Protein–RNA interactions for Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,94■■■■□ 3,98
Cux1P53564 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39,93■■■■□ 3,98
Cux1P53564 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39,93■■■■□ 3,98
Cux1P53564 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,93■■■■□ 3,98
Cux1P53564 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC39,92■■■■□ 3,98
Cux1P53564 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39,91■■■■□ 3,98
Cux1P53564 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,9■■■■□ 3,98
Cux1P53564 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC39,85■■■■□ 3,97
Cux1P53564 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,84■■■■□ 3,97
Cux1P53564 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC39,84■■■■□ 3,97
Cux1P53564 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,83■■■■□ 3,97
Cux1P53564 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC39,82■■■■□ 3,97
Cux1P53564 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,82■■■■□ 3,96
Cux1P53564 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,82■■■■□ 3,96
Cux1P53564 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC39,8■■■■□ 3,96
Cux1P53564 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,8■■■■□ 3,96
Cux1P53564 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC39,79■■■■□ 3,96
Cux1P53564 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,77■■■■□ 3,96
Cux1P53564 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39,77■■■■□ 3,96
Cux1P53564 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,75■■■■□ 3,95
Cux1P53564 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC39,75■■■■□ 3,95
Cux1P53564 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,74■■■■□ 3,95
Cux1P53564 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC39,71■■■■□ 3,95
Cux1P53564 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC39,71■■■■□ 3,95
Cux1P53564 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,7■■■■□ 3,95
Cux1P53564 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,7■■■■□ 3,95
Cux1P53564 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,69■■■■□ 3,94
Cux1P53564 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC39,69■■■■□ 3,94
Cux1P53564 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39,68■■■■□ 3,94
Cux1P53564 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,66■■■■□ 3,94
Cux1P53564 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC39,65■■■■□ 3,94
Cux1P53564 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC39,64■■■■□ 3,94
Cux1P53564 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,64■■■■□ 3,94
Cux1P53564 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC39,63■■■■□ 3,93
Cux1P53564 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39,61■■■■□ 3,93
Cux1P53564 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39,6■■■■□ 3,93
Cux1P53564 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,6■■■■□ 3,93
Cux1P53564 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC39,55■■■■□ 3,92
Cux1P53564 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC39,55■■■■□ 3,92
Cux1P53564 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC39,54■■■■□ 3,92
Cux1P53564 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC39,54■■■■□ 3,92
Cux1P53564 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC39,54■■■■□ 3,92
Cux1P53564 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,53■■■■□ 3,92
Cux1P53564 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC39,52■■■■□ 3,92
Cux1P53564 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC39,52■■■■□ 3,92
Cux1P53564 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39,52■■■■□ 3,92
Cux1P53564 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC39,51■■■■□ 3,92
Cux1P53564 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39,51■■■■□ 3,92
Cux1P53564 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,51■■■■□ 3,92
Cux1P53564 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC39,48■■■■□ 3,91
Cux1P53564 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39,45■■■■□ 3,91
Cux1P53564 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39,45■■■■□ 3,91
Cux1P53564 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC39,45■■■■□ 3,91
Cux1P53564 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,44■■■■□ 3,9
Cux1P53564 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC39,44■■■■□ 3,9
Cux1P53564 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC39,43■■■■□ 3,9
Cux1P53564 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC39,43■■■■□ 3,9
Cux1P53564 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC39,43■■■■□ 3,9
Cux1P53564 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC39,41■■■■□ 3,9
Cux1P53564 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC39,4■■■■□ 3,9
Cux1P53564 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC39,39■■■■□ 3,9
Cux1P53564 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,39■■■■□ 3,9
Cux1P53564 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC39,39■■■■□ 3,9
Cux1P53564 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,38■■■■□ 3,9
Cux1P53564 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC39,37■■■■□ 3,89
Cux1P53564 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,37■■■■□ 3,89
Cux1P53564 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC39,34■■■■□ 3,89
Cux1P53564 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,33■■■■□ 3,89
Cux1P53564 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,31■■■■□ 3,88
Cux1P53564 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,3■■■■□ 3,88
Cux1P53564 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC39,3■■■■□ 3,88
Cux1P53564 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC39,29■■■■□ 3,88
Cux1P53564 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,28■■■■□ 3,88
Cux1P53564 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC39,28■■■■□ 3,88
Cux1P53564 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39,28■■■■□ 3,88
Cux1P53564 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,27■■■■□ 3,88
Cux1P53564 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,25■■■■□ 3,87
Cux1P53564 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC39,23■■■■□ 3,87
Cux1P53564 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,23■■■■□ 3,87
Cux1P53564 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC39,21■■■■□ 3,87
Cux1P53564 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC39,19■■■■□ 3,86
Cux1P53564 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC39,18■■■■□ 3,86
Cux1P53564 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,18■■■■□ 3,86
Cux1P53564 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC39,16■■■■□ 3,86
Cux1P53564 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39,16■■■■□ 3,86
Cux1P53564 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC39,15■■■■□ 3,86
Cux1P53564 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC39,14■■■■□ 3,86
Cux1P53564 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC39,1■■■■□ 3,85
Cux1P53564 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC39,09■■■■□ 3,85
Cux1P53564 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,08■■■■□ 3,85
Cux1P53564 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC39,06■■■■□ 3,84
Cux1P53564 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC39,04■■■■□ 3,84
Cux1P53564 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC39,04■■■■□ 3,84
Cux1P53564 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC39,04■■■■□ 3,84
Cux1P53564 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC39,04■■■■□ 3,84
Cux1P53564 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC39,03■■■■□ 3,84
Cux1P53564 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC39,03■■■■□ 3,84
Cux1P53564 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,02■■■■□ 3,84
Cux1P53564 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,02■■■■□ 3,84
Cux1P53564 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3,83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28,3 ms