53999 ILKAP-206ENST00000466468 2651 ntTSL 29.54□□□□□ -0.882e-16■■■■■ 82.8
SUB1P53999 ACTG1-212ENST00000576209 1698 ntTSL 1 (best)9.42□□□□□ -0.91e-42■■■■■ 82.6
SUB1P53999 CLTC-215ENST00000621829 8587 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.722e-8■■■■■ 82.6
SUB1P53999 CLTC-201ENST00000269122 7760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.272e-8■■■■■ 82.6
SUB1P53999 CLTC-209ENST00000498711 2941 ntTSL 1 (best)3.08□□□□□ -1.922e-8■■■■■ 82.6
SUB1P53999 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.352e-7■■■■■ 82.5
SUB1P53999 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.163e-7■■■■■ 82.5
SUB1P53999 NDUFAB1-203ENST00000562133 503 ntTSL 212.14□□□□□ -0.473e-7■■■■■ 82.5
SUB1P53999 NDUFAB1-202ENST00000484769 843 ntTSL 310.45□□□□□ -0.743e-7■■■■■ 82.5
SUB1P53999 HAT1-206ENST00000494601 3845 ntTSL 1 (best)8.22□□□□□ -1.092e-12■■■■■ 81.5
SUB1P53999 HAT1-203ENST00000412731 1567 ntTSL 1 (best)5.95□□□□□ -1.462e-12■■■■■ 81.5
SUB1P53999 HAT1-201ENST00000264108 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.842e-12■■■■■ 81.5
SUB1P53999 FBL-210ENST00000599159 1400 ntTSL 1 (best)16.68■□□□□ 0.267e-31■■■■■ 79.5
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SUB1P53999 FBL-203ENST00000594309 603 ntTSL 216.12■□□□□ 0.177e-31■■■■■ 79.5
SUB1P53999 FBL-208ENST00000598417 581 ntTSL 513.88□□□□□ -0.197e-31■■■■■ 79.5
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SUB1P53999 RPA2-203ENST00000373912 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.635e-24■■■■■ 79.5
SUB1P53999 RPA2-204ENST00000419958 554 ntTSL 34.84□□□□□ -1.635e-24■■■■■ 79.5
SUB1P53999 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.322e-12■■■■■ 79.3
SUB1P53999 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.432e-12■■■■■ 79.3
SUB1P53999 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.472e-12■■■■■ 79.3
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SUB1P53999 IMMT-204ENST00000410111 3001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.752e-16■■■■■ 79.3
SUB1P53999 IMMT-207ENST00000449247 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.882e-16■■■■■ 79.3
SUB1P53999 IMMT-202ENST00000409051 2515 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.912e-16■■■■■ 79.3
SUB1P53999 IMMT-206ENST00000442664 2627 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.082e-16■■■■■ 79.3
SUB1P53999 IMMT-201ENST00000254636 2613 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.342e-16■■■■■ 79.3
SUB1P53999 IMMT-205ENST00000419070 2172 ntTSL 55.87□□□□□ -1.472e-16■■■■■ 79.3
SUB1P53999 PGD-201ENST00000270776 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.77e-10■■■■■ 79.1
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SUB1P53999 RBBP7-206ENST00000425696 373 ntTSL 54.17□□□□□ -1.743e-11■■■■■ 77.1
SUB1P53999 RBBP7-201ENST00000330735 858 ntTSL 22.84□□□□□ -1.953e-11■■■■■ 77.1
SUB1P53999 ATP6AP1-210ENST00000619046 2823 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.813e-10■■■■■ 76.9
SUB1P53999 FAM162A-203ENST00000477892 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.126e-14■■■■■ 76.9
SUB1P53999 FAM162A-201ENST00000232125 801 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.756e-14■■■■■ 76.9
SUB1P53999 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.242e-7■■■■■ 76.8
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SUB1P53999 ATP5A1-209ENST00000589611 995 ntTSL 27.32□□□□□ -1.241e-9■■■■■ 76.8
SUB1P53999 ATP5A1-212ENST00000590324 807 ntTSL 57.29□□□□□ -1.241e-9■■■■■ 76.8
SUB1P53999 PCLAF-202ENST00000380258 911 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.715e-8■■■■■ 76.7
SUB1P53999 PCLAF-201ENST00000300035 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.765e-8■■■■■ 76.7
SUB1P53999 AC087632.1-210ENST00000635593 668 ntTSL 56.29□□□□□ -1.45e-8■■■■■ 76.7
SUB1P53999 AC087632.1-208ENST00000635511 920 ntTSL 55.82□□□□□ -1.485e-8■■■■■ 76.7
SUB1P53999 AC087632.1-205ENST00000635704 670 ntTSL 35.27□□□□□ -1.575e-8■■■■■ 76.7
SUB1P53999 AC087632.1-203ENST00000634318 1033 ntTSL 54.27□□□□□ -1.735e-8■■■■■ 76.7
SUB1P53999 AC087632.1-206ENST00000635605 757 ntTSL 53.47□□□□□ -1.855e-8■■■■■ 76.7
SUB1P53999 AC087632.1-207ENST00000634529 372 ntTSL 42.48□□□□□ -2.015e-8■■■■■ 76.7
SUB1P53999 AC087632.1-214ENST00000635320 568 ntTSL 42.47□□□□□ -2.015e-8■■■■■ 76.7
SUB1P53999 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.075e-8■■■■■ 76.7
SUB1P53999 FUS-204ENST00000483853 778 ntTSL 215.45■□□□□ 0.061e-10■■■■■ 76.5
SUB1P53999 MLH1-212ENST00000455445 2296 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.871e-23■■■■■ 75.7
SUB1P53999 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.776e-12■■■■■ 75.6
SUB1P53999 DCUN1D5-210ENST00000531571 1535 ntTSL 518.99■□□□□ 0.636e-12■■■■■ 75.6
SUB1P53999 DCUN1D5-207ENST00000529281 1310 ntTSL 213.15□□□□□ -0.36e-12■■■■■ 75.6
SUB1P53999 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.386e-12■■■■■ 75.6
SUB1P53999 DCUN1D5-203ENST00000527260 808 ntTSL 52.9□□□□□ -1.956e-12■■■■■ 75.6
SUB1P53999 TRAPPC4-213ENST00000533149 1340 ntTSL 28.66□□□□□ -1.022e-10■■■■■ 75.6
SUB1P53999 TRAPPC4-204ENST00000524797 1924 ntTSL 28.33□□□□□ -1.082e-10■■■■■ 75.6
SUB1P53999 TXNDC17-207ENST00000574734 616 ntTSL 315.18■□□□□ 0.022e-9■■■■■ 75.6
SUB1P53999 TXNDC17-206ENST00000574429 2100 nt12.11□□□□□ -0.472e-9■■■■■ 75.6
SUB1P53999 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.62e-9■■■■■ 75.6
SUB1P53999 TXNDC17-201ENST00000250101 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.682e-9■■■■■ 75.6
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