Protein–RNA interactions for Protein: P51450

Rorc, Nuclear receptor ROR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RorcP51450 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RorcP51450 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RorcP51450 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RorcP51450 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RorcP51450 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RorcP51450 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RorcP51450 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RorcP51450 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RorcP51450 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RorcP51450 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RorcP51450 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RorcP51450 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RorcP51450 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RorcP51450 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RorcP51450 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RorcP51450 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RorcP51450 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RorcP51450 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RorcP51450 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RorcP51450 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RorcP51450 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RorcP51450 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RorcP51450 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RorcP51450 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RorcP51450 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RorcP51450 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RorcP51450 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RorcP51450 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RorcP51450 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RorcP51450 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RorcP51450 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RorcP51450 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RorcP51450 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RorcP51450 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RorcP51450 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RorcP51450 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RorcP51450 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RorcP51450 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RorcP51450 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RorcP51450 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RorcP51450 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RorcP51450 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RorcP51450 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RorcP51450 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RorcP51450 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RorcP51450 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RorcP51450 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RorcP51450 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RorcP51450 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RorcP51450 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RorcP51450 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RorcP51450 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RorcP51450 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RorcP51450 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RorcP51450 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RorcP51450 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RorcP51450 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RorcP51450 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RorcP51450 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RorcP51450 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RorcP51450 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RorcP51450 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RorcP51450 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RorcP51450 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RorcP51450 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RorcP51450 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RorcP51450 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RorcP51450 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RorcP51450 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RorcP51450 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RorcP51450 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RorcP51450 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RorcP51450 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RorcP51450 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RorcP51450 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RorcP51450 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RorcP51450 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RorcP51450 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RorcP51450 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RorcP51450 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RorcP51450 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RorcP51450 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RorcP51450 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RorcP51450 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RorcP51450 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RorcP51450 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RorcP51450 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RorcP51450 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RorcP51450 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RorcP51450 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RorcP51450 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RorcP51450 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RorcP51450 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RorcP51450 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RorcP51450 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RorcP51450 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RorcP51450 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RorcP51450 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RorcP51450 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RorcP51450 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms