Protein–RNA interactions for Protein: P53999

SUB1, Activated RNA polymerase II transcriptional coactivator p15, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUB1P53999 STRAP-206ENST00000541731 1698 ntTSL 27.86□□□□□ -1.154e-7■■■■■ 84.4
SUB1P53999 STRAP-205ENST00000539887 676 ntTSL 22.13□□□□□ -2.074e-7■■■■■ 84.4
SUB1P53999 DYNC1H1-201ENST00000360184 14333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.861e-6■■■■■ 84
SUB1P53999 NUP37-209ENST00000552283 2372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.322e-13■■■■■ 83.9
SUB1P53999 NUP37-203ENST00000546385 577 ntTSL 25.28□□□□□ -1.562e-13■■■■■ 83.9
SUB1P53999 NUP37-201ENST00000251074 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.742e-13■■■■■ 83.9
SUB1P53999 NUP37-204ENST00000547269 798 ntTSL 23.37□□□□□ -1.872e-13■■■■■ 83.9
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SUB1P53999 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.312e-10■■■■■ 83.9
SUB1P53999 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.522e-10■■■■■ 83.9
SUB1P53999 FMO5-202ENST00000369272 2168 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.342e-10■■■■■ 83.9
SUB1P53999 FMO5-203ENST00000441068 1696 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.422e-10■■■■■ 83.9
SUB1P53999 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.646e-11■■■■■ 83.5
SUB1P53999 CDC45-201ENST00000263201 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.716e-11■■■■■ 83.5
SUB1P53999 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.786e-11■■■■■ 83.5
SUB1P53999 CDC45-212ENST00000493724 469 ntTSL 29.87□□□□□ -0.836e-11■■■■■ 83.5
SUB1P53999 CDC45-203ENST00000407835 2090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.976e-11■■■■■ 83.5
SUB1P53999 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.591e-8■■■■■ 83.2
SUB1P53999 YWHAQ-202ENST00000381844 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.661e-8■■■■■ 83.2
SUB1P53999 DDB1-224ENST00000545894 2282 ntTSL 29.23□□□□□ -0.932e-13■■■■■ 82.8
SUB1P53999 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.22e-16■■■■■ 82.8
SUB1P53999 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.012e-16■■■■■ 82.8
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SUB1P53999 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.182e-16■■■■■ 82.8
SUB1P53999 ILKAP-202ENST00000450411 1024 ntTSL 212.68□□□□□ -0.382e-16■■■■■ 82.8
SUB1P53999 ILKAP-205ENST00000465131 750 ntTSL 210.87□□□□□ -0.672e-16■■■■■ 82.8
SUB1P53999 ILKAP-206ENST00000466468 2651 ntTSL 29.54□□□□□ -0.882e-16■■■■■ 82.8
SUB1P53999 ACTG1-212ENST00000576209 1698 ntTSL 1 (best)9.42□□□□□ -0.91e-42■■■■■ 82.6
SUB1P53999 CLTC-215ENST00000621829 8587 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.722e-8■■■■■ 82.6
SUB1P53999 CLTC-201ENST00000269122 7760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.272e-8■■■■■ 82.6
SUB1P53999 CLTC-209ENST00000498711 2941 ntTSL 1 (best)3.08□□□□□ -1.922e-8■■■■■ 82.6
SUB1P53999 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.352e-7■■■■■ 82.5
SUB1P53999 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.163e-7■■■■■ 82.5
SUB1P53999 NDUFAB1-203ENST00000562133 503 ntTSL 212.14□□□□□ -0.473e-7■■■■■ 82.5
SUB1P53999 NDUFAB1-202ENST00000484769 843 ntTSL 310.45□□□□□ -0.743e-7■■■■■ 82.5
SUB1P53999 HAT1-206ENST00000494601 3845 ntTSL 1 (best)8.22□□□□□ -1.092e-12■■■■■ 81.5
SUB1P53999 HAT1-203ENST00000412731 1567 ntTSL 1 (best)5.95□□□□□ -1.462e-12■■■■■ 81.5
SUB1P53999 HAT1-201ENST00000264108 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.842e-12■■■■■ 81.5
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SUB1P53999 RPA2-204ENST00000419958 554 ntTSL 34.84□□□□□ -1.635e-24■■■■■ 79.5
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SUB1P53999 IMMT-207ENST00000449247 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.882e-16■■■■■ 79.3
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SUB1P53999 RBBP7-201ENST00000330735 858 ntTSL 22.84□□□□□ -1.953e-11■■■■■ 77.1
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SUB1P53999 FAM162A-203ENST00000477892 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.126e-14■■■■■ 76.9
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SUB1P53999 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.242e-7■■■■■ 76.8
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SUB1P53999 ATP5A1-209ENST00000589611 995 ntTSL 27.32□□□□□ -1.241e-9■■■■■ 76.8
SUB1P53999 ATP5A1-212ENST00000590324 807 ntTSL 57.29□□□□□ -1.241e-9■■■■■ 76.8
SUB1P53999 PCLAF-202ENST00000380258 911 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.715e-8■■■■■ 76.7
SUB1P53999 PCLAF-201ENST00000300035 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.765e-8■■■■■ 76.7
SUB1P53999 AC087632.1-210ENST00000635593 668 ntTSL 56.29□□□□□ -1.45e-8■■■■■ 76.7
SUB1P53999 AC087632.1-208ENST00000635511 920 ntTSL 55.82□□□□□ -1.485e-8■■■■■ 76.7
SUB1P53999 AC087632.1-205ENST00000635704 670 ntTSL 35.27□□□□□ -1.575e-8■■■■■ 76.7
SUB1P53999 AC087632.1-203ENST00000634318 1033 ntTSL 54.27□□□□□ -1.735e-8■■■■■ 76.7
SUB1P53999 AC087632.1-206ENST00000635605 757 ntTSL 53.47□□□□□ -1.855e-8■■■■■ 76.7
SUB1P53999 AC087632.1-207ENST00000634529 372 ntTSL 42.48□□□□□ -2.015e-8■■■■■ 76.7
SUB1P53999 AC087632.1-214ENST00000635320 568 ntTSL 42.47□□□□□ -2.015e-8■■■■■ 76.7
SUB1P53999 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.075e-8■■■■■ 76.7
SUB1P53999 FUS-204ENST00000483853 778 ntTSL 215.45■□□□□ 0.061e-10■■■■■ 76.5
SUB1P53999 MLH1-212ENST00000455445 2296 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.871e-23■■■■■ 75.7
SUB1P53999 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.776e-12■■■■■ 75.6
SUB1P53999 DCUN1D5-210ENST00000531571 1535 ntTSL 518.99■□□□□ 0.636e-12■■■■■ 75.6
SUB1P53999 DCUN1D5-207ENST00000529281 1310 ntTSL 213.15□□□□□ -0.36e-12■■■■■ 75.6
SUB1P53999 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.386e-12■■■■■ 75.6
SUB1P53999 DCUN1D5-203ENST00000527260 808 ntTSL 52.9□□□□□ -1.956e-12■■■■■ 75.6
SUB1P53999 TRAPPC4-213ENST00000533149 1340 ntTSL 28.66□□□□□ -1.022e-10■■■■■ 75.6
SUB1P53999 TRAPPC4-204ENST00000524797 1924 ntTSL 28.33□□□□□ -1.082e-10■■■■■ 75.6
SUB1P53999 TXNDC17-207ENST00000574734 616 ntTSL 315.18■□□□□ 0.022e-9■■■■■ 75.6
SUB1P53999 TXNDC17-206ENST00000574429 2100 nt12.11□□□□□ -0.472e-9■■■■■ 75.6
SUB1P53999 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.62e-9■■■■■ 75.6
SUB1P53999 TXNDC17-201ENST00000250101 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.682e-9■■■■■ 75.6
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