Protein–RNA interactions for Protein: P50396

Gdi1, Rab GDP dissociation inhibitor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdi1P50396 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Gdi1P50396 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gdi1P50396 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gdi1P50396 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Gdi1P50396 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gdi1P50396 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gdi1P50396 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gdi1P50396 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gdi1P50396 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gdi1P50396 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gdi1P50396 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gdi1P50396 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gdi1P50396 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gdi1P50396 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gdi1P50396 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gdi1P50396 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gdi1P50396 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gdi1P50396 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Gdi1P50396 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Gdi1P50396 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Gdi1P50396 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gdi1P50396 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gdi1P50396 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gdi1P50396 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gdi1P50396 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gdi1P50396 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Gdi1P50396 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gdi1P50396 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gdi1P50396 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gdi1P50396 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gdi1P50396 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gdi1P50396 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gdi1P50396 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Gdi1P50396 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gdi1P50396 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gdi1P50396 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gdi1P50396 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gdi1P50396 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gdi1P50396 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gdi1P50396 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gdi1P50396 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gdi1P50396 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gdi1P50396 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gdi1P50396 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gdi1P50396 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gdi1P50396 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gdi1P50396 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gdi1P50396 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gdi1P50396 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Gdi1P50396 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gdi1P50396 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gdi1P50396 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gdi1P50396 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Gdi1P50396 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Gdi1P50396 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gdi1P50396 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gdi1P50396 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gdi1P50396 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gdi1P50396 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gdi1P50396 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gdi1P50396 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gdi1P50396 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gdi1P50396 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gdi1P50396 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gdi1P50396 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gdi1P50396 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gdi1P50396 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gdi1P50396 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gdi1P50396 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gdi1P50396 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gdi1P50396 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gdi1P50396 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gdi1P50396 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gdi1P50396 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gdi1P50396 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gdi1P50396 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gdi1P50396 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gdi1P50396 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gdi1P50396 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gdi1P50396 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gdi1P50396 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gdi1P50396 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gdi1P50396 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gdi1P50396 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gdi1P50396 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gdi1P50396 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gdi1P50396 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gdi1P50396 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gdi1P50396 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gdi1P50396 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Gdi1P50396 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gdi1P50396 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gdi1P50396 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gdi1P50396 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gdi1P50396 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gdi1P50396 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Gdi1P50396 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gdi1P50396 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gdi1P50396 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gdi1P50396 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms